验证SIC-19对SIK2表达的抑制及DNA损伤诱导
确定SIC-19在TNBC和PC细胞中是否抑制SIK2并诱导DNA损伤
用不同浓度SIC-19处理细胞48小时,通过Western blot检测SIK2和γH2AX蛋白水平,通过免疫荧光检测γH2AX焦点形成。
SIK2 inhibitor SIC-19 enhances the sensitivity of PARP inhibitors in triple-negative breast cancers and pancreatic cancers.
包含体外细胞实验(CCK8、克隆形成、凋亡、彗星实验、HR报告基因)和体内异种移植瘤模型,并验证了DNA损伤和HR修复机制。
TNBC细胞系MDA-MB-231和HCC1806 PC细胞系BXPC3和PANC1 MDA-MB-231皮下异种移植瘤裸鼠模型
SIC-19处理浓度(1-8μM)和时间(48h) PARP抑制剂Olaparib和Niraparib的浓度 联合处理浓度(Olaparib 10μM,SIC-19 4μM) 体内给药剂量(SIC-19 40mg/kg,Olaparib 50mg/kg,每周5次,共4周) 细胞系SIK2表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SIC-19在TNBC和PC细胞中是否抑制SIK2并诱导DNA损伤
用不同浓度SIC-19处理细胞48小时,通过Western blot检测SIK2和γH2AX蛋白水平,通过免疫荧光检测γH2AX焦点形成。
探究SIC-19是否抑制HR修复及其对RAD50磷酸化的作用
用Lipofectamine 3000转染pDR-GFP和pCBASceI质粒,流式细胞术检测GFP阳性比例;用MMS诱导DNA损伤后,Western blot检测RAD50和p-RAD50-S635水平。
评估SIC-19联合Olaparib或Niraparib对细胞活力、克隆形成、凋亡和DNA损伤的影响
使用CCK8检测细胞活力(96小时),克隆形成实验(10天),Annexin V-PI流式细胞术(72小时),彗星实验(72小时)。
评估SIC-19联合Olaparib在MDA-MB-231异种移植瘤模型中的抗肿瘤效果
将MDA-MB-231细胞皮下接种至裸鼠,随机分四组,口服给药(vehicle、SIC-19、Olaparib、联合),每7天记录肿瘤体积,35天后处死,取肿瘤组织进行IHC检测γH2AX和Ki67。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 奥拉帕利 | APExBIO | A4154 |
| 尼拉帕利 | APExBIO | A3617 | |
| SIC-19 | American ChemBridge Compound Library | -- | |
| 细胞活力测定 | CCK8试剂 | APExBIO | K1018 |
| 彗星实验 | 彗星实验试剂盒 | TREVIGEN | 4250-050-K |
| Western blot | SIK2抗体 | Cell Signaling Technology | 6919 |
| γH2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 2577S | |
| RAD50抗体 | Cell Signaling Technology | 3427 | |
| Phospho-Rad50 (Ser635)抗体 | Cell Signaling Technology | 74778 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 抗小鼠IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| HR报告基因实验 | pDR-GFP质粒 | Addgene | 26475 |
| pCBASce-I质粒 | Addgene | 26477 | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Pricella | 164210-50 |
| 青霉素/链霉素 | Basalmedia | C100C5 | |
| RPMI 1640培养基 | Basalmedia | K211216 | |
| DMEM培养基 | Basalmedia | L211206 | |
| 细胞活力测定 | 酶标仪 | Biotek | SYNERGY |
| 克隆形成实验 | 4%甲醛 | Servicebio | G1101 |
| 结晶紫溶液 | -- | -- | |
| ImageJ软件 | NIH | 1.8.0 | |
| 彗星实验 | 低熔点琼脂糖 | LMAI Bio | LM81351CA |
| GelRed核酸染料 | Biotium | 41002 | |
| 荧光显微镜 | Felle Precision Instrument | FPTRI-IX-51-2 | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | Elabscience | E-CK-A211 |
| 碘化丙啶 | Elabscience | E-CK-A211 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013D |
| PVDF膜 | Epizyme | WJ002 | |
| ECL检测试剂盒 | Thermo Fisher | 32109 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | biosharp | 21288506 |
| 牛血清白蛋白 | Macklin | A850221 | |
| 抗兔山羊IgG | Invitrogen | 35552 | |
| DAPI | Cell Signaling Technology | 4083S | |
| 蔡司显微镜 | Carl Zeiss | LSM980 | |
| 免疫组化 | 二甲苯 | zzstandard | ZB-092105 |
| 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Ki67抗体 | Sigma | SAB4501880 | |
| HRP标记兔二抗 | ImmunoWay | RS0046 | |
| DAB+显色剂 | Millipore | 71897 | |
| 显微镜 | Olympus Corporation | CX33-LV2000 | |
| HR报告基因实验 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000-015 |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | GemPharmatech Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(RPMI 1640或DMEM)、血清浓度(10%FBS)、青霉素/链霉素浓度(1:100) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| 药物处理 | SIC-19处理浓度(4μM)和时间(72小时),Olaparib(10μM)和Niraparib浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assay, Figure legends |
| 细胞活力测定(CCK8) | 细胞接种密度(5000细胞/孔)、药物处理时间(96小时)、CCK8孵育时间(1-4小时)、检测波长(450nm) 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assay |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(2000细胞/孔)、药物处理时间(10天)、固定和染色条件 阅读提示:Materials and Methods: Clonogenic assays |
| 凋亡检测 | 药物处理时间(72小时)、Annexin V-FITC和PI用量 阅读提示:Materials and Methods: Cell apoptosis analysis |
| 彗星实验 | 药物处理时间(72小时)、细胞与琼脂糖比例(1:10)、电泳电压(21V)和时间(30分钟) 阅读提示:Materials and Methods: Comet assay |
| HR报告基因实验 | 转染试剂(Lipofectamine 3000)、质粒(pDR-GFP和pCBASceI)、细胞密度(10^5细胞/孔)、SIC-19处理时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods: HR reporter assay |
| 异种移植模型 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、细胞接种数量(1×10^7)、给药剂量(SIC-19 40mg/kg,Olaparib 50mg/kg,每周5次)、给药周期(4周)、测量频率(每周) 阅读提示:Materials and Methods: Mouse xenograft model and treatment, Figure 5 |