细胞活力与ROS检测
评估紫草酸对BV2细胞活力的影响及对LPS诱导的ROS产生的抑制作用。
采用CCK-8法检测不同浓度紫草酸处理24小时后的细胞活力,并用DCFH-DA探针检测ROS水平。
Lithospermic acid targeting heat shock protein 90 attenuates LPS-induced inflammatory response via NF-кB signalling pathway in BV2 microglial cells.
包含体外细胞实验(LPS诱导BV2细胞)、分子对接、靶点预测及siRNA敲低验证,具备功能验证和机制验证。
BV2小鼠小胶质细胞(LPS诱导神经炎症模型)
紫草酸预处理浓度:25、50、100 µM,预处理1小时 LPS刺激浓度:1 µg/ml,刺激24小时 HSP90 siRNA敲低(序列:5′-CCCACTGCTTCTTTGTATA-3′) 炎症指标检测:IL-6、IL-1β、TNF-α、NO、PGE2、iNOS、COX2 NF-κB p65核转位检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估紫草酸对BV2细胞活力的影响及对LPS诱导的ROS产生的抑制作用。
采用CCK-8法检测不同浓度紫草酸处理24小时后的细胞活力,并用DCFH-DA探针检测ROS水平。
验证紫草酸是否抑制LPS诱导的NF-κB p65核转位及下游促炎细胞因子的表达和分泌。
通过免疫荧光和免疫印迹检测NF-κB p65的分布;通过qPCR和ELISA检测IL-6、IL-1β、TNF-α的mRNA和蛋白水平。
验证紫草酸对LPS诱导的COX2/PGE2和iNOS/NO表达的抑制作用。
通过qPCR、免疫荧光和免疫印迹检测COX2和iNOS表达,通过ELISA和Griess试剂分别检测PGE2和NO水平。
验证紫草酸对LPS诱导的BV2细胞迁移的抑制作用。
采用伤口愈合实验和Transwell实验检测细胞迁移能力。
预测紫草酸的潜在靶点并验证其与HSP90的结合。
利用SwissTargetPrediction预测靶点,结合RNA-seq数据确定候选基因,构建PPI网络;使用CB-Dock2进行分子对接。
验证紫草酸对HSP90活性和表达的抑制作用。
通过免疫印迹检测HSP90和HSP70的表达水平,以HSP70升高作为HSP90活性抑制的间接指标。
验证HSP90在LPS诱导炎症中的关键作用。
用HSP90 siRNA转染BV2细胞,72小时后检测敲低效率,并检测炎症指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0048S |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma | L4391 |
| 紫草酸 | MCE | HY-N0823 | |
| 核质分离 | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0027 |
| 免疫印迹 | 抗iNOS抗体 | CST | 13,120 |
| 抗COX2抗体 | CST | 12,282 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | CST | 8242 | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| 抗Histone H3抗体 | CST | 4499 | |
| 抗HSP90抗体 | CST | 4874 | |
| 抗HSP70抗体 | CST | 4876 | |
| 抗β-Actin抗体 | CST | 3700 | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Boster Bio | EK0394 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Boster Bio | EK0411 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Boster Bio | EK0527 | |
| PGE2 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0173 | |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342染料 | Sigma | B2261 |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033 |
| NO检测 | Griess试剂盒 | Beyotime | S0021S |
| 细胞染色 | 结晶紫染色液 | Beyotime | C0121 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Yeasen | 19221ES50 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Yeasen | 11141ES10 |
| PCR扩增 | PCR扩增试剂盒 | Yeasen | 11184ES08 |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 免疫印迹 | BeyoECL Star化学发光试剂 | Beyotime | P0018 |
| X射线胶片 | Beyotime | FF082 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| 细胞培养 | BV2细胞系 | Procell | CL-0493 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力与ROS检测 | 紫草酸预处理浓度(25、50、100 µM)及时间(1小时),LPS浓度(1 µg/ml)及刺激时间(24小时),细胞接种密度(96孔板1×10^4/孔,24孔板5×10^4/孔) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay, Intracellular ROS generation analysis; Figure 1 |
| NF-κB信号通路检测 | NF-κB p65核转位检测方法(免疫荧光、核质分离),下游细胞因子mRNA和蛋白检测(qPCR、ELISA),紫草酸剂量依赖性 阅读提示:Materials and methods: Cytosolic and nuclear fractionation, Immunoblotting, Immunofluorescence, Real-time PCR, ELISA; Figure 2 |
| 炎症介质检测 | COX2、iNOS表达检测(qPCR、免疫荧光、免疫印迹),NO(Griess试剂)和PGE2(ELISA)水平检测 阅读提示:Materials and methods: NO generation determination, ELISA; Figures 3, 4 |
| 细胞迁移检测 | 伤口愈合实验和Transwell实验的条件(LPS浓度1 µg/ml,紫草酸浓度100 µM,处理24小时) 阅读提示:Materials and methods: Wound healing assay, Transwell migration assay; Figure 5 |
| 靶点预测与分子对接 | SwissTargetPrediction预测参数(物种限制为Mus musculus),RNA-seq数据来源(NCBI SRA,编号),分子对接软件(CB-Dock2)及HSP90结构建模方法 阅读提示:Materials and methods: Identification of lithospermic acid targets, Molecular docking and simulation; Figure 6 |
| HSP90抑制验证 | 紫草酸浓度梯度(存在或不存在LPS),HSP90和HSP70蛋白表达检测 阅读提示:Materials and methods: Immunoblotting; Figure 7 |
| siRNA敲低验证 | HSP90 siRNA序列(5′-CCCACTGCTTCTTTGTATA-3′),转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX),敲低时间(72小时),敲低效率检测(qPCR、免疫印迹),炎症指标检测 阅读提示:Materials and methods: Small interfering RNA; Figure 8 |