转录组分析揭示幽门螺杆菌相关基因诱导胃癌炎症细胞浸润和化疗耐药

背景：幽门螺杆菌感染与胃癌的肿瘤微环境密切相关，但其潜在机制尚不清楚。因此，探索幽门螺杆菌引起的微环境和耐药性以增强胃癌的治疗策略至关重要。方法：利用转录组生物信息学，我们使用TCGA和GSE62254数据集计算了包含ACSM5和HSPB2基因表达的幽门螺杆菌相关预后指数。我们评估了抗癌药物的IC50值和免疫细胞浸润，以评估基于HPI的治疗效果和肿瘤微环境。此外，我们通过检测siACSM5和siHSPB2转染后的药物敏感性，并分析单细胞RNA测序数据和临床患者样本，验证了转录组分析的发现。结果：ACSM5和HSPB2被确定为胃癌中幽门螺杆菌感染的相关因子。重要的是，我们建立了幽门螺杆菌相关预后指数，并发现高HPI与较差的预后相关。基于HPI的分组表明肿瘤微环境细胞浸润增强和抗肿瘤药物耐药。结论：HPI反映了新发现的互补生物标志物，与肿瘤微环境相关，并能准确预测胃癌患者的化疗耐药和免疫细胞分布改变，从而为治疗干预提供临床指导。