体外功能验证
验证miR-424-5p对A549细胞增殖、细胞周期、凋亡及DDP耐药的影响
在A549细胞中转染miR-424-5p mimic/inhibitor,通过CCK-8检测细胞活力,PI染色流式细胞术检测细胞周期,Annexin V-FITC/PI检测凋亡;在A549/DDP细胞中过表达miR-424-5p并在IC50 DDP处理下检测细胞活力。
TP53 mitigates cisplatin resistance in non-small cell lung cancer by mediating the effects of resistant cell-derived exosome mir-424-5p.
包含体外细胞实验、体内皮下移植瘤模型、双荧光素酶报告基因、外泌体分离鉴定及通路蛋白检测等多层级验证,且进行了功能获得与丧失实验。
A549细胞系 A549/DDP细胞系 BALB/c-nu小鼠皮下移植瘤模型 293T细胞
miR-424-5p mimic/inhibitor转染效率及对A549细胞增殖、周期、凋亡的影响 A549/DDP细胞异种移植瘤模型中DDP给药剂量(5 mg/kg,每周三次,持续两周) TP53过表达或敲低对miR-424-5p、SOCS5/6表达及JAK2/STAT3和PI3K/AKT通路活化的影响 外泌体分离方法(超速离心)及外泌体中miR-424-5p的水平变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-424-5p对A549细胞增殖、细胞周期、凋亡及DDP耐药的影响
在A549细胞中转染miR-424-5p mimic/inhibitor,通过CCK-8检测细胞活力,PI染色流式细胞术检测细胞周期,Annexin V-FITC/PI检测凋亡;在A549/DDP细胞中过表达miR-424-5p并在IC50 DDP处理下检测细胞活力。
验证miR-424-5p在体内对NSCLC生长和DDP耐药的影响
将处理后的A549/DDP细胞皮下注射至BALB/c-nu小鼠,建立移植瘤模型,给予DDP或PBS处理,测量肿瘤体积和质量,并通过HE染色观察组织病理变化。
预测并验证miR-424-5p的下游靶基因
使用TargetScan预测miR-424-5p的靶基因,通过双荧光素酶报告基因验证miR-424-5p与SOCS5和SOCS6 3'UTR的结合。
验证TP53是否为miR-424-5p宿主基因的转录因子
使用JASPAR预测miR-424-5p宿主基因启动子上的转录因子,通过双荧光素酶报告基因验证TP53与宿主基因启动子区域的结合。
探究外泌体是否作为miR-424-5p的功能介质
从A549和A549/DDP细胞培养上清中分离外泌体,使用TEM观察形态、NTA分析粒径,Western blot检测外泌体标志物,RT-qPCR检测外泌体中miR-424-5p表达,并评估TP53调控的影响。
验证miR-424-5p是否通过SOCS5/6调控JAK2/STAT3和PI3K/AKT通路
在A549/DDP细胞中过表达或敲低miR-424-5p,以及过表达或敲低TP53,通过Western blot检测信号通路蛋白磷酸化水平,并在肿瘤组织中进行IHC检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875119 |
| 胎牛血清 | Gibco | 16140089 | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | 15090046 | |
| A549/DDP细胞专用培养基 | Procell | CM-0519 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine® 3000转染试剂盒 | Invitrogen | L3000015 |
| 药物处理 | 顺铂 | MCE | HY-17394 |
| 双荧光素酶报告基因 | GloMax®发光检测仪 | -- | E6521 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 89901 |
| 外泌体蛋白提取 | 总外泌体RNA和蛋白分离试剂盒 | Invitrogen | 4478545 |
| Western blot | Novex™ ECL试剂盒 | Invitrogen | WP20005 |
| Axygen®凝胶成像系统 | Corning | GD-1000 | |
| RT-qPCR | Trizol™试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| NanoDrop-1000超微量分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| Bulge-Loop miRNA qRT-PCR Starter Kit | Ribobio | C10211-1 | |
| FastKing逆转录试剂盒 | Tiangen | KR116 | |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混试剂盒 | Vazyme | Q712-03 | |
| 免疫组化 | DAB显色试剂盒 | Abcam | ab64238 |
| BX53显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | A549细胞在RPMI-1640培养基含10% FBS,A549/DDP细胞在专用培养基中培养;细胞密度80%-90%时用0.25%胰酶消化传代。 阅读提示:Materials and methods, 2.1 Cell culture |
| 细胞转染 | 使用Lipofectamine® 3000转染pCDNA3.1-TP53、pGMLV-SC5 RNAi-TP53、miR-424-5p mimic/inhibitor及对照。A549/DDP细胞在IC50 DDP处理下转染。 阅读提示:Materials and methods, 2.2 Cell transfection and treatment |
| 体内动物实验 | BALB/c-nu小鼠分组、每只注射5×10^5细胞、DDP给药剂量(5 mg/kg,每周三次,持续两周)、肿瘤测量频率(每3天)、第27天处死。 阅读提示:Materials and methods, 2.6 Animal and subcutaneous tumor model; Figure Legend 2 |
| 外泌体分离与鉴定 | 血清饥饿培养24小时收集上清,超速离心获取外泌体;TEM观察形态,NTA分析粒径。 阅读提示:Materials and methods, 2.4 Isolation and identification of exosomes; Figure Legend 7 |
| 信号通路检测 | Western blot检测p-PI3K、p-AKT、p-JAK2、p-STAT3及总蛋白;IHC检测肿瘤组织中的通路蛋白。 阅读提示:Figure Legends 4, 5, 6; Materials and methods, 2.5 Western blotting assay |