细胞培养与转染
建立体外髓核细胞模型并进行miR-124-3p和CAPN1的过表达/敲低处理。
大鼠髓核细胞培养于DMEM/F12培养基(含10% FBS和1%青霉素-链霉素),使用Lipofectamine 2000转染miR-124-3p mimics、inhibitor、oe-CAPN1及对照,转染48小时。
Mechanism of microRNA-124-3p targeting calpain-1 to affect the function of intervertebral disc nucleus pulposus cells.
研究包含体外细胞实验、靶基因验证(双荧光素酶)和功能回补实验,但缺乏体内动物模型或临床样本验证。
大鼠椎间盘髓核细胞(NPCs,CP-R145)
miR-124-3p模拟物及抑制剂转染浓度和转染时间(48小时)需核实 CAPN1过表达质粒(oe-CAPN1)的转染效率 细胞培养条件:DMEM/F12培养基、10% FBS、1%青霉素-链霉素、37°C、5% CO2 实验分组:miR-124-3p mimics、miR-124-3p inhibitor、oe-CAPN1及各自阴性对照 检测指标:CCK-8、流式凋亡、Transwell迁移、Western blot(凋亡及ECM蛋白)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体外髓核细胞模型并进行miR-124-3p和CAPN1的过表达/敲低处理。
大鼠髓核细胞培养于DMEM/F12培养基(含10% FBS和1%青霉素-链霉素),使用Lipofectamine 2000转染miR-124-3p mimics、inhibitor、oe-CAPN1及对照,转染48小时。
检测miR-124-3p对髓核细胞增殖、凋亡和迁移的影响。
通过CCK-8、流式细胞术和Transwell实验分别评估细胞增殖、凋亡和迁移;Western blot检测凋亡相关蛋白(BAX、Cleaved-Caspase3、BCL-2)表达。
检测miR-124-3p对髓核细胞ECM合成和降解相关蛋白表达的影响。
通过Western blot检测ECM相关蛋白(Collagen I、Collagen II、Aggrecan、Fibronectin、MMP-13)的表达水平。
验证miR-124-3p与CAPN1的靶向结合关系。
使用Targetscan预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-124-3p与CAPN1 3'UTR的结合。
验证CAPN1过表达是否能够逆转miR-124-3p对NPC功能和ECM稳态的影响。
将miR-124-3p mimics和oe-CAPN1共转染NPCs,检测CAPN1表达、ECM相关蛋白、细胞增殖、迁移和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | 11320033 |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668030 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Axygen | AP-MN-MS-RNA-250 |
| RT-qPCR | PrimeScript逆转录试剂盒 | TaKaRa | RR037Q |
| SYBR Premix Ex Taq II荧光定量试剂 | Takara | RR390Q | |
| ABI7900HT快速实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| CCK-8增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| Transwell迁移实验 | Transwell聚碳酸酯膜小室 | Corning | 3422 |
| 结晶紫 | Beyotime | C0121 | |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Yeasen | 40302ES20 |
| BD FACSCanto II流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| Western blot | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH 20200 | |
| 兔抗β-Actin抗体 | CST | #4970 | |
| 兔抗BAX抗体 | CST | 5023 | |
| 兔抗Bcl-2抗体 | CST | 3498 | |
| 兔抗Cleaved Caspase-3抗体 | Abcam | ab32042 | |
| 兔抗Collagen I抗体 | Abcam | ab270993 | |
| 兔抗Collagen II抗体 | Abcam | ab34712 | |
| 兔抗MMP-13抗体 | Abcam | ab39012 | |
| 兔抗Aggrecan抗体 | Abcam | ab313636 | |
| 兔抗Fibronectin抗体 | Abcam | ab268020 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| 电化学发光工作液 | Millipore | WBKLS0500 | |
| 双荧光素酶实验 | pmiR-GLO荧光素酶载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | E1910 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(大鼠髓核细胞,CP-R145)、培养基(DMEM/F12)、血清浓度(10% FBS)、抗生素(1%青霉素-链霉素)、培养条件(37°C, 5% CO2)、传代时间(48-72小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染时间(48小时)、细胞融合度(60%) 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 增殖检测 | CCK-8试剂盒(C0038)、每孔细胞数、CCK-8孵育时间(2-3小时)、检测波长(450 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell counting kit-8 (CCK-8) assay |
| 迁移检测 | Transwell小室(8.0 μm孔径)、细胞数(2×10^4)、培养时间(24小时)、结晶紫染色 阅读提示:Materials and methods: Transwell assay |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI试剂盒、染色时间(15分钟)、流式细胞仪型号 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |
| 蛋白检测 | BCA蛋白定量、PVDF膜、一抗(抗BAX、BCL-2、Cleaved Caspase-3、Collagen I/II、MMP-13、Aggrecan、Fibronectin)、二抗(HRP标记)、内参(β-Actin) 阅读提示:Materials and methods: Western blot assay |
| 靶基因验证 | 双荧光素酶报告基因实验、CAPN1-WT/MUT质粒、共转染miR-124-3p mimics或对照 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter gene assay |