EVs的分离与表征
获得并验证多房棘球绦虫来源的EVs。
培养原头节(PSCs),收集培养基并通过差速离心纯化EVs,使用NTA和TEM分析粒径和形态,通过western blot检测EV标志物CD9和CD63。
Emu-miR-10a-5p in Echinococcus multilocularis-derived-extracellular vesicles alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma by inhibiting macrophage M2a polarization through LIF-mediated JAK1-STAT3 signaling.
包含体外细胞实验(MH-S细胞M2a极化模型、双荧光素酶报告基因、siRNA/过表达LIF、联合转染)、转录组测序、体内OVA诱导哮喘模型及组织病理、流式、免疫荧光等验证。
MH-S细胞M2a极化模型 OVA诱导过敏性哮喘小鼠模型 E. multilocularis原头节来源EVs
EVs纯化及表征(NTA、TEM、western blot检测CD9/CD63) MH-S细胞M2a极化诱导条件(IL-4和IL-13各20 ng/mL) emu-miR-10a-5p模拟物转染浓度及时间 OVA致敏和激发方案(剂量、时间、给药方式) LIF靶向验证(双荧光素酶报告基因)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证多房棘球绦虫来源的EVs。
培养原头节(PSCs),收集培养基并通过差速离心纯化EVs,使用NTA和TEM分析粒径和形态,通过western blot检测EV标志物CD9和CD63。
验证EVs和emu-miR-10a-5p对M2a巨噬细胞极化的影响。
使用IL-4和IL-13诱导MH-S细胞M2a极化,与EVs共培养或转染emu-miR-10a-5p mimics,通过RT-qPCR和流式细胞术检测M2a标志物。
鉴定emu-miR-10a-5p的靶基因及信号通路。
对MH-S细胞进行转录组测序,比较空白组、M2a极化组和转染emu-miR-10a-5p的M2a组,筛选差异基因,并通过双荧光素酶报告基因验证LIF为直接靶点。
确认LIF是否通过JAK1-STAT3信号调控M2a极化。
通过LIF siRNA敲低和OE-LIF过表达,检测JAK1-STAT3信号和M2a标志物表达。
验证emu-miR-10a-5p通过LIF-JAK1-STAT3轴发挥作用。
将emu-miR-10a-5p mimics与OE-LIF共转染MH-S细胞,观察M2a极化和JAK1-STAT3信号的变化。
评估emu-miR-10a-5p对过敏性哮喘小鼠气道炎症的影响。
建立OVA诱导的过敏性哮喘小鼠模型,通过尾静脉注射emu-miR-10a-5p agomir,通过组织病理染色、ELISA、流式细胞术等评估炎症反应和M2a极化。
验证emu-miR-10a-5p在体内抑制M2a极化和LIF-JAK1-STAT3信号。
分析小鼠肺组织中M1/M2a巨噬细胞比例、M2a相关基因表达以及LIF、JAK1、STAT3的表达,并通过免疫荧光检测LIF在巨噬细胞中的表达。
探究emu-miR-10a-5p对CD4+ T细胞分化的影响。
将转染emu-miR-10a-5p的巨噬细胞与脾脏Naïve CD4+ T细胞共培养,通过流式细胞术检测Th1/Th2细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 去外泌体胎牛血清 | VivaCell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio Science & Technology | -- | |
| EVs分离 | 磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 细胞培养 | β-巯基乙醇 | -- | -- |
| 诱导M2a极化 | 白细胞介素-4 | BioLegend | -- |
| 白细胞介素-13 | BioLegend | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 动物模型 | 卵清蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 氢氧化铝 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| emu-miR-10a-5p激动剂 | GenePharma | -- | |
| 阴性对照激动剂 | GenePharma | -- | |
| 细胞培养 | MH-S细胞(小鼠肺泡巨噬细胞) | ProCell | CL-0597 |
| HEK293T细胞 | -- | -- | |
| T细胞分离 | 小鼠脾脏淋巴细胞分离培养基试剂盒 | Tianjin Haoyang Biopharmaceutical | -- |
| 小鼠初始CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 流式分析 | FACSCelesta流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| FlowJo软件 | -- | -- | |
| PE-抗F4/80抗体 | BioLegend | -- | |
| APC-抗CD206抗体 | BioLegend | -- | |
| FITC-抗CD11c抗体 | BioLegend | -- | |
| APC-抗siglec-F抗体 | BioLegend | -- | |
| APC-抗CD3抗体 | BioLegend | -- | |
| FITC-抗CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-抗IL-4抗体 | BioLegend | -- | |
| PerCp-cy5.5-抗IFN-γ抗体 | BioLegend | -- | |
| 含Brefeldin A的细胞活化鸡尾酒试剂 | BioLegend | -- | |
| 胞内染色破膜洗涤缓冲液 | BioLegend | -- | |
| BV421-抗CD86抗体 | BD Pharmingen | -- | |
| APC-cy7-抗CD45抗体 | BD Pharmingen | -- | |
| ELISA | 小鼠OVA特异性IgE ELISA试剂盒 | Nanjing Boyan Biotechnology | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNAprep纯组织试剂盒 | TianGen | -- | |
| RT-qPCR | PrimeScript™ RT预混液 | Takara Biomedical Technology | -- |
| Bestar® SYBR Green qPCR预混液 | DBI® Bioscience | -- | |
| All-in-One miRNA RT-qPCR检测试剂盒 | GeneCopoeia | -- | |
| Western blot | 总蛋白提取试剂盒 | KeyGEN | -- |
| BCA蛋白测定试剂盒 | KeyGEN | -- | |
| 抗LIF抗体 | Abcam | ab113262 | |
| 抗JAK1抗体 | Abcam | ab133666 | |
| 抗STAT3抗体 | Abcam | ab68153 | |
| 抗CD9抗体 | Cell Signaling Technology | 13174 | |
| 抗CD63抗体 | Cell Signaling Technology | 52090 | |
| 抗p-JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 74129 | |
| 抗p-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗β-actin抗体 | Bioworld Technology | BS6007MH | |
| 二抗 | Bioworld Technology | BS20241-Y | |
| ECL检测试剂盒 | KeyGen Biotech | -- | |
| ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | psiCHECK-2质粒 | Promega | -- |
| Dual Glo双荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| 组织染色 | 10%福尔马林 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | Abcam | ab300421 |
| 抗Arg1抗体 | Abmart | TD6657 | |
| 抗LIF抗体 | Abcam | ab113262 | |
| Cy3偶联山羊抗兔二抗 | Proteintech | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 全景切片扫描仪(PANNORAMIC MIDI) | 3DHISTECH | -- | |
| 数据统计 | GraphPad Prism 8.0软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EVs分离与表征 | 原头节培养条件(DMEM含30%去外泌体FBS)、差速离心参数(1500、2000、10000、120000 × g,各30、30、60、90分钟,4°C)。 阅读提示:Methods: Isolation and characterization of EVs |
| M2a极化模型 | MH-S细胞代数、IL-4和IL-13浓度(20 ng/mL)、处理时间(至少48小时)。 阅读提示:Methods: Cell culture; Results: Figure 3 |
| emu-miR-10a-5p转染 | mimics浓度、转染试剂(Lipofectamine 3000)及用量、转染时间。 阅读提示:Methods: Cell culture |
| OVA诱导哮喘模型 | OVA剂量(致敏20μg,激发100μg)、Al(OH)3体积(50μL)、致敏和激发时间点(第0、7、14天;第21-33天隔天)、agomir注射剂量(3 OD)和途径(尾静脉)。 阅读提示:Methods: Animals and treatments; Figure 1 |
| LIF靶向验证 | 双荧光素酶报告基因质粒构建(psiCHECK-2-LIF-3'UTR)、共转染用量(emu-miR-10a-5p mimic 50 ng)、检测时间(48小时)。 阅读提示:Methods: Dual-luciferase reporter assay |
| 组织病理分析 | 肺组织固定(10%福尔马林)、包埋、切片厚度、染色方案(H&E、Masson、PAS)。 阅读提示:Methods: Histopathologic analysis |
| 流式细胞术 | 肺和脾脏单细胞制备、抗体组合和浓度、破膜固定步骤、上机仪器型号。 阅读提示:Methods: Tissue staining and flow cytometry |