体外细胞模型建立及FOXG1表达检测
建立TNF-α诱导的大鼠DRG神经元损伤模型,并验证FOXG1在此模型中的表达变化。
使用大鼠DRG神经元(CP-R126),以10 ng/mL TNF-α处理48小时诱导损伤。通过免疫荧光鉴定神经元,RT-qPCR和Western blot检测FOXG1表达。
FOXG1 interaction with SATB2 promotes autophagy to alleviate neuroinflammation and mechanical abnormal pain in rats with lumbar disc herniation.
本研究包含细胞实验(TNF-α诱导DRG神经元)、动物模型(LDH大鼠)、分子机制验证(Co-IP、双荧光素酶报告基因)、功能验证(凋亡、炎症、自噬检测)以及miRNA测序等多层次证据。
大鼠背根神经节神经元(CP-R126,Procell,中国) Sprague Dawley (SD) 大鼠LDH模型
TNF-α浓度:10 ng/mL,处理时间:48小时 大鼠LDH模型的构建方法:手术穿刺L4-5椎间盘导致髓核突出至L5神经根 oe-FOXG1和si-SATB2的转染使用Lip2000,转染时间:48小时 分组设置:Control、TNF-α、oe-NC、oe-FOXG1、oe-FOXG1+si-NC、oe-FOXG1+si-SATB2 动物实验分组:Sham、LDH、oe-NC、oe-FOXG1,每组n=6
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立TNF-α诱导的大鼠DRG神经元损伤模型,并验证FOXG1在此模型中的表达变化。
使用大鼠DRG神经元(CP-R126),以10 ng/mL TNF-α处理48小时诱导损伤。通过免疫荧光鉴定神经元,RT-qPCR和Western blot检测FOXG1表达。
探讨过表达FOXG1是否抑制TNF-α诱导的神经元炎症和凋亡,并促进细胞增殖。
使用oe-FOXG1慢病毒转染DRG神经元,同时用TNF-α处理。通过流式细胞术检测凋亡,Western blot检测炎症因子(IL-1β、TGF-β1、IL-10)和增殖标志物(Cyclin D1、PCNA、Ki67)的表达。
分析副干酪乳杆菌S16对LDH大鼠外周血miRNA表达谱的影响,并筛选关键miRNA及其靶基因。
构建LDH大鼠模型,并给予副干酪乳杆菌S16(109 CFU/mL,0.1 mL/只/天,持续5周)处理。收集外周血,进行miRNA测序,分析差异表达miRNA,并进行靶基因预测和功能富集分析。
验证miR-31a-5p是否直接靶向SATB2,并检测LDH大鼠血清中miR-31a-5p和SATB2的表达水平。
通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-31a-5p与SATB2的结合。使用RT-qPCR检测大鼠血清中miR-31a-5p、SATB2及预测靶基因(IsI1、KIf5、Lats2)的表达。
验证FOXG1与SATB2蛋白之间是否存在直接相互作用。
使用TNF-α处理的DRG神经元,通过Co-IP实验检测FOXG1与SATB2的结合。
探究FOXG1是否通过SATB2来调节TNF-α诱导的神经元自噬、炎症和凋亡。
在TNF-α诱导的DRG神经元中,同时进行oe-FOXG1和si-SATB2处理。通过RT-qPCR和Western blot检测自噬相关蛋白(LC3II/I、Beclin-1、p62)、炎症因子(TGF-β1、IL-1β、IL-10)和增殖标志物(Cyclin D1、PCNA、Ki67)的表达,并通过流式细胞术检测凋亡。
在LDH大鼠模型中验证过表达FOXG1是否通过SATB2促进自噬、减轻炎症和凋亡,从而缓解LDH症状。
构建LDH大鼠模型,并通过腹腔注射oe-FOXG1或oe-NC(每周一次,持续5周)进行干预。通过PWT/L测定评估机械和热痛觉过敏,通过RT-qPCR、Western blot、TUNEL染色和ELISA检测相关分子表达和组织病理变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F-12培养基 | -- | -- |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 肿瘤坏死因子-α | CST | -- |
| 细胞转染 | Lip2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| 动物实验 | 副干酪乳杆菌S16 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告基因实验 | psiCHECK-2-Rat-SATB2-WT载体 | HonorGene | -- |
| psiCHECK-2-Rat-SATB2-Mut载体 | HonorGene | -- | |
| miR-31a-5p模拟物 | HonorGene | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | E1910 | |
| 化学发光检测仪 | Promega | GloMax | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo | 15596026 |
| mRNA提取试剂盒 | CWBIO | CW2569 | |
| miRNA提取试剂盒 | CWBIO | CW2141 | |
| UltraSYBR Mixture试剂盒 | CWBIO | CW2601 | |
| 定量PCR仪 | ABI | QuantStudio1 | |
| 细胞凋亡检测 | 胰蛋白酶 | Abcam | AWC0232 |
| Annexin V-APC | KGI Biotech | KGA1030 | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 抗β-tubulin-III抗体 | Abcam | ab78078 | |
| 抗IgG标记的荧光抗体 | Abiowell | AWS0004c | |
| DAPI | -- | -- | |
| 显微镜 | Motic | BA210T | |
| TUNEL染色 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | YEASEN | 40306ES50 |
| Co-IP | 免疫沉淀裂解缓冲液 | Abiowell | AWB0144 |
| Protein A/G琼脂糖珠 | -- | -- | |
| FOXG1抗体 | Abcam | ab196868 | |
| 正常IgG | Proteintech | B900610 | |
| Western blot | LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP |
| Beclin1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| p62抗体 | Proteintech | 66184-1-Ig | |
| SATB2抗体 | Proteintech | 67958-1-Ig | |
| Cyclin D1抗体 | Proteintech | 26939-1-AP | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 10205-2-AP | |
| Ki67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| TGF-β抗体 | Abiowell | AWA00083 | |
| IL-1β抗体 | Abiowell | AWA46641 | |
| IL-10抗体 | Abiowell | AWA44364 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| ELISA | TGF-β1 ELISA试剂盒 | Proteintech | KE20010 |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Proteintech | KE20003 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Proteintech | KE20021 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Proteintech | KE20001 | |
| 酶标仪 | HEALES | MB-530 | |
| miRNA测序 | RNA纯化试剂盒 | Norgen | 51000 |
| QIAseq miRNA文库构建试剂盒 | QIAGEN | 331505 | |
| Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 动物实验 | 刺痛针 | Zhongshi Dichuang Technology Development | ZS-CTY |
| tenderness灯杯 | Zhongshi Dichhuang Technology Development | ZS-PTM |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | DRG神经元细胞系(CP-R126),TNF-α浓度(10 ng/mL),处理时间(48小时),转染试剂(Lip2000),转染时间(48小时) 阅读提示:Methods - Cell experimental processing |
| 动物模型构建和干预 | SD大鼠(雄性,200-250g),LDH手术方法(L4-5椎间盘穿刺),L. paracasei S16剂量(109 CFU/mL,0.1 mL/只/天),给药时间(术前7天开始,持续5周),oe-NC/oe-FOXG1腹腔注射剂量和频率(每周一次,共5周) 阅读提示:Methods - The treatment in LDH rat |
| miRNA测序分析 | 外周血样本处理,RNA提取试剂盒(Norgen 51000),文库构建试剂盒(QIAGEN 331505),测序平台(Illumina Novaseq 6000),数据分析流程(UMI-Tools, cutadapt, Bowtie等) 阅读提示:Methods - miRNAseq |
| 分子机制验证 | Co-IP实验步骤(IP裂解缓冲液、Protein A/G琼脂糖珠、抗体),双荧光素酶报告基因实验(psiCHECK-2载体、miR-31a-5p mimics、293T细胞) 阅读提示:Methods - Co-IP, Methods - Dual luciferase reporter gene assay |