临床样本分析
评估SLC31A1在ER阳性乳腺癌中的表达及其与复发、预后的关系。
收集85例ER阳性乳腺癌组织及配对正常组织,采用RT-qPCR、IHC和IF检测SLC31A1表达,结合TCGA数据库进行生存分析。
SLC31A1 promotes chemoresistance through inducing CPT1A-mediated fatty acid oxidation in ER-positive breast cancer.
包含临床样本分析、体外细胞实验(增殖、侵袭、凋亡)、机制研究(RNA-seq、FAO测定)和体内异种移植瘤模型验证,多层级证据支持。
ER阳性乳腺癌细胞系T47D和MCF7及其TAM耐药亚系T47D/TR和MCF7/TR BALB/c-nu/nu裸鼠异种移植瘤模型
ER阳性乳腺癌细胞系T47D和MCF7,以及TAM耐药亚系T47D/TR和MCF7/TR SLC31A1敲低(shRNA)和过表达(质粒) TAM处理浓度(0-20 μM,常用2.5 μM)和时间(24小时) CPT1A抑制(siRNA或ETO) 铜处理(CuSO4浓度1-10 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SLC31A1在ER阳性乳腺癌中的表达及其与复发、预后的关系。
收集85例ER阳性乳腺癌组织及配对正常组织,采用RT-qPCR、IHC和IF检测SLC31A1表达,结合TCGA数据库进行生存分析。
验证SLC31A1对ER阳性乳腺癌细胞增殖、侵袭和TAM敏感性的影响。
在T47D、MCF7及TAM耐药亚系中敲低或过表达SLC31A1,通过CCK-8、EdU、Transwell检测细胞活力、增殖和侵袭。
阐明SLC31A1调控TAM耐药的分子机制,特别是与FAO和CPT1A的关系。
通过RNA-seq分析T47D/TR细胞中SLC31A1敲低后的差异基因,检测铜水平、FAO速率、ATP和CPT1A表达。
验证铜和CPT1A在SLC31A1介导的FAO和TAM耐药中的作用。
用CuSO4处理细胞观察CPT1A表达,敲低或抑制CPT1A检测凋亡、FAO和ATP。
验证SLC31A1敲低对TAM耐药乳腺癌体内生长和TAM敏感性的影响。
将MCF7/TR细胞皮下注射到裸鼠,分为对照组、TAM组、shSLC31A1组和TAM+shSLC31A1组,测量肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | #10313021 |
| DMEM/F-12培养基 | Gibco | #11320033 | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | #11875093 | |
| MEM培养基 | Gibco | #11095080 | |
| 胰岛素 | Sigma Aldrich | #11061-68-0 | |
| 胎牛血清 | Gibco | #10091148 | |
| 青霉素-链霉素 | Wuhan Pricella Biotechnology | #PB180120 | |
| 药物处理 | 他莫昔芬 | MedChemExpress | #HY-13757A |
| 硫酸铜 | Sigma Aldrich | #7758-98-7 | |
| 依托莫司 | MedChemExpress | #HY-50202 | |
| 四硫代钼酸盐 | MedChemExpress | #HY-128530 | |
| 棕榈酸 | Beyotime Biotechnology | #ST3329 | |
| 油酸 | Sigma Aldrich | #60-33-3 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | #L3000015 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | #51985034 | |
| 嘌呤霉素 | Sigma Aldrich | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Takara | -- |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | -- | |
| Hieff qPCR SYBR Green预混液 | YEASEN | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | #P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime Biotechnology | #P1049 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | #P0009 | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Beyotime Biotechnology | #ST023 | |
| ECL增强化学发光检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | #34095 | |
| SLC31A1抗体 | Abcam | #ab129067 | |
| CPT1A抗体 | Proteintech Group Inc. | #66039-1-Ig | |
| ERα抗体 | Proteintech Group Inc. | #21244-1-AP | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | #4967 | |
| cleaved Caspase-3抗体 | Absin | #abs132005 | |
| cleaved PARP抗体 | Absin | #abs171752 | |
| 兔抗小鼠IgG H&L (HRP) | Abcam | #ab6728 | |
| 羊抗兔IgG H&L (HRP) | Abcam | #ab6721 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime Biotechnology | #P0096 |
| 山羊血清 | Beyotime Biotechnology | #C0265 | |
| DAPI | Beyotime Biotechnology | #P0131 | |
| SLC31A1抗体 | Proteintech Group Inc. | #67221-1-Ig | |
| ERα抗体 | Proteintech Group Inc. | #21244-1-AP | |
| Actin抗体 | Proteintech Group Inc. | #66009-1-Ig | |
| cleaved Caspase-3抗体 | Absin | #abs132005 | |
| 羊抗小鼠IgG H&L (Alexa Fluor 647) | Abcam | #ab150115 | |
| 羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488) | Abcam | #ab150077 | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂 | Beyotime Biotechnology | #C0038 |
| EdU试剂盒 | Beyotime Biotechnology | #C0071L | |
| 凋亡分析 | Annexin V-YSFluor 647/PI凋亡检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- |
| 流式分析 | Gallios流式细胞仪 | Beckman Coulter Inc. | -- |
| 侵袭分析 | Matrigel基底膜基质 | Corning | #354230 |
| 铜浓度测定 | iCAP Q电感耦合等离子体质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| FAO速率测定 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime Biotechnology | #C3601 |
| 脂肪酸氧化速率检测试剂盒 | Haling | #HL50679 | |
| ATP检测 | ATP微孔板检测试剂盒 | Absin | #abs580117 |
| 线粒体染色 | MitoTracker Green线粒体染料 | Beyotime Biotechnology | #C1048 |
| Hoechst 33342染料 | Beyotime Biotechnology | #C1029 | |
| 脂滴染色 | BODIPY 493/503染料 | Beyotime Biotechnology | #C2053S |
| 动物实验 | BALB/c-nu/nu裸鼠 | Vital River Laboratory Animal Technology Co. Ltd | -- |
| 组织学染色 | H&E染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | #C0105S |
| KI-67抗体 | Absin Biotechnology | #abs145260 | |
| CPT1A抗体 | Proteintech Group Inc. | #66039-1-Ig | |
| N-Cadherin抗体 | Absin Biotechnology | #abs121341 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(T47D, MCF7, BT474, ZR-75-1等)及培养基条件 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cells and culture' |
| TAM耐药细胞系构建 | TAM浓度(1 μM)和处理时间(6个月) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cells and culture' |
| 基因敲低和过表达 | shRNA和过表达质粒的序列/载体信息,转染试剂和剂量 阅读提示:Materials and methods 中的 'In vitro transfection' |
| 药物处理 | TAM浓度(2.5 μM)、铜(CuSO4)浓度(1-10 μM)、CPT1A抑制剂ETO浓度(10 μM)及处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cells and culture' 和 figure legends |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c-nu/nu)、年龄(6-8周)、性别(雌性)、每组数量(4只)、TAM给药剂量(2 mg/kg)和途径(口服) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Tumor inoculation and treatments' |