验证CLEC7A在OSCC中的表达
明确CLEC7A在OSCC组织和细胞系中的表达水平及其与M2巨噬细胞标志物的相关性。
利用GEPIA数据库分析CLEC7A表达,RT-qPCR和western blot检测临床样本和细胞系中CLEC7A表达,并分析与CD163、MRC1的相关性。
Transcription factor SP1 drives the malignant progression of oral squamous cell carcinoma and M2 macrophage polarization through transcription activation-mediated upregulation CLEC7A.
包含临床样本、细胞系体外、共培养以及小鼠异种移植瘤体内等多个独立证据层级,并进行了功能和对机制的验证。
口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞系SCC-4和SCC-25 人正常口腔角质形成细胞HOK 小鼠异种移植瘤模型(SCC-4细胞皮下注射裸鼠) 人单核细胞THP-1诱导的M0巨噬细胞
OSCC组织和细胞系中CLEC7A和SP1的表达水平(RT-qPCR、western blot) CLEC7A敲低对OSCC细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭及M2巨噬细胞极化的影响(集落形成、流式、Transwell) SP1与CLEC7A启动子结合及转录激活(ChIP、双荧光素酶报告基因) SP1敲低对体内肿瘤生长及M2巨噬细胞标志物的影响(裸鼠移植瘤、RT-qPCR、IHC)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确CLEC7A在OSCC组织和细胞系中的表达水平及其与M2巨噬细胞标志物的相关性。
利用GEPIA数据库分析CLEC7A表达,RT-qPCR和western blot检测临床样本和细胞系中CLEC7A表达,并分析与CD163、MRC1的相关性。
确定CLEC7A缺失对OSCC细胞体外恶性行为和M2巨噬细胞极化的影响。
用shCLEC7A转染SCC-4和SCC-25细胞,检测增殖、凋亡、迁移、侵袭,并与THP-1-M0共培养检测M2标志物。
验证SP1是否直接结合CLEC7A启动子并激活其转录。
JASPAR预测结合位点,ChIP实验验证结合,双荧光素酶报告基因检测转录激活,并检测SP1敲低对CLEC7A表达的影响。
验证SP1过表达对OSCC细胞恶性行为和M2极化的促进作用。
过表达SP1后检测细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭,并与THP-1-M0共培养检测M2标志物。
确认SP1的功能依赖CLEC7A。
共转染shSP1和oeCLEC7A,检测细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭及M2极化指标。
验证SP1敲低在体内对OSCC肿瘤生长和M2极化的抑制作用。
将shSP1或shNC转染的SCC-4细胞皮下注射至裸鼠,监测肿瘤生长,并检测肿瘤组织中CLEC7A、SP1、Ki67、CD206、ARG1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 角质形成细胞生长培养基 | Procell | CM-H382 |
| DMEM/F12培养基 | Elisakits | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 氢化可的松 | Elisakits | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme | -- |
| RT-qPCR | Maxima H Minus cDNA合成预混液试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Power SYBR Green预混液 | Invitrogen | -- | |
| ABI7900HT快速实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | CST | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗CLEC7A抗体 | Abcam | ab140039 | |
| 抗SP1抗体 | Abcam | ab231778 | |
| 抗RHOA抗体 | CST | 2117 | |
| 抗RAC1抗体 | CST | 4651 | |
| 抗E-cadherin抗体 | CST | 3195 | |
| 抗Vimentin抗体 | CST | 3932 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| ECL化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| 细胞转染 | pLKO.1载体 | Addgene | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC | KeyGEN BioTECH | -- |
| 碘化丙啶 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| FITC偶联抗人CD11b抗体 | Beyotime | -- | |
| APC偶联抗人CD206抗体 | -- | -- | |
| THP-1分化 | 佛波醇肉豆蔻酸乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9005 |
| 双荧光素酶报告基因 | Gv238荧光素酶报告载体 | Genechem | -- |
| 细胞培养 | 人正常口腔角质形成细胞 | Procell | CP-H382 |
| SCC-25细胞系 | Procell | CL-0569 | |
| SCC-4细胞系 | Elisakits | CC-Y1750 | |
| THP-1细胞系 | Procell | CL-0233 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 样本数量(58对)、来源(First Hospital of Qiqihar)、患者术前是否接受放化疗(未接受) 阅读提示:Materials and methods - Clinical samples and cell culture |
| 细胞培养 | 细胞系(SCC-4、SCC-25、HOK、THP-1)及培养基、血清浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods - Clinical samples and cell culture |
| 细胞转染 | shRNA和过表达质粒、转染方法(慢病毒)、筛选浓度(4 μg/mL puromycin) 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| 功能实验 | 集落形成(500细胞/孔,14天)、凋亡(Annexin V/PI)、迁移(5×10^4细胞)、侵袭(1×10^5细胞,matrigel) 阅读提示:Materials and methods - Colony formation assay, Flow cytometry for cell apoptosis, Transwell assay |
| 巨噬细胞极化实验 | THP-1分化(100 ng/mL PMA,24h)、共培养比例(1:1)、时间(8h)、检测指标(CD11b+CD206+、ARG1、IL-10) 阅读提示:Materials and methods - Flow cytometry |
| SP1-CLEC7A结合验证 | JASPAR预测位点、ChIP抗体(anti-SP1)、双荧光素酶报告基因(启动子序列) 阅读提示:Materials and methods - Chromatin immunoprecipitation (ChIP), Dual-luciferase reporter assay |
| 体内实验 | 小鼠品系(雄性裸鼠)、年龄(5-6周)、细胞数量(2×10^6)、每组数量(6只)、肿瘤测量时间点(5,10,15,20,25天) 阅读提示:Materials and methods - Mouse xenograft model |