建立MIA小鼠模型并确认炎症反应
模拟母体免疫激活,验证胎儿脑组织炎症状态。
对孕鼠E9.5腹腔注射Poly(I:C)(20 mg/kg),24小时后取E10.5胎儿脑组织,通过ELISA检测母体血清和RT-qPCR检测胎儿脑组织中促炎细胞因子表达。
PIWI-interacting RNA MIABEPIR regulates cerebral endothelial cell function via DAPK2 pathway in offspring following maternal immune activation.
包含体外细胞实验、体内动物模型及患者样本分析等多层级验证,并通过功能获得与缺失实验、机制验证(荧光素酶报告基因、自噬检测)等证实结论。
bEnd.3小鼠脑微血管内皮细胞系 C57BL/6J小鼠MIA模型(Poly(I:C)诱导) 胎儿颅内注射MIABEPIR慢病毒小鼠模型
MIA模型:孕鼠E9.5腹腔注射Poly(I:C)(20 mg/kg,5 mL/kg) 细胞处理:bEnd.3细胞转染MIABEPIR mimics或inhibitors(100 nM,Lipofectamine 2000) 体外炎症刺激:Poly(I:C)(10 μg/mL)、IL-6、IL-1β、TNF-α、CCL-2(各50 ng/mL) BBB功能检测:TEER测量和4.4 kDa TRITC-右旋糖酐、70 kDa FITC-右旋糖酐通透性测定 体内BBB完整性:P60天Evans blue染料外渗实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟母体免疫激活,验证胎儿脑组织炎症状态。
对孕鼠E9.5腹腔注射Poly(I:C)(20 mg/kg),24小时后取E10.5胎儿脑组织,通过ELISA检测母体血清和RT-qPCR检测胎儿脑组织中促炎细胞因子表达。
鉴定MIA胎儿脑中异常表达的piRNA,并验证候选piRNA的表达和定位。
对E10.5胎儿脑组织进行piRNA微阵列分析,筛选差异表达piRNA;通过RT-qPCR验证表达;通过FISH和免疫荧光确定MIABEPIR定位于CD31阳性内皮细胞。
验证MIABEPIR对脑微血管内皮细胞功能的影响。
在bEnd.3细胞中过表达或抑制MIABEPIR,使用CCK-8、Ki67染色和流式细胞术检测增殖和周期;管形成实验评估血管生成;Transwell实验测量TEER和右旋糖酐通透性评估BBB完整性;RT-qPCR和Western blot检测紧密连接蛋白表达。
探讨MIABEPIR影响内皮功能的分子机制。
对MIABEPIR过表达的BMECs进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,并进行GO富集分析。
确定MIABEPIR调控的下游靶分子。
整合miRanda预测靶基因和RNA-seq下调基因,筛选候选靶;通过双荧光素酶报告基因验证MIABEPIR与DAPK2 3'UTR的直接结合,并用RT-qPCR、Western blot检测DAPK2表达。
验证MIABEPIR通过DAPK2影响内皮细胞自噬。
通过LC3斑点免疫荧光、透射电镜观察自噬体,以及Western blot检测LC3-II和Beclin-1水平,评估MIABEPIR过表达对自噬的影响,并通过DAPK2过表达进行功能恢复实验。
在动物模型中验证MIABEPIR对血脑屏障完整性和自噬的影响。
在E13.5胎儿侧脑室注射MIABEPIR慢病毒,出生后P60天进行Evans blue外渗实验评估BBB通透性,并用RT-qPCR和Western blot检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MIA模型建立 | 聚肌苷酸-聚胞苷酸(Poly(I:C)) | APExBIO | B5551 |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Solarbio | 12100 |
| 胎牛血清(FBS) | ExCell | FCS500 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 10378016 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| 细胞处理 | 白细胞介素-6 | -- | -- |
| 白细胞介素-1β | -- | -- | |
| 肿瘤坏死因子-α | -- | -- | |
| CCL-2趋化因子 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | 细胞增殖检测试剂盒(CCK-8) | TransGen | FC101 |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | Beyotime | C1052 |
| 管形成实验 | 基质胶 | Corning | 356255 |
| 血管内皮生长因子A | Solarbio | P00145 | |
| 细胞通透性实验 | TRITC标记右旋糖酐(4.4 kDa) | Sigma | T1037 |
| FITC标记右旋糖酐(70 kDa) | Sigma | 46945 | |
| I型胶原蛋白 | Solarbio | C8062 | |
| 纤连蛋白 | Solarbio | F8180 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| KaiaoK5500分光光度计 | Kaiao | -- | |
| Agilent Bioanalyzer 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| 用于Illumina的RNA文库制备试剂盒 | -- | -- | |
| Illumina HiSeq测序平台 | Illumina | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pSI-Check2载体 | Promega | C8021 |
| Trans5α化学感受态细胞 | TransGen | CD201 | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| 海肾荧光素酶反应试剂 | TransGen | FR201 | |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| 透射电镜 | JEM1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 体内注射 | MIABEPIR慢病毒 | -- | -- |
| Evans blue通透性实验 | 伊文思蓝染料 | -- | -- |
| FISH | Cy3标记的MIABEPIR探针 | GenePharma | -- |
| 免疫荧光 | 兔抗CD31抗体 | Abcam | -- |
| 兔抗PDGFRβ抗体 | Abcam | -- | |
| 兔抗Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Coralight594标记山羊抗兔IgG | Proteintech | -- | |
| Coralight488标记山羊抗兔IgG | Proteintech | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒(IL-6、IL-1β、TNF-α、CCL-2) | R&D Systems | -- |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PerfectStart Green qPCR预混液 | TransGen | AQ601 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| 兔抗DAPK2抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 小鼠抗Occludin抗体 | Proteintech | -- | |
| 兔抗VE-Cadherin抗体 | Proteintech | -- | |
| 兔抗Beclin1抗体 | Abcam | -- | |
| 兔抗LC-3抗体 | Proteintech | -- | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG | Proteintech | -- | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Proteintech | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.0软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MIA模型建立 | Poly(I:C)剂量(20 mg/kg)、注射体积(5 mL/kg)、注射时间(E9.5)、对照组(0.9% NaCl) 阅读提示:见线2.1动物和MIA模型建立部分 |
| 细胞培养与处理 | bEnd.3细胞培养条件(高糖DMEM+10%FBS)、转染试剂(Lipofectamine 2000)及浓度(100 nM mimics/inhibitors)、炎症刺激条件(Poly(I:C) 10 μg/mL;细胞因子50 ng/mL,24h) 阅读提示:见线2.3细胞培养和处理部分 |
| BBB功能体外检测 | Transwell预涂胶原I(15 μg/mL)和纤连蛋白(30 μg/mL)、右旋糖酐浓度(2 mg/mL)、TEER测量条件、检测时间点(1h间隔,7h内) 阅读提示:见线2.7细胞通透性实验和结果3.4部分 |
| 体内BBB功能检测 | 慢病毒注射时间(E13.5)、注射方式(侧脑室)、Evans blue剂量(2% w/v,2 mL/kg)、检测时间(P60) 阅读提示:见线2.11和2.12及结果3.8部分 |
| 自噬检测 | LC3 puncta观察、TEM样本制备(固定、脱水、包埋)、自噬标记物(LC3-II、Beclin-1)抗体稀释比例 阅读提示:见线2.10透射电镜和结果3.7部分 |