体内模型建立与CDCP1表达检测
验证CDCP1是否在内膜增生中表达升高
通过结扎小鼠颈动脉分叉制备局灶性颈动脉狭窄模型,在术后7、14、21、28天取颈动脉,进行HE染色和免疫荧光、Western blot检测CDCP1表达。
CDCP1 knockdown suppresses PDGFRβ/AKT pathway-mediated vascular smooth muscle cell proliferation by inhibiting PDGFRβ endocytosis.
包含小鼠颈动脉结扎模型、VSMC体外培养、siRNA敲低、RNA-seq、Western blot、Co-IP、IF等多层级验证,涵盖功能与机制验证。
小鼠局灶性颈动脉狭窄模型 小鼠血管平滑肌细胞(VSMC)
CDCP1敲低效率:qRT-PCR验证siCDCP1转染后CDCP1表达显著降低 PDGF-BB刺激浓度和时间:20 ng/mL,刺激24小时(增殖/迁移)或5、15、30分钟(信号通路) 体内模型:小鼠颈动脉结扎后7、14、21、28天取材 RNA-seq差异表达基因筛选阈值:|log2FC|>1且Padj<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CDCP1是否在内膜增生中表达升高
通过结扎小鼠颈动脉分叉制备局灶性颈动脉狭窄模型,在术后7、14、21、28天取颈动脉,进行HE染色和免疫荧光、Western blot检测CDCP1表达。
评估CDCP1对VSMC功能的影响
培养小鼠VSMC,使用siRNA敲低CDCP1,检测敲低效率。
检测CDCP1敲低对VSMC增殖和迁移的影响
采用CCK8、EDU实验检测增殖,伤口愈合和Transwell实验检测迁移。
探究CDCP1敲低影响的信号通路
对CDCP1敲低和对照的VSMC进行RNA-seq,筛选差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
验证CDCP1敲低对PDGFRβ/AKT信号的影响
在PDGF-BB刺激的不同时间点,通过Western blot检测PDGFRβ和AKT的磷酸化水平。
探究CDCP1敲低影响PDGFRβ泛素化和内吞的机制
通过Co-IP检测PDGFRβ与NEDD4、clathrin、Rab5的结合以及PDGFRβ泛素化水平;通过IF检测其共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | VivaCell | C3120-0500 |
| 胎牛血清 | Pricella | 164210 | |
| 青霉素-链霉素 | Boehringer Ingelheim | 03-031-1BCS | |
| siRNA转染 | riboFECT-TM CP转染试剂盒 | RiboBio | C10511-05 |
| RNA提取 | 细胞RNA提取试剂盒 | YEASEN | 19231ES50 |
| cDNA合成 | cDNA逆转录试剂盒 | Vazyme | R323 |
| 细胞处理 | 血小板衍生生长因子-BB | Cell Signaling Technology | 50611 |
| 细胞活性检测 | CCK8溶液 | 上海 | C0037 |
| 酶标仪 | Shanpu | 1900 | |
| 细胞增殖检测 | EDU细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0075S |
| 细胞迁移检测 | Transwell板 | Corning | 3422 |
| 结晶紫 | Solarbio | G1062 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| SDS-PAGE凝胶 | Meilunbio | MA0387 | |
| PVDF膜 | Sigma | 03010040001 | |
| CDCP1抗体 | Proteintech | 12754-1-AP | |
| Rab5抗体 | Cell Signaling Technology | 46449 | |
| PDGFRβ抗体 | Huaan | ET1605-20 | |
| AKT抗体 | Huaan | ET1609-51 | |
| 磷酸化PDGFRβ抗体 | Cell Signaling Technology | 3166 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Affinity Biosciences | AF0016 | |
| 化学发光成像系统JP-K600 | Jiapeng | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Solarbio | P0100 | |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 | |
| 泛素化抗体 | Santa Cruz | sc-8017 | |
| 免疫荧光 | CDCP1抗体 | Huaan | EM1701-84 |
| Triton X-100 | Solarbio | G1076 | |
| PDGFRβ抗体 | Abcam | ab69506 | |
| NEDD4抗体 | Cell Signaling Technology | 2740 | |
| 网格蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4796 | |
| Rab5抗体 | Cell Signaling Technology | 3547 | |
| Alexa Fluor@555标记的山羊抗小鼠IgG | SouthernBiotech | 1030-32 | |
| Alexa Fluor@488标记的山羊抗兔IgG | SouthernBiotech | 4030-30 | |
| DAPI | SouthernBiotech | 0100-20 | |
| 荧光显微镜BZ-X810 | KEYENCE | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内模型 | 小鼠品系、性别、年龄、数量、分组、取材时间点 阅读提示:Methods: Murine focal carotid stenosis model |
| 细胞培养 | VSMC来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Methods: Cell culture |
| siRNA转染 | siRNA序列、浓度、转染试剂、孵育时间 阅读提示:Methods: siRNA synthesis and transfection |
| 功能实验 | PDGF-BB浓度、刺激时间、检测方法 阅读提示:Methods: CCK8 assay, Cell proliferation assay, The wound-healing assay, Transwell assay |
| 信号通路检测 | 血清饥饿时间、PDGF-BB刺激时间点、抗体 阅读提示:Methods: Western blot; Results: CDCP1 knockdown inhibited PDGFRβ/AKT signaling |
| 蛋白相互作用 | PDGF-BB刺激时间、抗体、珠子类型 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation |