体外细胞活性评估
检测L-741626对HCC细胞增殖、迁移和凋亡的影响。
使用CCK-8实验检测不同浓度L-741626处理后的细胞活力;集落形成实验和Ki-67免疫荧光检测细胞增殖;Transwell实验检测迁移;Annexin V/7-AAD染色流式检测凋亡。
L-741626 inhibits hepatocellular carcinoma progression by targeting Ref-1 to suppress MAPK/ERK signalling pathway activity.
体外细胞增殖、迁移、凋亡实验,体内异种移植瘤模型,分子对接、DARTS、Co-IP等机制验证,以及联合用药实验,证据层级完整。
人肝细胞癌细胞系Huh7、HepG2、Hep3B Huh7异种移植瘤裸鼠模型 肝细胞癌患者肿瘤组织样本
L-741626处理浓度和时间(CCK-8实验浓度梯度,凋亡检测10 μM,集落实验5 μM) MAPK/ERK通路激活剂TBHQ处理(用于验证通路) Ref-1敲低shRNA序列(shRef-1 #1和#2) 体内给药剂量和方案(索拉非尼20 mg/kg,L-741626 20 mg/kg,隔日腹腔注射) 分子对接结构(Ref-1 PDB: 5WN2,L-741626 CID: 133633)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测L-741626对HCC细胞增殖、迁移和凋亡的影响。
使用CCK-8实验检测不同浓度L-741626处理后的细胞活力;集落形成实验和Ki-67免疫荧光检测细胞增殖;Transwell实验检测迁移;Annexin V/7-AAD染色流式检测凋亡。
探究L-741626处理后HCC细胞中信号通路的变化。
对未处理和L-741626处理的Huh7和HepG2细胞进行RNA测序,并进行KEGG通路富集分析。
验证L-741626是否通过抑制MAPK/ERK通路发挥抗肿瘤作用。
用Western blot检测ERK1/2和p-ERK1/2表达;免疫荧光检测p-ERK水平;RT-qPCR检测C-MYC、EGFR、SRF mRNA水平;使用TBHQ(ERK通路激活剂)进行拯救实验。
鉴定L-741626的直接靶蛋白。
使用SuperPred数据库预测靶蛋白;分子对接模拟L-741626与Ref-1的结合;DARTS实验验证直接结合;TCGA数据库分析Ref-1表达与预后;免疫组化检测临床样本中Ref-1表达。
验证Ref-1在HCC细胞中的作用及其对MAPK/ERK通路的影响。
构建Ref-1敲低Huh7和HepG2细胞系,通过CCK-8检测细胞活力;Western blot检测ERK1/2和p-ERK1/2;GEPIA2数据库分析Ref-1与CRAF表达相关性;Co-IP实验验证Ref-1与CRAF相互作用。
评估L-741626单药及与索拉非尼联合在体内的抗肿瘤效果。
建立Huh7异种移植瘤裸鼠模型,分别给予PBS、索拉非尼、L-741626或联合用药,测量肿瘤体积和重量,并检测毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 基因敲低 | pSicoR-mCherry空载体 | Addgene | #21,907 |
| 药物处理 | L-741626 | MedChemExpress | -- |
| 索拉非尼 | MedChemExpress | -- | |
| Western blot | ERK1/2抗体 | MedChemExpress | -- |
| 磷酸化ERK1/2 (Tyr204/Tyr187)抗体 | MedChemExpress | -- | |
| CD133抗体 | MedChemExpress | -- | |
| Ref-1抗体 | Proteintech | -- | |
| CRAF抗体 | CUSABIO | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Selleck Chemicals | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Procell | P-CA-208 |
| 免疫组织化学 | 切片扫描仪 | Olympus | VS200 |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS-琼脂糖珠 | -- | -- |
| Western blot | 增强化学发光检测试剂 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:Huh7、HepG2和Hep3B来自ATCC;培养基:DMEM含10% FBS,5% CO2,37°C 阅读提示:Materials and methods: Cell line culture and shRNAs |
| 细胞活力检测 | 细胞密度:2000 cells/well;处理时间:不同浓度L-741626处理;CCK-8试剂:10 μL,孵育1小时;检测波长:450 nm 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay and colony formation; Results: Fig. 1A |
| 基因敲低 | shRNA序列:shRef-1 #1(GCCGGGTGATTGTGGCTGAAT)和#2(TGCCTGGATTAAGAAGAAAGGAT);载体:pSicoR-mCherry-empty 阅读提示:Materials and methods: Cell line culture and shRNAs |
| 体内实验 | 细胞接种:2.0×10^6 Huh7细胞皮下注射;给药方案:隔日腹腔注射,索拉非尼20 mg/kg,L-741626 20 mg/kg;治疗周期:两周;小鼠品系:BALB/c裸鼠,雄性 阅读提示:Materials and methods: In Vivo animal experiments; Results: Fig. 5C |