FeS@SRB的制备与表征
验证SRB能够通过生物矿化在表面原位合成FeS纳米颗粒,并优化制备条件
将驯化的SRB在含Fe2+的培养基中培养,通过SEM、DLS、XRD、XPS等表征FeS@SRB的形成、结构和性质。
Living therapeutics of nonpathogenic bacteria as biosynthesis factory and active carriers for enhancing tumor-targeted therapy.
包含体外细胞实验、皮下及原位肿瘤模型、RNA-seq转录组分析、体内靶向与生物安全性评估等多层级验证,并明确功能与机制验证。
4T1小鼠乳腺癌细胞系 B16F10小鼠黑色素瘤细胞系 4T1皮下肿瘤小鼠模型 B16F10皮下肿瘤小鼠模型 4T1原位乳腺癌小鼠模型
SRB菌株来源(胜利油田)及驯化条件 FeS@SRB制备条件(初始Fe2+浓度200 mg L−1,37°C培养48小时) 静脉注射剂量(1×10^7 CFU mL−1) 808 nm激光照射参数(1.5 W cm−2,5分钟) 小鼠模型(雌性BALB/c和C57BL/6,6-8周龄)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SRB能够通过生物矿化在表面原位合成FeS纳米颗粒,并优化制备条件
将驯化的SRB在含Fe2+的培养基中培养,通过SEM、DLS、XRD、XPS等表征FeS@SRB的形成、结构和性质。
验证FeS@SRB在NIR激光下的光热转换能力和酸性条件下Fenton反应产生活性氧的能力
测量不同浓度和激光功率下的温度变化,计算光热转换效率;使用MB、TMB探针和ESR检测•OH生成。
评估FeS@SRB对肿瘤细胞的杀伤效果并探究其分子机制
将4T1和B16F10细胞与FeS@SRB共培养,检测细胞活力;对4T1细胞进行RNA-seq分析差异表达基因和通路。
验证FeS@SRB的乏氧趋化性和对肿瘤球的穿透能力
利用Transwell构建乏氧模型,观察FeS@SRB迁移;将FITC标记的FeS@SRB与3D肿瘤球共培养,通过共聚焦显微镜观察穿透深度。
验证FeS@SRB在体内的肿瘤靶向能力及分布
构建皮下4T1肿瘤模型,静脉注射IR780标记的SRB、FeS@BSA和FeS@SRB,通过活体成像观察肿瘤部位荧光强度,并通过平板计数和革兰染色分析细菌分布。
评估FeS@SRB联合NIR激光在皮下和原位肿瘤模型中的治疗效果
在4T1皮下、B16F10皮下和4T1原位模型中,静脉注射不同处理后,于48小时进行NIR照射,测量肿瘤体积、体重,并通过H&E、TUNEL、Ki67染色评估肿瘤细胞凋亡和增殖。
评估SRB和FeS@SRB的体外和体内生物相容性
通过细胞活力、溶血、凝血实验评估体外安全性;对正常小鼠静脉注射SRB,监测体重、血常规、肝肾功能、炎症因子和组织病理学。
评估FeS@SRB联合NIR治疗对抗肿瘤免疫应答的影响
在处理后48小时收集TDLNs和肿瘤组织,通过流式细胞术检测DC成熟和T细胞浸润,并检测血清中细胞因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 材料准备 | 乳酸钠 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- |
| 硫酸钠 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- | |
| 七水合硫酸亚铁 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- | |
| 抗坏血酸 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- | |
| 磷酸氢二钾 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- | |
| 亚甲基蓝 | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | -- | |
| EDC | Macklin Biochemical Co., Ltd | -- | |
| NHS | Macklin Biochemical Co., Ltd | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Macklin Biochemical Co., Ltd | -- | |
| 酵母提取物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DMPO | DOJINDO | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Wuhan Pricella Biotechnology Co., Ltd., China | -- |
| 代谢分析 | 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute, China | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | GlpBio Technology (USA) | -- |
| 体内成像 | IR780 | MedChemExpress (USA) | -- |
| 荧光标记 | 异硫氰酸荧光素 | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd | -- |
| 显微观察 | 扫描电子显微镜(TESCAN MIRA) | TESCAN, Czech | -- |
| 粒度分析 | 动态光散射仪(BeNano180Zeta) | -- | -- |
| 光谱分析 | 紫外-可见-近红外分光光度计(UV-2600) | Shimadzu, Japan | -- |
| 红外光谱 | 傅里叶变换红外光谱仪(VERTEX 70) | Bruker, Germany | -- |
| 晶体结构分析 | X射线粉末衍射仪(SmartLab-SE) | Rigaku, Japan | -- |
| 元素分析 | X射线光电子能谱仪(Axis Ultra DLD-600 W) | Shimadzu, Japan | -- |
| ICP-OES | 电感耦合等离子体发射光谱仪(ICPA7200) | Thermofisher, Germany | -- |
| EPR | 电子顺磁共振波谱仪(EMXmicro-6/1) | -- | -- |
| 共聚焦显微镜 | 激光共聚焦扫描显微镜(FV1200) | OLYMPUS, Japan | -- |
| 活体成像 | 活体成像系统(Tanon ABL-X5) | Tanon, China | -- |
| 活体成像系统(GelView6000pro II) | -- | -- | |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 组织学 | DAPI | bioship | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Servicebio | G3013 |
| RNA测序 | DNBSEQ-T7RS高通量测序试剂盒(FCL PE150)V2.0 | -- | -- |
| 荧光染色 | 二氢乙啶 | Sigma-Aldrich | D7008 |
| 免疫分析 | CD80抗体 | Elabscience | E-AB-F0992E |
| CD86抗体 | Elabscience | E-AB-F0994D | |
| CD11c抗体 | Elabscience | E-AB-F0991C | |
| CD8抗体 | Elabscience | E-AB-F1104E | |
| CD4抗体 | Elabscience | E-AB-F1353C | |
| CD3抗体 | Elabscience | E-AB-F1013D | |
| 组织学 | TUNEL试剂盒(货号GB1502,Servicebio) | Servicebio | GB1502 |
| Ki67抗体(货号GB111499,Servicebio) | Servicebio | GB111499 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| FeS@SRB制备 | SRB菌株来源和驯化次数;初始Fe2+浓度(200 mg L−1);培养时间(48小时)和温度(37°C) 阅读提示:Methods部分的“SRB domestication”和“Biosynthesis of FeS@SRB” |
| 体外细胞实验 | 细胞系(4T1、B16F10等)和培养基;FeS@SRB浓度(OD600=0.1);共培养时间(24小时);NIR照射参数(808 nm,1.5 W cm−2,10分钟) 阅读提示:Methods部分的“Cell culture”和“Cytotoxicity assessment of FeS@SRB” |
| 体内肿瘤模型 | 小鼠品系和性别(雌性BALB/c或C57BL/6);肿瘤细胞接种数量(2×10^6);肿瘤体积达到~100 mm3时开始治疗 阅读提示:Methods部分的“Antitumor effects of FeS@SRB-based therapy”等 |
| NIR照射条件 | 激光波长(808 nm)、功率密度(1.5 W cm−2)、照射时间(5分钟)、照射时间点(注射后48小时) 阅读提示:Results章节中多个实验的Figure legends |
| 靶向效率评估 | IR780标记方法(0.5 mg mL−1,37°C 15分钟);静脉注射剂量(1×10^7 CFU mL−1);成像时间点(至96小时) 阅读提示:Methods部分的“Evaluation of tumor-targeting ability of FeS@SRB in vivo” |
| 生物安全性评估 | 正常小鼠静脉注射SRB剂量(1×10^7 CFU mL−1);观察时间(至40天);血常规、肝肾功能指标 阅读提示:Methods部分的“Biosafety evaluation of SRB in vivo” |