SETDB2在透明细胞肾细胞癌中的预后作用：连接免疫浸润、铜死亡与肿瘤抑制

背景：透明细胞肾细胞癌（ccRCC）是一种相对常见的泌尿系统癌症，恶性程度高，患者死亡率高。目前，晚期ccRCC的有效治疗选择很少，强调需要建立适合治疗干预的新型生物标志物和靶点。SET结构域分叉组蛋白赖氨酸甲基转移酶2（SETDB2）属于甲基转移酶的Su(var)3-9亚家族，与多种癌症有关，但它在ccRCC中的作用尚未完全确定。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库下载SETDB2表达数据。然后使用功能富集分析来探讨SETDB2在ccRCC发生中可能发挥的作用。利用基因集癌症分析（GSCA）平台和分子对接分析来研究基因表达与药物敏感性之间的关系。最后，核心靶点和活性分子都获得了分子对接研究的批准。使用ccRCC细胞系进行的功能测定和Western blotting用于验证这些预测分析的结果。结果：在ccRCC中观察到SETDB2下调，较低水平与患者不良预后相关。较低的SETDB2水平与较差的总生存期、无进展生存期和疾病特异性生存期相关。在功能富集分析中，SETDB2被预测调节关键的ccRCC发展相关通路。SETDB2水平也与KIRC组织中的铜死亡诱导显著相关，而在免疫细胞浸润分析中，SETDB2表达与肿瘤微环境中的免疫反应相关。使用ccRCC细胞系进行的功能实验揭示了SETDB2似乎能够抑制ccRCC发展的分子机制。结论：总之，这些分析强调了SETDB2作为ccRCC预后生物标志物的效用。通过这些分析检测到的相互作用和相关通路为SETDB2在这种癌症类型中的潜在功能提供了独特的见解，为未来的研究提供了证据基础。