临床和数据库表达分析
验证PSAT1在卵巢癌与正常组织中的差异表达
使用GEPIA数据库分析PSAT1 mRNA在426例卵巢癌和88例正常卵巢组织中的表达,并进行生存分析
PSAT1 regulated by STAT4 enhances the proliferation, invasion and migration of ovarian cancer cells via the PI3K/AKT pathway.
包含GEPIA数据库和临床组织样本的临床关联分析、体外细胞功能实验、体内异种移植瘤实验以及通路抑制剂验证,并涉及STAT4调控PSAT1的机制验证。
卵巢癌细胞系CAOV3、OVCAR3、A2780、ES2 裸鼠皮下移植瘤模型 TCGA和GTEx数据库样本
细胞系来源和培养条件(CAOV3、OVCAR3、A2780、ES2) PSAT1过表达和敲低的验证效率 PI3K抑制剂GDC-0941的浓度(25 μM)和DMSO对照 体内实验动物分组和样本量(每组10只裸鼠) 细胞周期和侵袭迁移实验的时间及检测方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PSAT1在卵巢癌与正常组织中的差异表达
使用GEPIA数据库分析PSAT1 mRNA在426例卵巢癌和88例正常卵巢组织中的表达,并进行生存分析
构建PSAT1过表达和敲低的卵巢癌细胞模型
通过慢病毒转染在ES2和A2780细胞中过表达PSAT1,通过siRNA在CAOV3和OVCAR3细胞中敲低PSAT1,并用Western blot验证效率
评估PSAT1对卵巢癌细胞增殖和细胞周期的影响
通过MTT实验检测细胞增殖,通过流式细胞术分析细胞周期
评估PSAT1对卵巢癌细胞侵袭和迁移的影响
通过Transwell实验检测细胞侵袭,通过划痕实验检测细胞迁移
验证PSAT1在体内对卵巢癌细胞肿瘤形成的影响
将ES2-PSAT1-H和ES2-PSAT1-Mock细胞皮下接种于裸鼠,观察肿瘤生长和组织学分析
验证PSAT1是否通过PI3K/AKT通路发挥作用
Western blot检测通路蛋白表达,并使用PI3K抑制剂GDC-0941处理观察对细胞功能的影响
预测并验证STAT4对PSAT1的转录调控
通过Promo和JASPAR数据库预测STAT4为PSAT1的转录因子,并通过siRNA敲低STAT4验证对PSAT1表达的影响
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Biological Industries | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗PSAT1抗体 | Abcam | ab308512 | |
| 抗PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4292S | |
| 抗磷酸化PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4228S | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691S | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691S | |
| 抗GAPDH抗体 | Beijing Zhongshan Jinqiao Biotechnology | TA-08 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Beijing Zhongshan Jinqiao Biotechnology | -- | |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Beijing Zhongshan Jinqiao Biotechnology | -- | |
| Western化学发光HRP底物 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞增殖实验 | MTT | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| 细胞周期分析 | PI/RNase A染色液 | Nanjing KeyGen Biotech Co., Ltd. | -- |
| 侵袭实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 抗磷酸化C-RAF抗体 | Cell Signaling Technology | 9427 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 山羊血清封闭液 | Fuzhou Maixin Biotech Co., Ltd. | KIT-9720 | |
| 生物素标记的二抗 | Fuzhou Maixin Biotech Co., Ltd. | KIT-9720 | |
| 通路抑制实验 | GDC-0941 | Selleck Chemicals | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基(RPMI-1640,10% FBS),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 细胞转染 | PSAT1过表达和敲低的转染方法、浓度和时间;siRNA序列 阅读提示:Materials and methods, Establishment of stable PSAT1-overexpressing and transient PSAT1-knockdown cell lines; Table SI |
| 细胞增殖和周期 | MTT实验细胞密度(2000/孔),检测时间点;细胞周期分析的染色方法和流式细胞仪 阅读提示:Materials and methods, Cell proliferation experiment and Cell cycle analysis;Figure 2 |
| 侵袭和迁移 | Transwell小室孔径、Matrigel浓度、细胞密度、培养时间;划痕实验的细胞密度和成像时间 阅读提示:Materials and methods, Invasion assay and Migration experiment;Figure 3 |
| 体内移植瘤模型 | 动物品系、数量、分组、细胞注射剂量和途径、肿瘤测量频率和时间 阅读提示:Materials and methods, In vivo xenograft model of ovarian cancer;Figure 4 |
| 通路抑制实验 | PI3K抑制剂浓度(25 μM)和溶剂对照(0.1% DMSO),处理时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods, Signalling pathway inhibition;Figure 6 |