质谱分析鉴定XLW含药血清中化学成分
确定进入血液的XLW活性成分
制备XLW煎剂和含药血清,利用UPLC-MS/MS分析化学成分,与数据库比对鉴定出16种原型成分。
Integrated pharmacoanalysis, bioinformatics analysis, and experimental validation to identify the ingredients and mechanisms of Xiao-Luo-Wan in uterine fibroids treatment.
包含质谱成分分析、网络药理学预测、分子对接及体外细胞实验(CCK-8、流式、RT-PCR、Western blot),但缺乏动物模型或临床样本验证,证据层级单一。
人子宫肌瘤细胞(UMCs) 含药血清制备用SD大鼠(仅用于制备血清)
XLW含药血清浓度:20%、30%、40% 处理时间:24h、48h、72h 细胞系:人子宫肌瘤细胞(UMCs)来源及传代数(3-5代) 阳性对照药物:米非司酮(RU-486)浓度(未明确) 关键靶点:TRIM9、NF-κB、p38MAPK的表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定进入血液的XLW活性成分
制备XLW煎剂和含药血清,利用UPLC-MS/MS分析化学成分,与数据库比对鉴定出16种原型成分。
预测XLW活性成分治疗UFs的潜在靶点和信号通路
基于16个成分在TCMSP和HTDocking数据库预测靶点,与UFs治疗靶点(DigSee、DrugBank、OMIM)取交集,构建PPI网络并进行GO和KEGG富集分析。
评估XLW成分与核心靶点(TRIM9、NF-κB、p38MAPK)的结合亲和力
利用AutoDock Vina进行分子对接,分析结合能,并用PyMOL可视化。
验证XLW对UMCs增殖、凋亡和细胞周期的影响
用不同浓度XLW含药血清处理UMCs,通过CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡和周期,RT-PCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学成分分析 | Dionex UltiMate 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| Q Exactive | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 标准品 | 贝母甲素 | HEXIN TECH | 23496-41-5 |
| 贝母乙素 | HEXIN TECH | 18059-10-4 | |
| 贝母辛 | HEXIN TECH | 19773-24-1 | |
| 浙贝壬 | HEXIN TECH | 143120-47-2 | |
| 西贝母碱 | HEXIN TECH | 61825-98-7 | |
| 安格洛苷C | HEXIN TECH | 115909-22-3 | |
| 牛磺酸 | HEXIN TECH | 107-35-7 | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | 16000044 |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | 15070063 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 10010023 | |
| 细胞处理 | 米非司酮 | YuanYe Biotechnology | B25394 |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Abcam | ab228554 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | MultiSciences | AP101-100 |
| 细胞周期检测 | 细胞周期染色试剂盒 | MultiSciences | CCS102 |
| 流式分析 | NovoCyte 2060R | ACEA Biosciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| 超纯RNA提取试剂盒 | CWBIO Biotech | CW0581M | |
| RT-PCR | ChamQ Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q711 |
| HiScript II Q RT SuperMix for qPCR试剂盒 | Vazyme Biotech | R223-01 | |
| CFX Connect系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | 5000001 |
| Mini-PROTEAN TGX预制胶 | Bio-Rad | 4561096 | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | Z358657 | |
| 抗Ki-67抗体 | Abcam | 92742 | |
| 抗Caspase9抗体 | CST | 9508 | |
| 抗TRIM9抗体 | CST | 47990 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | CST | 8242 | |
| 抗磷酸化p38MAPK抗体 | CST | 9211 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 4967 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | CST | 7040 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 含药血清制备 | 动物品系:SD大鼠;剂量:6.30 g/kg;给药途径:灌胃;给药时间:7天;血清采集时间:最后一次给药后(未明确) 阅读提示:Materials and methods 中 Preparation of serum containing the XLW decoction |
| 细胞培养与处理 | 细胞系:UMCs;培养基:含FBS和双抗的完全培养基;处理浓度:20%、30%、40% XLW含药血清;处理时间:24h、48h、72h;阳性对照:RU-486(浓度未明确);阴性对照:1‰ DMSO 阅读提示:Materials and methods 中 Cell viability assay |
| 增殖检测 | CCK-8试剂孵育时间:2小时;检测波长:450nm;重复数:5个复孔 阅读提示:Materials and methods 中 Cell viability assay |
| 凋亡与周期检测 | 细胞密度:1×10^6 cells/well;处理时间:48h;凋亡染色:Annexin V-FITC和PI各5μl和10μl,孵育10min;周期染色:DNA染色液和透化液各1ml和10μl,孵育30min;流式细胞仪:NovoCyte 2060R;分析软件:FlowJo v10 阅读提示:Materials and methods 中 Cell apoptosis and cell cycle assays |
| 基因表达检测 | 引物序列:TRIM9、NF-κB、p38MAPK等(见之前文献);RT-PCR条件:95°C 10min,40个循环(95°C 10s,58°C 30s,72°C 30s);内参:β-actin;重复数:三次 阅读提示:Materials and methods 中 RNA isolation and detection |
| 蛋白表达检测 | 一抗稀释比例:Ki-67 1:5000,其他1:1000;内参:β-actin;曝光系统:化学发光系统 阅读提示:Materials and methods 中 Protein extraction and Western blot analysis |