检测CTSB在再生环境中的表达
验证在有利于再生的长距离损伤模型中CTSB表达是否上调。
采用RT-qPCR和Western blot检测长距离损伤组和对照组视神经中溶酶体酶(包括CTSB)的mRNA和蛋白表达,并检测纤维连接蛋白表达。
Cathepsin B promotes optic nerve axonal regeneration.
研究包含体外细胞实验、体内动物模型及定量蛋白质组学等多层级验证,并明确功能与机制验证。
Sprague-Dawley大鼠视神经挤压伤模型 Sprague-Dawley大鼠长距离挤压伤模型 原代皮层神经元 BV2小胶质细胞系
大鼠品系和年龄:Sprague-Dawley, 8周龄 视神经损伤模型:传统ONC(挤压10秒)和长距离挤压伤模型 CTSB局部给药:200 μg/ml,第3天给予 轴突再生计数:CTB标记,损伤后21天,距损伤处200-1500 μm BV2细胞激活:IL-4和IL-6(各20 ng/ml)处理48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证在有利于再生的长距离损伤模型中CTSB表达是否上调。
采用RT-qPCR和Western blot检测长距离损伤组和对照组视神经中溶酶体酶(包括CTSB)的mRNA和蛋白表达,并检测纤维连接蛋白表达。
探究CTSB是否能在体外减轻CSPGs对神经元突起生长的抑制作用。
分离培养胎鼠原代皮层神经元,分为对照组、CSPGs组和CTSB处理CSPGs组,培养5天后用βIII微管蛋白免疫荧光染色测量突起长度。
评估在视神经挤压伤部位局部给予CTSB能否降解CSPGs并促进轴突再生。
在大鼠视神经挤压伤后第3天,局部给予缓冲液、CTSB或leupeptin,第7天Western blot检测CTSB和neurocan水平,第21天通过CTB顺行标记计数损伤区后的再生轴突。
探究CTSB表达上调是否与小胶质细胞激活相关。
对LI组和对照组在损伤后第3、7、14天的视神经进行定量蛋白质组学,分析小胶质细胞标志物(Iba-1, HexB, CD14, ferritin, Arg-1)的表达。
验证激活的STAT3和STAT6通路是否促进小胶质细胞中CTSB的表达。
用IL-4和IL-6激活BV2细胞,Western blot和免疫荧光检测STAT3、STAT6、IRE1α和CTSB的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 眼科镊 | Jinzhong | YAI020 |
| 显微手术镊 | Jinzhong | WA3010 | |
| 药物处理 | 酵母聚糖 | -- | -- |
| 亮抑酶肽 | -- | -- | |
| 组织蛋白酶B | -- | -- | |
| 轴突标记 | 霍乱毒素B亚基 | -- | -- |
| 细胞培养 | neurobasal培养基 | -- | -- |
| B27添加剂 | -- | -- | |
| 硫酸软骨素蛋白聚糖 | -- | -- | |
| 白细胞介素-4 | Peprotech | 214-14 | |
| 白细胞介素-13 | Peprotech | 210-13 | |
| 免疫荧光 | 抗βIII微管蛋白抗体 | Invitrogen | MA1-118 |
| 抗STAT3抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 抗STAT6抗体 | Proteintech | 82630-1-RR | |
| 抗IRE1α抗体 | Proteintech | 27528-1-AP | |
| 抗CTSB抗体 | Proteintech | 12216-1-AP | |
| RT-qPCR | 动物组织总RNA提取试剂盒 | Tiangen Biotech | DP431 |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | R323-011 | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液试剂盒 | Vazyme | Q711 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | -- | -- | |
| 抗纤维连接蛋白抗体 | Proteintech | 15613-1-AP | |
| 抗neurocan抗体 | Proteintech | 27087-1-AP | |
| 成像 | EVOS倒置荧光显微镜 | -- | -- |
| Leica DM4B正置荧光显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、年龄、性别、体重、饲养条件 阅读提示:Materials and methods - Animal models |
| 视神经损伤 | 损伤类型(ONC vs LI)、损伤位置、挤压时间、力度、工具 阅读提示:Materials and methods - Animal models |
| CTSB局部给药 | 给药时间(损伤后第3天)、剂量(200 μg/ml)、体积、给药方式(明胶海绵)、手术细节 阅读提示:Materials and methods - Experimental groups |
| 轴突再生评估 | CTB注射时间(损伤后第19天)、剂量(5 μl)、浓度(1 mg/ml)、固定时间、切片厚度、计数方法 阅读提示:Materials and methods - Cholera toxin subunit B anterograde labeled axons; Counting of regenerated axons |
| 体外神经元培养 | 神经元来源(胎鼠)、培养条件(培养基、B27、KCl)、CSPGs浓度(5 μg/ml)、CTSB处理条件、培养时间(5天) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and groups - Primary cortical neurons |
| BV2细胞激活 | BV2细胞来源、IL-4和IL-13浓度(20 ng/ml)、处理时间(48小时)、细胞密度 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and groups - BV2 culture and group |