表达分析
检测CARD19在缺血性卒中后小胶质细胞中的表达变化。
利用空间转录组数据、qPCR、Western blot和免疫荧光检测MCAO小鼠及LPS/OGD/R处理的细胞中CARD19表达。
Microglial CARD19 ameliorates post-stroke neuroinflammation by stabilizing mitochondrial cristae.
包含多层级验证:体外细胞模型(原代小胶质细胞、BV2)、体内小鼠MCAO模型、空间转录组分析、功能验证(行为学、梗死体积)及机制验证(IP-MS、Co-IP、线粒体结构功能检测)。
小鼠MCAO模型 原代小胶质细胞 BV2小胶质细胞系
Tmem119Cre/ERT2小鼠脑内立体定位注射AAV-shCARD19敲低小胶质细胞CARD19 MCAO手术:线栓法阻塞大脑中动脉60分钟 PLX5622(CSF1R抑制剂)喂养2周耗竭小胶质细胞 LPS刺激(500 ng/mL)和OGD/R处理小胶质细胞 DNase I处理(3 mg/kg/d)清除胞质mtDNA
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测CARD19在缺血性卒中后小胶质细胞中的表达变化。
利用空间转录组数据、qPCR、Western blot和免疫荧光检测MCAO小鼠及LPS/OGD/R处理的细胞中CARD19表达。
验证小胶质细胞CARD19缺失对卒中后脑损伤的影响。
通过AAV-shCARD19敲低Tmem119Cre/ERT2小鼠小胶质细胞CARD19,进行MCAO手术,评估梗死体积、神经行为缺陷和神经元死亡。
检测CARD19缺失对神经炎症的影响。
观察小胶质细胞形态,检测促炎因子IL-1β、TNF-α、IL-6的表达。
探究CARD19对线粒体嵴结构和功能的影响。
通过透射电镜观察线粒体形态,检测线粒体膜电位、ROS、mtDNA释放和IFN-I反应。
验证CARD19与MIB组分相互作用并促进其组装。
通过免疫沉淀-质谱筛选互作蛋白,Co-IP验证CARD19与MIC19、SAMM50、MIC60的相互作用,并检测OGD/R条件下MIB组分的结合变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | GemPharmatech | -- |
| Tmem119Cre/ERT2小鼠 | Model Organisms | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141C | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| BV2细胞 | Pricella | CL-0493 | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | HY-D1056 |
| 无糖DMEM | Gibco | 11966-025 | |
| 蛋白提取 | NP-40裂解液 | Beyotime | -- |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| CARD19抗体 | Abclonal | A13196 | |
| GAPDH抗体 | Bioworld Technology | MB66349 | |
| β-actin抗体 | Bioworld Technology | AP0060 | |
| MIC19抗体 | Abclonal | A8584 | |
| MIC60抗体 | Abclonal | A2751 | |
| SAMM50抗体 | Abclonal | A3401 | |
| Flag抗体 | Abclonal | AE063 | |
| HRP偶联二抗 | Bioworld Technology | BS22357 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Vazyme | E411-04 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Beyotime | -- |
| MIC19抗体 | Abclonal | A8584 | |
| Flag抗体 | Abclonal | AE063 | |
| IgG | Millipore | PP64B | |
| 质谱分析 | SimplyBlue安全染色剂 | Thermo Fisher Scientific | LC6060 |
| EASY-nLC1200液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q-Exactive质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | CARD19抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-89068 |
| Iba1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| TMEM119抗体 | Synaptic Systems | 400011 | |
| dsDNA抗体 | Abcam | Ab27156 | |
| CD31抗体 | Abcam | ab64543 | |
| NeuN抗体 | Abcam | ab104224 | |
| GFAP抗体 | Cell Signaling Technology | 3670 | |
| HSP60抗体 | Promab | 30193 | |
| Alexa Fluor二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21202 | |
| DAPI染色液 | Bioworld Technology | BD5010 | |
| 免疫荧光成像 | 奥林巴斯FV3000共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Abbkine | KTA2010 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Abclonal | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-PE/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 流式细胞术 | Accuri C6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| RNA提取 | FreeZol RNA提取试剂 | Vazyme | R711-01 |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | Vazyme | R323-01 |
| qPCR | ChamQ Blue Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q321-02 |
| 基因组DNA提取 | 基因组DNA提取试剂盒 | Beyotime | -- |
| 电镜 | 醋酸铀 | SPI | -- |
| LEICA EM UC7超薄切片机 | Leica | -- | |
| HT7800透射电子显微镜 | Hitachi High-Tech | -- | |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染色液 | Beyotime | -- |
| 神经元退化染色 | Fluoro-Jade B | Biosensis | TR-150-FJB |
| 乙酸 | Zhanyun | -- | |
| 小胶质细胞耗竭 | PLX5622 | SYSE BIO | 20010801 |
| 药物处理 | 他莫昔芬 | MCE | HY-13757A |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 10104159001 | |
| 影像 | RFLSI ZW激光散斑血流成像系统 | RWD | -- |
| RFLSI分析软件 | RWD | -- | |
| 立体定位注射 | 腺相关病毒 | Brainvta | -- |
| 显微镜 | 体视显微镜 | AGONGYIQI | -- |
| ELISA读板 | Spark多功能酶标仪 | TECAN | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 雄性C57BL/6J或Tmem119Cre/ERT2小鼠,8周龄,体重22-25g;MCAO手术:60分钟阻塞,监测脑血流降至初始70%;饲养条件:SPF级,温度约22℃,湿度40%-70%,12/12小时光照周期 阅读提示:Methods: Animals; Middle cerebral artery occlusion model |
| 小胶质细胞条件性敲低 | 立体定位注射AAV-shCARD19至三个位点,坐标:中线右侧3mm,前囟后0.3mm,前囟前0.9mm和1.8mm,腹侧1.8mm;注射体积200nl,速率20nl/min;他莫昔芬诱导剂量75mg/kg/天,连续5天;MCAO在注射后25天进行 阅读提示:Methods: Stereotaxic intracranial injection; Figure 4 legend |
| 细胞培养与处理 | 原代小胶质细胞:1日龄C57BL/6J小鼠,10天培养后振摇收集;BV2细胞:培养于DMEM+10%FBS+1%双抗;LPS刺激浓度500ng/mL,处理3小时;OGD/R:无糖DMEM,缺氧4小时,复氧24小时 阅读提示:Methods: Cell culture; Lipopolysaccharide stimulation; Oxygen–glucose deprivation/reoxygenation |
| 线粒体功能检测 | 线粒体膜电位用TMRE染色液室温孵育30分钟;MitoSOX工作液浓度5μM,37℃孵育30分钟;胞质mtDNA提取:使用含洋地黄皂苷的缓冲液,离心17000×g 25分钟;qPCR检测D-Loop和ND1 阅读提示:Methods: Mitochondrial membrane potential detection; Mitochondrial superoxide indicator staining; Quantitative polymerase chain reaction analysis of cytosolic mtDNA |
| 神经功能评估 | 行为学测试:foot fault、mNSS、rotarod(40 r/min)、grip strength;梗死体积用TTC染色,ImageJ计算,公式:梗死体积比=(对侧面积-同侧非梗死面积)/对侧面积×100%;FJB染色计数阳性细胞 阅读提示:Methods: Sensorimotor behavioral tests; Infarct volume measurement; Fluoro-Jade B staining |