综合药物分析、生物信息学分析与实验验证,鉴定消瘰丸治疗子宫肌瘤的成分与机制

Integrated pharmacoanalysis, bioinformatics analysis, and experimental validation to identify the ingredients and mechanisms of Xiao-Luo-Wan in uterine fibroids treatment.

作者信息Yonghui Yu, Haojun Zhang, Fang Yang, Hong Liu
PMID40219728
发布时间2025-12
DOI10.1080/13880209.2025.2485905

实验完整度

包含质谱成分分析、网络药理学预测、分子对接及体外细胞实验(CCK-8、流式、RT-PCR、Western blot),但缺乏动物模型或临床样本验证,证据层级单一。

主要模型

人子宫肌瘤细胞(UMCs) 含药血清制备用SD大鼠(仅用于制备血清)

重点核对

XLW含药血清浓度:20%、30%、40% 处理时间:24h、48h、72h 细胞系:人子宫肌瘤细胞(UMCs)来源及传代数(3-5代) 阳性对照药物:米非司酮(RU-486)浓度(未明确) 关键靶点:TRIM9、NF-κB、p38MAPK的表达变化

摘要

背景:消瘰丸(XLW)是中医经典方剂,对子宫肌瘤(UFs)具有治疗作用。本文采用系统药理学方法研究其抗UFs效应。目的:通过质谱法探讨XLW的活性成分,并通过网络药理学、分子对接和实验验证探讨其对UFs的潜在作用。材料与方法:采用质谱仪分析含药血清中XLW的化学成分。通过网络药理学和分子对接预测XLW抗UFs的关键靶点和潜在机制。接着,用20%、30%或40%的XLW血清处理人子宫肌瘤细胞(UMCs)24小时、48小时或72小时。采用CCK-8法分析细胞活力,流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期。并通过RT-PCR和Western blotting进一步验证预测靶点。结果:在XLW含药血清中鉴定出16种化学成分,并预测出53个治疗UFs的靶基因。核心靶点(包括TRIM9、NF-κB和p38MAPK)与成分(尤其是buergerinin B、cedrol和ent-15B-16-epoxy-kauan-17-ol)的分子结合相对稳定。体外实验显示,XLW对UMCs的IC50为63.21%,其抗UFs作用可能与通过调控TRIM9、NF-κB和p38MAPK表达来抑制细胞增殖和促进细胞凋亡的靶点密切相关。讨论与结论:质谱、网络药理学、分子对接和生物学实验的整合揭示了XLW治疗UFs的关键成分及其药理机制,这可能有助于发现治疗UFs的药物。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
消瘰丸(XLW)治疗子宫肌瘤(UFs)的活性成分及其药理机制是什么?
核心机制
XLW通过调控TRIM9/NF-κB和p38MAPK通路,抑制细胞增殖、促进细胞凋亡并阻滞细胞周期于G0/G1期。
主要证据
体外实验显示XLW含药血清(20%、30%、40%)抑制UMCs增殖,IC50为63.21%,增加凋亡率;RT-PCR和Western blot显示上调Caspase9、p16,下调Ki-67、Survivin,并调控TRIM9、NF-κB、p38MAPK表达。
研究意义
研究揭示了XLW关键成分及其药理机制,可能有助于发现治疗子宫肌瘤的治疗药物,但需进一步体内和临床研究。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

质谱分析鉴定XLW含药血清中化学成分

确定进入血液的XLW活性成分

制备XLW煎剂和含药血清,利用UPLC-MS/MS分析化学成分,与数据库比对鉴定出16种原型成分。

2

网络药理学预测靶点和通路

预测XLW活性成分治疗UFs的潜在靶点和信号通路

基于16个成分在TCMSP和HTDocking数据库预测靶点,与UFs治疗靶点(DigSee、DrugBank、OMIM)取交集,构建PPI网络并进行GO和KEGG富集分析。

3

分子对接验证成分与核心靶点结合

评估XLW成分与核心靶点(TRIM9、NF-κB、p38MAPK)的结合亲和力

利用AutoDock Vina进行分子对接,分析结合能,并用PyMOL可视化。

4

体外细胞实验验证XLW抗UF效应

验证XLW对UMCs增殖、凋亡和细胞周期的影响

用不同浓度XLW含药血清处理UMCs,通过CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡和周期,RT-PCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Dionex UltiMate 3000Thermo Fisher Scientific--
UPLC HSS T3色谱柱Waters--
Q ExactiveThermo Fisher Scientific--
贝母甲素HEXIN TECH23496-41-5
贝母乙素HEXIN TECH18059-10-4
贝母辛HEXIN TECH19773-24-1
浙贝壬HEXIN TECH143120-47-2
西贝母碱HEXIN TECH61825-98-7
安格洛苷CHEXIN TECH115909-22-3
牛磺酸HEXIN TECH107-35-7
胎牛血清Gibco16000044
青霉素-链霉素溶液Gibco15070063
磷酸盐缓冲液Gibco10010023
米非司酮YuanYe BiotechnologyB25394
CCK-8试剂Abcamab228554
Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒MultiSciencesAP101-100
细胞周期染色试剂盒MultiSciencesCCS102
NovoCyte 2060RACEA Biosciences--
TRIzol试剂Invitrogen15596026CN
超纯RNA提取试剂盒CWBIO BiotechCW0581M
ChamQ Universal SYBR qPCR预混液Vazyme BiotechQ711
HiScript II Q RT SuperMix for qPCR试剂盒Vazyme BiotechR223-01
CFX Connect系统Bio-Rad--
BCA蛋白定量试剂盒Bio-Rad5000001
Mini-PROTEAN TGX预制胶Bio-Rad4561096
硝酸纤维素膜MilliporeZ358657
抗Ki-67抗体Abcam92742
抗Caspase9抗体CST9508
抗TRIM9抗体CST47990
抗NF-κB p65抗体CST8242
抗磷酸化p38MAPK抗体CST9211
抗β-actin抗体CST4967
辣根过氧化物酶标记二抗CST7040

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
含药血清制备
动物品系:SD大鼠;剂量:6.30 g/kg;给药途径:灌胃;给药时间:7天;血清采集时间:最后一次给药后(未明确)
阅读提示:Materials and methods 中 Preparation of serum containing the XLW decoction
细胞培养与处理
细胞系:UMCs;培养基:含FBS和双抗的完全培养基;处理浓度:20%、30%、40% XLW含药血清;处理时间:24h、48h、72h;阳性对照:RU-486(浓度未明确);阴性对照:1‰ DMSO
阅读提示:Materials and methods 中 Cell viability assay
增殖检测
CCK-8试剂孵育时间:2小时;检测波长:450nm;重复数:5个复孔
阅读提示:Materials and methods 中 Cell viability assay
凋亡与周期检测
细胞密度:1×10^6 cells/well;处理时间:48h;凋亡染色:Annexin V-FITC和PI各5μl和10μl,孵育10min;周期染色:DNA染色液和透化液各1ml和10μl,孵育30min;流式细胞仪:NovoCyte 2060R;分析软件:FlowJo v10
阅读提示:Materials and methods 中 Cell apoptosis and cell cycle assays
基因表达检测
引物序列:TRIM9、NF-κB、p38MAPK等(见之前文献);RT-PCR条件:95°C 10min,40个循环(95°C 10s,58°C 30s,72°C 30s);内参:β-actin;重复数:三次
阅读提示:Materials and methods 中 RNA isolation and detection
蛋白表达检测
一抗稀释比例:Ki-67 1:5000,其他1:1000;内参:β-actin;曝光系统:化学发光系统
阅读提示:Materials and methods 中 Protein extraction and Western blot analysis