铜死亡相关基因评分及其核心基因GCSH：基于RNA测序和实验分析的胆管癌预后新预测因子

背景：近期研究表明，铜死亡是一种铜依赖性细胞死亡机制，与肿瘤发生、进展、临床预后、肿瘤微环境和药物敏感性有关。然而，铜死亡在胆管癌（CCA）中的功能和影响仍不明确。方法：利用从基因表达综合数据库（GEO）和癌症基因组图谱（TCGA-CHOL）数据集获得的数据，我们根据铜死亡相关基因（CRGs）对CCA进行亚型分型，并探讨组间的功能差异和预后价值。综合考虑临床预后和基因表达，建立了CRG评分。此外，基于这些评分，检查了高风险和低风险组之间免疫微环境、免疫治疗反应、代谢模式和癌症进展特征的差异。体外实验分别在细胞和组织中验证了关键基因甘氨酸裂解系统蛋白H（GCSH）的功能。结果：基于亚组遗传差异建立的预后模型在验证中取得了令人满意的结果。高、低CRG组之间代谢相关基因表达水平和肿瘤微环境分布有显著差异。GCSH被揭示为CCA中唯一的预后CRG（HR = 6.04；95% CI: 1.15-31.80）。此外，抑制铜死亡关键基因GCSH减弱了CCA细胞系体外的恶性能力，包括细胞增殖、迁移和侵袭，并且GCSH的这种功能可能通过JAK-STAT信号在CCA中实现。结论：CRG评分系统准确预测预后，并为CCA的铜死亡相关治疗开辟了新的可能性。铜死亡关键基因GCSH已被初步确认为CCA患者可靠的治疗靶点或预后标志物。