临床样本分析
评估TFRC在EC组织中的表达水平及其与预后的关系。
使用TCGA数据库分析TFRC mRNA水平;IHC染色检测TFRC蛋白表达,并分析其与临床病理特征和总生存期的关系。
Transferrin Receptor Promotes Endometrial Cancer Proliferation by Activating the Iron-Dependent PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway.
包含临床样本分析、细胞功能实验、机制验证及体内异种移植模型等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
子宫内膜癌临床样本(82例EC组织和14例正常子宫内膜组织) Ishikawa和HEC细胞系 HEC细胞异种移植裸鼠模型
TFRC在EC组织中的表达水平及与预后的关系(IHC评分,OS) TFRC敲低和过表达对EC细胞增殖的影响(CCK8、集落形成、EDU、细胞周期) TFRC对PI3K/AKT/mTOR通路磷酸化水平的影响(Western blot) 铁调节剂FAC和DFO对通路和增殖的逆转作用 AURKA对TFRC表达的转录调控(qRT-PCR和Western blot)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TFRC在EC组织中的表达水平及其与预后的关系。
使用TCGA数据库分析TFRC mRNA水平;IHC染色检测TFRC蛋白表达,并分析其与临床病理特征和总生存期的关系。
验证TFRC对EC细胞增殖的影响。
在Ishikawa和HEC细胞中敲低或过表达TFRC,通过CCK8、集落形成、EDU染色和细胞周期实验检测增殖能力。
验证TFRC是否通过PI3K/AKT/mTOR通路发挥作用,并确认铁依赖性。
用Western blot检测通路蛋白磷酸化水平;用FAC或DFO处理细胞,观察通路和增殖的恢复或抑制;用雷帕霉素处理TFRC过表达细胞,观察通路和增殖的变化。
探究AURKA是否调控TFRC表达。
在Ishikawa和HEC细胞中敲低或过表达AURKA,用qRT-PCR和Western blot检测TFRC mRNA和蛋白水平,同时检测β-catenin蛋白水平。
验证TFRC敲低和雷帕霉素对EC肿瘤生长的影响。
将HEC-shTFRC或对照细胞皮下注射到裸鼠,并给予雷帕霉素处理,监测肿瘤体积和重量,IHC检测Ki-67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Pricella | -- |
| 胎牛血清 | Pricella | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Pricella | -- | |
| 细胞转染 | 慢病毒 | GeneChem | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂 | Beyotime | C0037 |
| 集落形成 | 结晶紫 | Beyotime | -- |
| EDU染色 | EDU染色试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| 细胞周期 | PI/RNase染色缓冲液 | BD | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| ECL检测试剂 | Yeasen | 36208ES60 | |
| AURKA抗体 | CST | 14475T | |
| β-catenin抗体 | Proteintech | 51067-2-AP | |
| TFRC抗体 | Abcam | ab214039 | |
| p-PI3K抗体 | CST | 62098S | |
| PI3K抗体 | Abcam | ab191606 | |
| p-AKT抗体 | Abcam | ab192623 | |
| AKT抗体 | Abcam | ab179463 | |
| p-mTOR抗体 | Abcam | ab109268 | |
| mTOR抗体 | Abcam | ab179463 | |
| qRT-PCR | SYBR Green预混液 | Yeasen | 1184ES03 |
| 不稳定铁池检测 | 钙黄绿素-AM | Beyotime | T18931 |
| 甲磺酸去铁胺 | Absin | T1637 | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing Vital River Laboratory Animal Technology Co. Ltd. | -- |
| IHC | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| 药物处理 | 柠檬酸铁铵 | -- | -- |
| 雷帕霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集与TFRC表达分析 | IHC评分标准(0-12分,<7低表达,≥7高表达);样本量(82例EC组织,14例正常组织);TCGA数据(174例肿瘤,91例正常) 阅读提示:Material and Methods 2.1, 2.12; Results 3.1; Figure 1 |
| 细胞培养和转染 | 细胞系(Ishikawa, HEC, AN3, RL-952);培养条件(DMEM高糖+10%FBS+1%P/S);转染试剂(慢病毒,GeneChem);敲低/过表达序列(Table S1) 阅读提示:Material and Methods 2.2, 2.3; Figure 2a-b |
| 体外功能实验 | 细胞数量(CCK8:5000/孔;集落形成:3000/孔);培养时间(集落14天);EDU染色步骤;细胞周期染色步骤 阅读提示:Material and Methods 2.4-2.7; Results 3.2; Figures 2,3 |
| 机制验证 | FAC处理浓度(文中未明确说明)、DFO浓度(100μM用于不稳定铁池);雷帕霉素处理浓度(文中未明确说明);Western blot抗体及稀释度 阅读提示:Material and Methods 2.8, 2.10; Results 3.3, 3.4; Figures 4-6 |
| 体内异种移植实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠,6周龄);接种细胞数(3×10^6);观察时间(6周);肿瘤体积计算公式;雷帕霉素注射方案(文中未明确说明) 阅读提示:Material and Methods 2.11; Results 3.6; Figure 8 |