LCSCs富集与鉴定
从HepG2和HCCLM3细胞系中富集肝癌干细胞,并验证其干性标志物表达。
使用无血清培养基和生长因子培养细胞形成干细胞球,通过流式细胞术检测CD133和EPCAM表达,并检测Pyk2表达水平。
Inhibiting Pyk2/Src expression by miR-23b-3p suppressed liver cancer stem cell function and hepatic carcinoma progression.
包含体外细胞实验(增殖、成球、迁移、侵袭、化疗敏感性)、分子实验(RT-qPCR、Western blot、荧光素酶报告基因)和体内小鼠异种移植模型验证。
HepG2肝癌细胞系 HCCLM3肝癌细胞系 HCCLM3-LCSC肝癌干细胞 BALB/c裸鼠异种移植模型
LCSCs从HepG2和HCCLM3细胞系中通过无血清悬浮培养富集,使用第六代干细胞球 Pyk2敲低通过siRNA转染实现,siRNA-Pyk2-3用于HepG2-LCSCs,siRNA-Pyk2-1用于HCCLM3-LCSCs miR-23b-3p抑制剂(RI1233)和mimics(RM2233)购自锐博生物,使用Lipofectamine 2000转染 体内实验中,每组3只BALB/c裸鼠,皮下接种1×10^7 cells/mL细胞悬液 细胞增殖用CCK-8检测,化疗敏感性用顺铂处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从HepG2和HCCLM3细胞系中富集肝癌干细胞,并验证其干性标志物表达。
使用无血清培养基和生长因子培养细胞形成干细胞球,通过流式细胞术检测CD133和EPCAM表达,并检测Pyk2表达水平。
通过siRNA转染建立Pyk2敲低的LCSC细胞系,用于研究Pyk2功能。
使用siRNA-Pyk2-3(HepG2-LCSCs)和siRNA-Pyk2-1(HCCLM3-LCSCs)转染LCSCs,通过RT-qPCR和Western blot验证敲低效率。
评估Pyk2敲低对LCSC增殖、成球、迁移、侵袭、化疗敏感性和干性基因表达的影响。
通过细胞集落形成、肿瘤球形成、划痕愈合、Transwell侵袭和CCK-8实验检测功能变化,并通过RT-qPCR检测干性基因表达。
验证miR-23b-3p是否直接靶向Pyk2,并影响Pyk2/Src信号通路。
使用双荧光素酶报告基因实验验证miR-23b-3p与Pyk2 3‘-UTR的直接结合,检测miR-23b-3p在细胞中的表达,并分析Pyk2敲低及miR-23b-3p抑制剂对Pyk2和Src磷酸化的影响。
探究miR-23b-3p通过调控Pyk2信号对LCSC增殖、迁移、侵袭和化疗敏感性的影响。
在HCCLM3-LCSCs中转染miR-23b-3p抑制剂或siPyk2,并联合处理,通过划痕愈合、Transwell和CCK-8实验检测功能变化,以及RT-qPCR检测干性基因表达。
在BALB/c裸鼠异种移植模型中验证miR-23b-3p通过Pyk2/Src信号对肿瘤生长的影响。
将HCCLM3、HCCLM3-LCSC、HCCLM3-LCSCsiPyk2、HCCLM3-LCSC+miR-23b抑制剂和HCCLM3-LCSCsiPyk2+miR-23b抑制剂细胞皮下接种到小鼠背部,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫组化检测Pyk2和Src表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 人肝细胞生长因子 | Merck | HY-P70627 | |
| 人碱性成纤维细胞生长因子 | Merck | HY-P70440G | |
| 人表皮生长因子 | Merck | HY-P72982 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| miR-23b-3p模拟物 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | RM2233 | |
| miR-23b-3p抑制剂 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | RI1233 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8溶液 | Beyotime | C0038 |
| 流式分析 | CD133抗体 | Thermo | 11-1339-41 |
| EPCAM抗体 | Thermo | 17-0247-41 | |
| 免疫组化 | Pyk2抗体 | Proteintech | 17592-1-AP |
| Src抗体 | Cell signaling technology | 2105 | |
| 免疫组化试剂盒 | Beyotime | P0615 | |
| DAB辣根过氧化物酶显色试剂盒 | Beyotime | P0203 | |
| RT-qPCR | RNAeasy RNA提取试剂盒 | Beyotime | R0027 |
| 逆转录试剂盒 | Beyotime | D7168L | |
| SYBR Premix Ex Taq | Takara | DRR420A | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| Pyk2抗体 | Proteintech | 17592-1-AP | |
| 磷酸化Pyk2抗体 | Cell signaling technology | 3291 | |
| Src抗体 | Cell signaling technology | 2105 | |
| 磷酸化Src抗体 | Cell signaling technology | 2109 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| HRP标记羊抗兔二抗 | ASPEN | AS1107 | |
| ECL化学发光检测试剂 | ASPEN | AS1059 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LCSCs富集 | 细胞系来源、培养基成分、生长因子浓度、培养时间(第六代) 阅读提示:Methods: Cell culture and LCSC enrichment |
| Pyk2敲低 | siRNA序列、转染试剂浓度、转染时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell transfection, Supplement Table 1 |
| 功能实验 | 细胞接种密度、培养时间、顺铂浓度(未明确) 阅读提示:Methods: Tumor sphere formation assay, Colony formation assay, Wound healing assay, Transwell assay, CCK-8 assay |
| miR-23b-3p调控 | miR-23b-3p mimics/inhibitors浓度、双荧光素酶报告基因实验条件 阅读提示:Results: miR-23b-3p inhibits Pyk2/Src signaling in LCSCs; Figure 4 legend |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别(未明确)、细胞数量、接种部位、肿瘤测量频率 阅读提示:Methods: Animal experiments; Figure 6 legend |