验证ACSS2在ALD模型中下调
确认酒精对肝ACSS2表达的影响及临床相关性
检测ALD患者和酒精喂养小鼠血清和肝组织乙酸盐水平及ACSS2表达;使用免疫组化、免疫荧光、Western blot和qPCR检测ACSS2蛋白和mRNA水平。
ACSS2 protects against alcohol-induced hepatocyte ferroptosis through regulation of hepcidin expression.
体外细胞模型、小鼠体内模型(Acss2-HKO、AAV过表达)及临床样本;包含铁代谢、铁死亡及机制验证(Co-IP、ChIP-qPCR)。
Acss2-HKO小鼠酒精性肝病模型(Lieber-DeCarli乙醇液体饲料喂养) AML12小鼠肝细胞系 小鼠原代肝细胞 酒精性肝病患者血清和肝组织样本
ACSS2在肝细胞中的表达下调(酒精处理) HAMP1/2表达调控及铁代谢相关基因变化 铁死亡标志物(脂质过氧化、GSH、ROS)检测 体内实验中ACSS2过表达或HAMP1/2过表达的恢复效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认酒精对肝ACSS2表达的影响及临床相关性
检测ALD患者和酒精喂养小鼠血清和肝组织乙酸盐水平及ACSS2表达;使用免疫组化、免疫荧光、Western blot和qPCR检测ACSS2蛋白和mRNA水平。
评估肝细胞ACSS2缺失对酒精性肝损伤和炎症的影响
使用CRISPR/Cas9生成Acss2-HKO小鼠,进行短时(10天+1次灌胃)和4周慢性酒精喂养,检测肝脏重量、血清ALT/AST、肝组织TG/TC/FFA、组织学染色和炎症因子表达。
确定ACSS2是否通过调节铁代谢影响ALD
进行RNA-seq,GO分析突出铁代谢通路;检测HAMP1/2、FPN、TFRC等表达;测量血清和肝组织hepcidin、铁含量;普鲁士蓝染色显示组织铁沉积。
验证ACSS2缺失是否促进酒精诱导的肝细胞铁死亡
测量GSH、SOD、ROS水平;使用C11-BODIPY、DHE染色检测脂质过氧化和ROS;靶向氧化脂质组学;透射电镜观察线粒体超微结构;PI染色和CCK-8检测细胞死亡。
评估恢复ACSS2表达是否减轻酒精诱导的肝损伤和铁死亡
使用AAV8-Acss2通过尾静脉注射过表达肝细胞ACSS2,进行酒精喂养模型,检测肝损伤、炎症、铁代谢和铁死亡指标。
证实ACSS2通过组蛋白乙酰化调控HAMP1/2转录
Western blot检测H3/H4乙酰化;Co-IP检测ACSS2与CBP结合;免疫荧光共定位;ChIP-qPCR检测CBP和组蛋白乙酰化在HAMP1/2启动子的富集。
验证HAMP1/2和铁死亡在ACSS2缺失效应中的作用
AAV-Hamp1/2过表达或使用铁死亡抑制剂Fer-1、铁螯合剂DFO等处理,观察对肝损伤和铁死亡的缓解。
验证ACSS2/乙酸盐与铁代谢的临床相关性
检测ALD患者血清乙酸盐、hepcidin和铁水平,进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养 | DMEM(杜尔贝科改良鹰培养基) | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| RNA提取和qPCR | HiScript II 第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- |
| AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | -- | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 试剂 | IV型胶原酶 | -- | -- |
| 细胞分离 | Percoll分离液 | -- | -- |
| EGTA | -- | -- | |
| 细胞分离和培养 | 磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 组织染色 | 油红O | -- | -- |
| 伊红 | -- | -- | |
| DAB显色剂 | -- | -- | |
| 铁染色 | 普鲁士蓝铁染色试剂盒 | Solarbio | G1429 |
| 组织分析 | ZEISS Scope A1显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
| 荧光成像 | 共聚焦激光显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
| 检测ROS | 二氢乙啶 | Yeasen | 50102ES02 |
| 检测脂质过氧化 | BODIPY 581/591 C11 | MedChemExpress | HY-D1301 |
| ChIP | SimpleChIP Plus酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| 共免疫沉淀 | Pierce抗DYKDDDDK磁珠琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Pierce抗HA磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 生化检测 | 自动生化分析仪 | Hitachi High-tech Corporation | -- |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04741m |
| IL-1β ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04639m | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Ruixinbio | SYP-M1543 | |
| 铁调素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0671 | |
| 乙酰辅酶A ELISA试剂盒 | JINGMEI BIOTECHNOLOGY | JM-11689M2 | |
| 生化检测 | 乙醇检测试剂盒 | Ruixinbio | RXWB0248 |
| 乙醛检测试剂盒 | Ruixinbio | RXWB0251 | |
| 乙酸盐检测试剂盒 | BioAssay Systems | EOAC-100 | |
| 肝组织检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Abbkine | KTB2200 |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Abbkine | KTB2220 | |
| 游离脂肪酸检测试剂盒 | Ruixinbio | RXWB0836 | |
| 丙二醛检测试剂盒 | Beyotime | S0131SB | |
| 谷胱甘肽检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A006-2-1 | |
| 脂质过氧化物检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A106-1-3 | |
| 超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Ruixinbio | RXWB0477 | |
| 活性氧检测试剂盒 | Ruixinbio | HR8835 | |
| 铁检测 | 总铁比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K772-M |
| 组织铁检测 | 非血红素铁检测试剂盒 | LEAGENE | TC1000 |
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | -- | -- |
| 重组铁调素-2 | Tsingke Biotech | -- | |
| ACSS2抑制剂 | ACSS2抑制剂 | -- | -- |
| 测序平台 | Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 质谱分析 | ACQUITY Premier超高效液相色谱系统 | Waters | -- |
| ACQUITY UPLC BEH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| SCIEX Triple Quad 6500+三重四极杆质谱仪 | SCIEX | -- | |
| 电镜 | LEICA EM UC7超薄切片机 | Leica | -- |
| 细胞培养 | AML12细胞完全培养基 | Procell | -- |
| MODE-K细胞 | Otwo Biotech | -- | |
| RAW264.7细胞 | American Type Culture Collection | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别(雌性)、年龄(8-10周)、ACSS2敲除方法(Alb-Cre)、酒精喂养时间(10天+灌胃)、乙醇浓度(5%)和灌胃剂量(5 g/kg) 阅读提示:Methods: Mice, Alcoholic liver disease (ALD) model |
| 细胞实验 | AML12细胞培养条件(DMEM/10%FBS)、乙醇处理浓度(400 mM)、siRNA转染序列和转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX) 阅读提示:Methods: Cell lines, Small-interfering RNA transfection |
| 铁代谢检测 | 血清hepcidin和铁离子检测试剂盒、组织铁含量检测方法(非血红素铁检测试剂盒)及样本处理 阅读提示:Methods: Mouse serum assay, Measurements of serum iron and tissue non-heme iron |
| 铁死亡检测 | GSH、MDA、SOD、ROS检测试剂盒及肝脏组织处理方法、BODIPY C11和DHE染色条件 阅读提示:Methods: Mouse tissue assay, DHE and BODIPY 581/591 C11 staining |
| 表观遗传机制 | Co-IP实验抗体(ACSS2、CBP)和磁珠、ChIP-qPCR抗体(CBP、H3K9ac、H4K8ac)及引物序列 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP), Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-qPCR |
| 体内回补实验 | AAV8-TBG-Acss2或AAV8-Hamp1/2注射剂量和途径(尾静脉)、给药时间(酒精喂养前2周)、Fer-1和重组hepcidin的给药剂量和途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods: Generation of hepatocyte-specific ACSS2 or Hamp1/2 overexpression mice, Ferrostatin-1 and recombinant hepcidin-2 administration |