细胞培养与药物处理
培养OSCC细胞系并用杠柳苷处理以评估其效应。
SCC-15和CAL-27细胞在含10%FBS的DMEM中培养,用不同浓度杠柳苷处理。
Effect of periplocin on malignant behavior of oral squamous cell carcinoma cells.
包含体外细胞实验(增殖、凋亡、周期、迁移)、蛋白质组学及生物信息学验证,但缺乏动物体内实验。
SCC-15细胞系 CAL-27细胞系 TCGA-HNSC数据库队列
杠柳苷浓度:50、100、200、400 ng/mL 处理时间:24、48、72小时 细胞系:SCC-15和CAL-27 蛋白质组学分析浓度:0和100 ng/mL 统计方法:单因素方差分析和Dunnett检验,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
培养OSCC细胞系并用杠柳苷处理以评估其效应。
SCC-15和CAL-27细胞在含10%FBS的DMEM中培养,用不同浓度杠柳苷处理。
评估杠柳苷对OSCC细胞增殖和集落形成能力的影响。
MTS实验测量细胞活力,集落形成实验评估长期增殖能力。
检测杠柳苷对OSCC细胞凋亡和细胞周期分布的影响。
流式细胞术检测Annexin V-PE/7-AAD凋亡和PI染色的周期,Western blot验证相关蛋白。
评估杠柳苷对OSCC细胞迁移能力的影响。
Transwell实验检测迁移细胞数,Western blot检测E-钙黏蛋白和N-钙黏蛋白表达。
鉴定杠柳苷处理后的差异表达蛋白及富集通路。
对0和100 ng/mL杠柳苷处理的CAL-27细胞进行TMT定量蛋白质组学,并分析差异蛋白的GO和KEGG富集。
验证SDC1和CHCHD2在OSCC中的表达及其临床诊断价值。
Western blot验证杠柳苷处理后蛋白表达,TCGA数据库分析组织表达和临床相关性,ROC评估诊断价值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良 Eagle 培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 杠柳苷 | -- | C36H56O13 |
| 集落形成实验 | 结晶紫溶液 | Solarbio | -- |
| Western blotting | Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-lg |
| Bcl-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| Bad抗体 | Wanleibio | WL02140 | |
| Caspase3抗体 | Ab-mart | T40044F | |
| Cleaved-caspase3抗体 | Wanleibio | WL01992 | |
| CDK1抗体 | Wanleibio | WL02373 | |
| CDK2抗体 | Wanleibio | WL01543 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Wanleibio | WL01482 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Wanleibio | WL01047 | |
| SDC1抗体 | Affinity | DF12066 | |
| CHCHD2抗体 | Affinity | DF6367 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Servicebio | GB15003 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) HRP偶联物 | Abbkine | A23920 | |
| MTS实验 | MTS溶液 | -- | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V-PE | -- | -- |
| 7-AAD试剂 | -- | -- | |
| 碘化丙啶染色液 | -- | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、培养条件(37℃、5% CO2) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 药物处理 | 杠柳苷浓度、处理时间、溶剂(生理盐水) 阅读提示:Methods: Reagents and antibodies; Results: Figure 1-4 |
| 增殖检测 | MTS实验的细胞密度、处理时间、OD值测量波长 阅读提示:Methods: MTS assay; Results: Figure 1 |
| 凋亡检测 | Annexin V-PE和7-AAD用量、孵育时间、流式细胞仪型号 阅读提示:Methods: Flow cytometry assay; Results: Figure 2 |
| 周期检测 | PI染色液用量、孵育时间、流式细胞仪型号 阅读提示:Methods: Flow cytometry assay; Results: Figure 3 |
| 迁移检测 | Transwell小室孔径、细胞密度、下室FBS浓度、孵育时间、染色方法 阅读提示:Methods: Transwell migration assay; Results: Figure 4 |
| 蛋白质组学 | TMT标记、样本分组、差异蛋白筛选阈值(≥1.5或≤0.667) 阅读提示:Methods: Proteomic analysis; Bioinformatic analysis of DEPs; Results: Figure 5 |
| Western blot | 一抗稀释比例、二抗稀释比例、内参蛋白(β-actin) 阅读提示:Methods: Western blotting analysis |