体外增殖抑制实验
评估瑞香素对GBM细胞活力的影响
使用MTT法检测不同浓度瑞香素处理U87、U251细胞24和48小时后的细胞活力
Daphnoretin inhibits glioblastoma cell proliferation and metastasis via PI3K/AKT signaling pathway inactivation.
包含体外细胞功能实验(增殖、迁移、侵袭、凋亡)、体内异种移植瘤模型、机制验证(Western blot、SPR、反救实验)及组学分析,涉及多个独立证据层级。
U87人胶质母细胞瘤细胞系 U251人胶质母细胞瘤细胞系 GL261小鼠胶质母细胞瘤细胞系 C57BL/6小鼠皮下异种移植瘤模型
瑞香素浓度梯度(0-160 μM)及处理时间(24 h、48 h) 动物模型:C57BL/6小鼠,GL261细胞皮下注射(5×10^6细胞) 给药剂量:低剂量20 mg/kg、高剂量40 mg/kg,TMZ阳性对照 AKT激活剂SC79预处理1小时 关键检测:细胞活力(MTT)、克隆形成、EdU、划痕、Transwell、凋亡、Western blot、IHC
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估瑞香素对GBM细胞活力的影响
使用MTT法检测不同浓度瑞香素处理U87、U251细胞24和48小时后的细胞活力
评估瑞香素长期抑制GBM细胞增殖能力
U87和U251细胞以每孔1000个细胞接种,经不同浓度瑞香素处理7-14天后,固定染色并计数克隆
检测瑞香素对GBM细胞DNA合成的影响
U87和U251细胞经不同浓度瑞香素处理后,加入EdU试剂进行DNA合成标记,检测EdU阳性细胞比例
评估瑞香素对GBM细胞横向迁移能力的影响
U87和U251细胞长至95%融合后划痕,经不同浓度瑞香素处理24小时,观察划痕闭合情况
评估瑞香素对GBM细胞垂直迁移和侵袭能力的影响
细胞接种于Transwell上室,下室加入含10% FBS的DMEM及不同浓度瑞香素,24小时后计数迁移或侵袭细胞
评估瑞香素对GBM细胞凋亡的影响
使用ROS检测、JC-1染色、Annexin V-FITC/PI染色及Western blot检测凋亡相关蛋白表达
评估瑞香素在体内的抗肿瘤效果及安全性
GL261细胞皮下接种C57BL/6小鼠,成瘤后随机分组,给予不同剂量瑞香素或TMZ治疗14天,测量肿瘤体积、体重,并取瘤组织进行HE、IHC染色
预测瑞香素治疗GBM的潜在靶点和通路
从PubChem获取瑞香素结构,使用SwissTargetPrediction预测靶点,GeneCards获取GBM相关靶点,取交集后进行GO和KEGG富集分析
评估瑞香素与PI3K/AKT通路关键蛋白的结合能力
使用AutoDock进行分子对接,计算结合能,并用Discovery Studio分析结合模式
验证瑞香素与AKT1的直接结合
使用Biacore T200仪器,将His标记的AKT1固定在CM5芯片上,注入不同浓度瑞香素,检测结合信号
验证瑞香素通过PI3K/AKT通路发挥作用
Western blot检测瑞香素处理后p-PI3K、p-AKT水平;用AKT激活剂SC79预处理,观察对瑞香素作用的影响
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 瑞香素 | Chinese Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd | 2034-67-9 |
| 阳性对照药物 | 替莫唑胺 | Chinese Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd | 85622-93-1 |
| 药物处理 | SC79 | MedChemExpress Co., Ltd. | 305834-79-1 |
| 溶剂 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich Corp. | 67-68-5 |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | 文中未明确说明 | -- |
| 增殖检测 | Cell-Light EdU试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| Hoechst 33342 | 文中未明确说明 | -- | |
| 侵袭实验 | 基质胶 | Corning BioCoat | 356234 |
| 活性氧检测 | 2',7'-二氯荧光素二乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针 | Biosharp | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI试剂盒 | Beyotime | C1067M |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| Western blot | ECL化学发光试剂 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| PVDF膜 | 文中未明确说明 | -- | |
| 抗Bcl-2抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | R23309 | |
| 抗Bax抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | R22708 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | R23315 | |
| 抗Cleaved-caspase 3抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 341034 | |
| 抗p-AKT抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 381555 | |
| 抗AKT抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 342529 | |
| 抗p-PI3K抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 301245 | |
| 抗PI3K抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 343830 | |
| 抗Caspase 9抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 381336 | |
| 抗Cleaved-caspase 9抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 381238 | |
| 抗GAPDH抗体 | Zhengneng Biotechnology Co., Ltd. | 380626 | |
| 免疫组化 | 抗CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 3528 |
| 抗Ki-67抗体 | Beyotime | AF1738 | |
| 抗PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 13110 | |
| DAB底物 | Beyotime | P0202 | |
| HE染色 | 伊红 | Biosharp | BL700A |
| SPR实验 | Biacore T200仪器 | GE Healthcare | -- |
| CM5传感芯片 | 文中未明确说明 | -- | |
| 细胞培养 | 96孔板 | Costar, Corning | -- |
| 6孔培养板 | Costar, Corning | -- | |
| 24孔板 | Costar, Corning | -- | |
| 迁移/侵袭实验 | Transwell小室 | Costar, Corning | -- |
| 显微镜 | X71荧光显微镜 | Olympus Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系 | U87、U251、HEB细胞系来源(Procell) 阅读提示:Materials and Methods, 2.1 |
| 细胞培养条件 | 高糖DMEM、10% FBS、1% P/S,37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and Methods, 2.1 |
| 药物处理 | 瑞香素浓度梯度(0-160 μM)、处理时间(24 h、48 h) 阅读提示:Materials and Methods, 2.2; Results, 3.1 |
| 克隆形成实验 | U87/U251细胞密度1000/孔,瑞香素浓度10和20 μM,处理7-14天 阅读提示:Materials and Methods, 2.3 |
| EdU实验 | 细胞密度5×10^3/孔,处理浓度0、10、20、40 μM,EdU孵育2小时 阅读提示:Materials and Methods, 2.4 |
| 划痕实验 | 细胞密度3×10^5/孔,200 μL枪头划痕,处理24小时 阅读提示:Materials and Methods, 2.5 |
| Transwell实验 | 细胞密度5×10^4/孔,侵袭实验需包被Matrigel(1:8稀释),迁移/侵袭24小时 阅读提示:Materials and Methods, 2.6 |
| ROS检测 | DCFDA浓度2 μM,预处理NAC 3 μM 6小时,共处理18小时 阅读提示:Materials and Methods, 2.7 |
| JC-1检测 | JC-1染色30分钟 阅读提示:Materials and Methods, 2.7 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色20分钟,处理24小时 阅读提示:Materials and Methods, 2.9 |
| Western blot | 抗体稀释度:Bcl-2 (1:1000)、Bax (1:1000)、Caspase 3 (1:1000)、Cleaved-caspase 3 (1:1000)、p-AKT (1:1000)、AKT (1:1000)、p-PI3K (1:1000)、PI3K (1:1000)、Caspase 9 (1:1000)、Cleaved-caspase 9 (1:1000)、GAPDH (1:1000) 阅读提示:Materials and Methods, 2.10; 图8A |
| 动物实验 | 5周龄雄性C57BL/6小鼠,接种GL261细胞5×10^6/100 μL PBS,分组:Control、TMZ、Daphnoretin-L (20 mg/kg)、Daphnoretin-H (40 mg/kg),治疗14天 阅读提示:Materials and Methods, 2.11; 图6 |
| IHC染色 | 抗体CD31 (1:100)、Ki-67 (1:100)、PCNA (1:100)、p-AKT (1:100)、AKT (1:100)、p-PI3K (1:100)、PI3K (1:100) 阅读提示:Materials and Methods, 2.12; 图9 |
| SPR实验 | Biacore T200,CM5芯片,His标记AKT1固定,瑞香素浓度梯度,解离时间600秒,PBS缓冲液(含5% DMSO) 阅读提示:Materials and Methods, 2.15 |