建立T2D小鼠模型
通过不同持续时间的高脂饮食喂养诱导T2D,模拟疾病进展。
5周龄雄性C57BL/6J小鼠分别喂食HFD(60% kcal脂肪)4周和16周,对照组喂食正常饮食。
Integrated Phenotypic and Transcriptomic Analyses of Osteoporosis in Type 2 Diabetic Mice.
包含体外BMMSCs功能实验、体内动物模型、组织学、micro-CT、转录组和scRNA-seq分析,多层级验证。
高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型(4周和16周) 小鼠骨髓间充质干细胞(BMMSCs) 小鼠骨髓细胞(用于转录组和scRNA-seq分析)
HFD喂养持续时间:4周和16周 小鼠品系:5周龄雄性C57BL/6J小鼠 HFD配方:60 kcal%脂肪,D12492,Research Diets 对照组为正常饮食(NCD) 样本量:每组6只小鼠(部分实验N=3或4)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过不同持续时间的高脂饮食喂养诱导T2D,模拟疾病进展。
5周龄雄性C57BL/6J小鼠分别喂食HFD(60% kcal脂肪)4周和16周,对照组喂食正常饮食。
确认T2D模型的建立并评估疾病进展。
检测体重、随机血糖、空腹血糖、GTT、ITT、HbA1c和胰岛素水平。
评估T2D小鼠不同时间点的骨量和微结构变化。
使用micro-CT扫描股骨,分析小梁骨和皮质骨参数。
检测骨形成、骨吸收和免疫炎症相关标志物的变化。
免疫荧光染色检测RUNX2、TRAP、F4/80和TNF-α的表达;ELISA检测血清P1NP和CTX1。
全面分析T2D进展过程中骨髓基因表达谱的变化。
提取骨髓总RNA,进行RNA-seq,鉴定DEGs并富集分析。
鉴定重叠差异表达基因在骨髓细胞类型中的表达,特别是BMMSCs。
重新分析已发表的scRNA-seq数据集(GSE122467),聚类分析并检查39个重叠基因的表达。
验证转录组和scRNA-seq分析中上调的重叠基因在BMMSCs中的表达变化。
从HFD-4W、HFD-16W和对照组小鼠中分离BMMSCs,通过qRT-PCR检测Acsbg1、Nrap、Rorc、Scart1和Shtn1的表达。
检测BMMSCs的集落形成、增殖和分化能力的变化。
从HFD-4W、HFD-16W和对照组小鼠中分离BMMSCs,进行集落形成(结晶紫染色)、增殖(EDU)和分化(成骨:茜素红S;成脂:油红O)实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体内建模 | 高脂饮食(D12492) | Research Diets | D12492 |
| 血糖检测 | 血糖仪 | Roche | -- |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 人胰岛素 | Novo Nordisk AS | -- | |
| Micro-CT分析 | 微型CT系统(eXplore Locus SP) | GE Healthcare | -- |
| ELISA | 小鼠HbA1c ELISA试剂盒 | ENZO-2 | -- |
| 小鼠胰岛素ELISA试剂盒(超灵敏) | Beyotime | -- | |
| P1NP和CTX1 ELISA试剂盒 | Fankew | -- | |
| 转录组测序 | 红细胞裂解液 | Coollaber | -- |
| RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- | |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- | |
| AMPure XP系统 | Beckman Coulter | -- | |
| USER酶 | NEB | -- | |
| Agilent Bioanalyzer 2100 | Agilent | -- | |
| Qubit 2.0荧光计 | Invitrogen | -- | |
| IF染色 | 蔗糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| OCT包埋剂 | Leica | -- | |
| 冷冻切片机(CM1950) | Leica | -- | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 山羊血清 | BOSTER | -- | |
| 抗RUNX2抗体 | Cell Signaling | #12556 | |
| 抗TRAP抗体 | Abcam | ab191406 | |
| 抗F4/80抗体 | BioLegend | 123120 | |
| 抗TNF-α抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-52746 | |
| Alexa Fluor 488 驴抗兔IgG | Abcam | ab150073 | |
| Cy3亲和纯化山羊抗兔IgG | Yeasen | 33108ES60 | |
| Alexa Fluor 594 山羊抗小鼠IgG | Yeasen | 33212ES60 | |
| 含DAPI的封片剂 | Abcam | -- | |
| 共聚焦显微镜(FV1000) | Olympus | -- | |
| BMMSCs分离培养 | α-MEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Corning | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Procell | -- | |
| 70μm尼龙过滤器 | BD Falcon | -- | |
| 10cm细胞培养皿 | NEST | -- | |
| 1X TrypLE express | Invitrogen | -- | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Solarbio | -- |
| EDU增殖实验 | EDU | -- | -- |
| kFluor488-EdU细胞增殖检测试剂盒 | KeyGEN Biotech | -- | |
| 成骨分化实验 | 地塞米松 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗坏血酸 | MP Biomedicals | -- | |
| β-甘油磷酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 茜素红S | Sigma-Aldrich | -- | |
| 成脂分化实验 | 吲哚美辛 | MCE | -- |
| 异丁基甲基黄嘌呤 | MCE | -- | |
| 油红O | Aladdin | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Takara | -- |
| 逆转录试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | Takara | -- | |
| BIO-RAD CFX96实时PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T2D小鼠模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄;HFD配方、喂养时长;对照饮食 阅读提示:Materials and Methods: Animals, In vivo modeling |
| 葡萄糖代谢评估 | GTT和ITT中葡萄糖和胰岛素的剂量、给药途径、时间点;空腹时间 阅读提示:Materials and Methods: Blood glucose detection |
| 骨微结构分析 | micro-CT扫描参数、ROI定义 阅读提示:Materials and Methods: Micro-CT analysis |
| 组织学和ELISA | 抗体浓度、孵育条件;ELISA试剂盒来源和检测的血清标志物 阅读提示:Materials and Methods: IF staining, ELISA |
| 转录组测序和分析 | RNA提取方法、测序平台、DEGs筛选阈值、富集分析数据库 阅读提示:Materials and Methods: Transcriptome sequencing |
| 单细胞RNA测序分析 | scRNA-seq数据来源、质控标准、聚类方法 阅读提示:Materials and Methods: Re-analysis of scRNA-seq data |
| BMMSCs功能实验 | BMMSCs分离和培养条件、细胞密度、诱导时间、染色方法 阅读提示:Materials and Methods: Isolation and culture of murine BMMSCs, Colony forming, EDU, Osteogenic, Adipogenic |
| qRT-PCR | 引物序列、反应条件、内参基因选择 阅读提示:Materials and Methods: RNA extraction and qRT-PCR assay |