外泌体分离与鉴定
从乳腺癌细胞培养上清中提取外泌体并验证其特性
利用外泌体分离纯化试剂盒从MDA-MB-231细胞培养上清中提取外泌体,通过透射电镜观察形态,Nanosight系统检测粒径和浓度,Western blot检测外泌体标志物CD9、CD81和TSG101。
Tumor-derived exosomal miR-148b-3p mediates M2 macrophage polarization via TSC2/mTORC1 to promote breast cancer migration and invasion.
包含细胞共培养、外泌体分离鉴定、体外功能实验(增殖、迁移、侵袭)和机制验证(荧光素酶报告、Western blot),但缺少体内动物模型和临床样本验证。
MDA-MB-231乳腺癌细胞系 MCF-10A正常乳腺上皮细胞系 THP-1人单核细胞系诱导的巨噬细胞 间接共培养系统(MDA-MB-231与THP-1来源巨噬细胞)
外泌体分离和鉴定(透射电镜、Nanosight、CD9/CD81/TSG101) miR-148b-3p过表达/敲低对M2/M1标志物表达的影响(qRT-PCR、ELISA) TSC2作为miR-148b-3p靶基因的验证(荧光素酶报告实验、Western blot) TSC2/mTORC1通路激活的检测(p-S6、S6、CD206) 细胞功能实验(EdU、伤口愈合、Transwell)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从乳腺癌细胞培养上清中提取外泌体并验证其特性
利用外泌体分离纯化试剂盒从MDA-MB-231细胞培养上清中提取外泌体,通过透射电镜观察形态,Nanosight系统检测粒径和浓度,Western blot检测外泌体标志物CD9、CD81和TSG101。
验证乳腺癌细胞来源的外泌体能否被巨噬细胞摄取
用DiL标记外泌体,与THP-1来源的巨噬细胞共培养,通过荧光显微镜观察外泌体的摄取。
评估乳腺癌细胞来源的外泌体对巨噬细胞极化的影响
将巨噬细胞与MDA-MB-231来源的外泌体共培养,通过qRT-PCR检测M2标志物(CD163、CD206、IL-10、arginase-1)和M1标志物(IL-1β、iNOS)的表达,并通过ELISA检测IL-10和TNF-α的分泌水平。
筛选乳腺癌细胞来源外泌体中差异表达的miRNA,并验证miR-148b-3p的高表达
基于GEO数据集(GSE50429)进行差异miRNA分析,经TargetScan预测和Venn图分析,得到候选miRNA;通过qRT-PCR验证miR-148b-3p在MDA-MB-231外泌体中的高表达,并分析其与临床特征的相关性及对预后的影响。
验证miR-148b-3p对巨噬细胞极化和乳腺癌细胞功能的影响
将miR-148b-3p mimics或inhibitors转染至巨噬细胞,检测M2/M1标志物表达和细胞因子分泌;随后将处理后的巨噬细胞与MDA-MB-231细胞共培养,评估乳腺癌细胞的增殖(EdU)、迁移(伤口愈合)和侵袭(Transwell)能力。
验证miR-148b-3p直接靶向TSC2并通过mTORC1通路调节巨噬细胞极化
通过TargetScan预测靶基因,荧光素酶报告实验验证miR-148b-3p与TSC2 3'UTR的结合;Western blot检测TSC2蛋白表达及mTORC1下游信号p-S6的水平;通过siRNA敲低TSC2验证其对巨噬细胞极化和乳腺癌细胞功能的影响。
评估TSC2敲低对乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
将si-TSC2转染至巨噬细胞,通过EdU、Transwell实验评估与MDA-MB-231共培养后乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| MCF-10A专用培养基 | Procell | -- | |
| 佛波酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 外泌体分离 | 外泌体分离纯化试剂盒 | Umibio | UR52121 |
| 外泌体鉴定 | Nanosight LM10系统 | Navato | -- |
| 外泌体标记 | Vybrant DiL细胞标记溶液 | Molecular Probes | V-22885 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0012S | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗CD9抗体 | Santa Cruz | sc-13118 | |
| 抗CD81抗体 | Santa Cruz | sc-166029 | |
| 抗CD206抗体 | Santa Cruz | sc-376108 | |
| 抗TSC2抗体 | Cell Signaling Technology | 4308 | |
| 抗p-S6 (Ser235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| 抗S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| 抗TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| 抗ACO1抗体 | Abcam | ab183721 | |
| 抗β-actin抗体 | Sigma | A5441 | |
| 抗Histone H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| 抗Alix抗体 | Santa Cruz | sc-53540 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| RIP实验 | Magna RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| TSC2过表达质粒 | Addgene | 14129 | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 反转录qPCR试剂盒 | Toyobo | -- | |
| miRNA cDNA合成试剂 | Cwbio | -- | |
| SYBR Green实时荧光定量PCR预混液 | Toyobo | -- | |
| miRNA qPCR检测试剂盒 | Cwbio | -- | |
| 细胞增殖检测 | EdU细胞增殖检测试剂盒 | RiboBio | C10310 |
| 迁移和侵袭 | 基质胶 | Corning | -- |
| Boyden小室 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与外泌体分离 | 外泌体分离步骤、超速离心参数、外泌体鉴定方法 阅读提示:参照Methods中的Exosome isolation and identification部分 |
| 巨噬细胞极化诱导 | THP-1细胞分化条件(PMA浓度、处理时间)、外泌体处理浓度和时间 阅读提示:参照Methods中的Cell culture和Cell coculture部分 |
| miR-148b-3p过表达/敲低 | 转染试剂和浓度(Lipofectamine 2000,100 nM mimics或inhibitors)、转染时间 阅读提示:参照Methods中的Cell transfection部分 |
| 靶基因验证 | TSC2 3'UTR序列、荧光素酶报告实验操作及细胞系(293T) 阅读提示:参照Methods中的Luciferase reporter assay部分 |
| 功能实验 | 共培养体系设置、细胞数量、处理时间、检测指标 阅读提示:参照Methods中的Cell coculture、Cell viability、Cell proliferation, migration and invasion部分 |