临床样本中miR-181a-5p表达检测
验证miR-181a-5p在PE患者与正常孕妇肥大细胞中的表达差异
收集PE患者和正常孕妇胎盘组织,分离原代肥大细胞,通过qRT-PCR检测miR-181a-5p表达。
Mast cell-derived exosomal miR-181a-5p modulated trophoblast cell viability, migration, and invasion via YY1/MMP-9 axis.
包含患者样本(PE及正常胎盘肥大细胞)、细胞模型(HTR-8/SVneo、Luva、293T)、外泌体功能实验、靶向验证(双荧光素酶、ChIP)及回复实验,具有多层级验证。
PE患者胎盘肥大细胞(n=15)与正常孕妇(n=20) Luva肥大细胞系 HTR-8/SVneo滋养层细胞系 293T细胞
miR-181a-5p在PE患者肥大细胞中过表达(p<0.001) 外泌体鉴定:CD63、HSP70高表达,Calnexin低表达 外泌体摄取:PKH26标记后内化至HTR-8/SVneo细胞 miR-181a-5p靶向YY1验证:双荧光素酶报告实验 YY1结合MMP-9启动子验证:ChIP实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-181a-5p在PE患者与正常孕妇肥大细胞中的表达差异
收集PE患者和正常孕妇胎盘组织,分离原代肥大细胞,通过qRT-PCR检测miR-181a-5p表达。
研究miR-181a-5p对Luva细胞活力的影响
将miR-181a-5p mimic、inhibitor及对照转染至Luva细胞,用MTT检测细胞活力。
确认外泌体的分离成功及特性
使用ExoIsolator试剂盒从Luva细胞培养上清中提取外泌体,通过透射电镜观察形态、Western blot检测标志蛋白。
验证外泌体能够被滋养层细胞内化
用PKH26标记外泌体,与HTR-8/SVneo细胞共培养,荧光显微镜观察。
检测肥大细胞外泌体及其中miR-181a-5p对HTR-8/SVneo细胞活力、迁移和侵袭的影响
将来源于miR-181a-5p mimic或inhibitor处理过的Luva细胞的外泌体与HTR-8/SVneo共培养,进行MTT、伤口愈合、Transwell实验。
检测外泌体miR-181a-5p对YY1及EMT相关蛋白表达的影响
Western blot检测YY1、N-cadherin、E-cadherin、Vimentin、MMP-9。
验证miR-181a-5p与YY1的直接结合
使用TargetScan预测,双荧光素酶报告实验验证,将YY1 WT或MUT载体与miR-181a-5p mimic共转染293T细胞。
验证YY1过表达能够逆转外泌体miR-181a-5p对HTR-8/SVneo细胞的影响
将YY1过表达质粒转染至HTR-8/SVneo细胞,与外泌体共培养,进行MTT、伤口愈合、Transwell及Western blot检测。
验证YY1是否直接结合MMP-9启动子
使用JASPAR预测,双荧光素酶报告实验(MMP-9 WT、MUT1、MUT2)及ChIP实验验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | IMDM培养基 | Procell | -- |
| RPMI-1640培养基 | ATCC | 30-2001 | |
| 胎牛血清 | ATCC | 30-2021 | |
| 干细胞因子 | Procell | PCK019 | |
| 白细胞介素-6 | Procell | PCK085 | |
| 肥大细胞完全培养基 | Procell | CM-H110 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 |
| 外泌体分离 | ExoIsolator外泌体分离试剂盒 | DOJINDO LABORATORISE | EX10 |
| 过滤器 | Millipore | GVWP09050 | |
| 磷酸盐缓冲液 | SAFC | 806544 | |
| 外泌体鉴定 | Tundra冷冻透射电子显微镜 | Thermo Fisher | -- |
| 外泌体摄取 | PKH26染料 | Sigma-Aldrich | MINI26 |
| Hoechst 33258染色液 | Beyotime | C1018 | |
| 荧光显微镜 | Zeiss Meditec AG | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| 外泌体RNA和蛋白分离试剂盒 | Invitrogen | 4478545 | |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | K1621 | |
| microRNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4366597 | |
| LightCycler 480II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| FastStart SYBR Green预混液 | Roche | FSSGMMRO | |
| TaqMan microRNA检测 | Applied Biosystems | 4440888 | |
| MTT实验 | MTT试剂盒 | Solarbio | M1020 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Abcam | ab102536 | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | HATF04700 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Proandybio | 10144 | |
| CD63抗体 | Abways | CY5253 | |
| HSP70抗体 | Abways | AB3138 | |
| Calnexin抗体 | Abways | CY5839 | |
| YY1抗体 | Abways | CY5160 | |
| MMP-9抗体 | Abways | CY1226 | |
| N-钙粘蛋白抗体 | Abcam | ab76011 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Abcam | ab40772 | |
| 波形蛋白抗体 | Abcam | ab92547 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 伤口愈合实验 | 光学显微镜 | Olympus | DP27 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| Matrigel基质胶 | Solarbio | 356234 | |
| 结晶紫 | Solarbio | G1062 | |
| 双荧光素酶报告实验 | pmirGLO载体 | Promega Corporation | E1330 |
| pGL3-Basic载体 | Promega | E1771 | |
| 双荧光素酶检测试剂盒 | MedChemExpress | HY-K1013 | |
| ChIP实验 | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| 甲醛 | Sigma-Aldrich | F8775 | |
| IgG抗体 | Abcam | ab171870 | |
| YY1抗体 | Invitrogen | 703054 | |
| 细胞转染 | miR-181a-5p模拟物 | Ribobio | miR10000256-1-5 |
| miR-181a-5p抑制剂 | Ribobio | miR20000256-1-5 | |
| miR-181a-5p模拟物对照 | Ribobio | miR1N0000002-1-5 | |
| miR-181a-5p抑制剂对照 | Ribobio | miR2N0000002-1-5 | |
| YY1过表达质粒 | GenePharma | -- | |
| pEX-3载体 | GenePharma | -- | |
| 肥大细胞分离 | MagniSort人CD117阳性分选试剂盒 | Invitrogen | 8802-6870-74 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肥大细胞分离 | PE和正常孕妇的组织收集数量(n=15, n=20),孕周(28周后),分离试剂盒(MagniSort Human CD117 Positive Selection Kit) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节 |
| 细胞培养 | 细胞系来源(Luva, HTR-8/SVneo, 293T),培养基成分(IMDM补充SCF和IL-6,RPMI-1640+10%FBS),培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节 |
| 转染 | miR-181a-5p mimic/inhibitor浓度(文中未明确说明),转染试剂(Lipofectamine 2000),质粒(YY1过表达质粒) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2节 |
| 外泌体分离 | 外泌体分离试剂盒(ExoIsolator),超滤膜孔径(0.22 μm),PBS洗涤次数 阅读提示:参见Materials and Methods 2.3节 |
| 外泌体鉴定 | 标志物CD63、HSP70、Calnexin的表达 阅读提示:参见Figure 1E |
| MTT实验 | 细胞处理时间(24-96h),MTT孵育时间(4h),溶解时间(10min),检测波长(490nm) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.6节 |
| 伤口愈合实验 | 细胞接种密度(1×10^5 cells/well),划痕后培养时间(48h),血清饥饿 阅读提示:参见Materials and Methods 2.8节 |
| Transwell实验 | 细胞密度(未明确),Matrigel包被,培养时间(48h),固定和染色步骤 阅读提示:参见Materials and Methods 2.9节 |
| 双荧光素酶报告实验 | 质粒构建(pmirGLO, pGL3-Basic),共转染细胞(293T),检测时间(48h后) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.11节 |
| ChIP实验 | 抗体用量(Anti-YY1 2μg/百万细胞,Anti-IgG 1μg),甲醛交联浓度(1%),孵育时间(4°C过夜) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.11节 |