建立脓毒症模型并评估EZH1缺陷的生存获益
验证EZH1缺陷是否提高致死性脓毒症的生存率并减轻肝损伤。
构建CLP脓毒症模型和LPS内毒素血症模型,比较WT和Ezh1−/−小鼠的生存率、肝功能(ALT/AST)和肝脏组织学(H&E染色)。
EZH1 deficiency promotes ferroptosis resistance by activating NRF2 in sepsis-associated liver injury.
包含体内CLP和LPS模型、体外AML12细胞模型、CUT&RUN测序、功能验证(CCK8、流式)及机制验证(NRF2抑制剂逆转)。
小鼠CLP脓毒症模型 小鼠LPS内毒素血症模型 AML12小鼠正常肝细胞系
Ezh1−/−小鼠(C57BL/6N背景,Cyagen Biosciences,品系号KOCMP-14055-Ezh1-B6N) CLP模型:结扎75%盲肠,18号针穿刺 LPS模型:腹腔注射25 mg/kg LPS (O111:B4) 体外:AML12细胞,LPS 100 ng/ml,DS3201 5 nM,ML385(浓度文中未明确说明) 检测:ALT/AST、铁染色、MDA、GSH、CUT&RUN、Western blot
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证EZH1缺陷是否提高致死性脓毒症的生存率并减轻肝损伤。
构建CLP脓毒症模型和LPS内毒素血症模型,比较WT和Ezh1−/−小鼠的生存率、肝功能(ALT/AST)和肝脏组织学(H&E染色)。
检测EZH1缺陷是否减轻脓毒症小鼠肝脏铁死亡。
通过PI染色、透射电镜、铁染色、Fe2+含量、MDA和GSH水平,以及Western blot和qPCR检测铁死亡相关蛋白和基因(GPX4、xCT、COX2)。
验证EZH1缺陷是否通过表观遗传调控NFE2L2表达。
用CUT&RUN测序检测肝脏中Nfe2l2启动子H3K27me3富集,用qRT-PCR和Western blot检测NRF2 mRNA和蛋白表达,以及核转位。
验证EZH1抑制剂DS3201在体外是否抑制铁死亡,并确认NRF2的介导作用。
用LPS处理AML12细胞,加入DS3201和/或ML385,检测细胞活力(CCK8)、ROS、细胞死亡(7-AAD)、线粒体膜电位(JC-1)、脂质过氧化(C11 BODIPY)以及铁死亡相关蛋白和基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Ezh1基因敲除小鼠 | Cyagen Biosciences | KOCMP-14055-Ezh1-B6N |
| 异氟烷 | -- | -- | |
| 脂多糖(O111:B4) | Sigma-Aldrich | 32160405 | |
| 肝损伤检测 | ALT检测试剂盒 | Jiancheng | C0092-1 |
| AST检测试剂盒 | Jiancheng | C010-2-1 | |
| 碘化丙啶 | Keygen Biotech | KGA214 | |
| OCT包埋剂 | SAKURA | 4583 | |
| 显微镜观察 | LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | LSM880 |
| 电镜 | HT-7500透射电子显微镜 | Phenom Pharos G2 | -- |
| 氧化还原指标检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0131S |
| 还原型谷胱甘肽检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A006-2-1 | |
| 组织铁检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-BC-K773-M | |
| CUT&RUN测序 | EpiTM CUT&RUN检测试剂盒 | Epibiotek | R1816 |
| EpiTM DNA纯化磁珠 | Epibiotek | R1809 | |
| QIAseq超低起始量文库构建试剂盒 | QIAGEN | 180495 | |
| 细胞培养 | AML12细胞系 | Procell Life Science&Technology | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| Erastin | MCE | HY-15763 | |
| Ferrostatin-1 | MCE | HY-15763 | |
| DS3201 | MCE | HY-109108 | |
| ML385 | MCE | HY-100523 | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂盒 | Dojindo Laboratories | CK04 |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime Biotechnology | S0033S |
| C11 BODIPY 581/591荧光探针 | ABclonal Technology | RM02821 | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1荧光探针 | MCE | HY-K0601 |
| 细胞死亡检测 | 7-AAD染料 | Jiangsu Keygen Biotech | KGA219 |
| RNA提取与qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| SuperScript III第一链合成系统 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗EZH1抗体 | Abcam | EPR25352-1 | |
| 抗H3K27me3抗体 | Abcam | mAbcam 6002 | |
| 抗Histone H3抗体 | Abcam | ab18521 | |
| 抗β-Actin抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 抗COX2抗体 | Abcam | RM1026 | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | EPNCIR144 | |
| 抗NRF2抗体 | CST | #12721 | |
| 抗xCT抗体 | Abcam | EPR8290 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记二抗 | CST | 7076 | |
| 抗兔IgG HRP标记二抗 | CST | 7074 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脓毒症模型 | CLP模型:结扎75%盲肠,18号针穿刺;LPS模型:25 mg/kg腹腔注射;小鼠周龄、性别(6-8周龄雄性) 阅读提示:详见主要方法中“动物与模型”部分 |
| Ezh1−/−小鼠 | 遗传背景C57BL/6N,基因敲除来源(Cyagen Biosciences, KOCMP-14055-Ezh1-B6N) 阅读提示:详见主要方法中“动物与模型”部分 |
| 体外细胞模型 | AML12细胞系,LPS浓度(100 ng/ml),DS3201浓度(5 nM),ML385浓度(文中未明确说明),处理时间(24小时) 阅读提示:详见主要方法中“细胞培养”和结果“LPS可诱导体外肝细胞铁死亡” |
| 铁死亡评估 | 检测指标:组织铁染色、Fe2+含量、MDA、GSH、PI染色、TEM;抗体:anti-GPX4, anti-xCT, anti-COX2等 阅读提示:详见主要方法中“肝损伤”、“氧化应激指标检测”及结果“EZH1缺陷改善脓毒症小鼠肝脏铁死亡” |
| 机制验证 | CUT&RUN测序:H3K27me3抗体(1:100),数据分析(IGV);NRF2抑制剂(ML385)的使用浓度和时间(未明确) 阅读提示:详见主要方法中“CUT&RUN测序”及结果“NRF2与EZH1抑制剂DS3201改善肝细胞铁死亡相关” |