细胞活力与增殖测定
确定亚砷酸盐处理后HaCaT细胞的最佳浓度和时间,并验证其对细胞增殖的影响。
使用CCK8试剂盒检测梯度浓度亚砷酸钠处理48小时后的细胞活力;通过流式细胞术分析细胞周期;通过EdU掺入实验检测DNA合成。
MiR-96-5p Suppresses Progression of Arsenite-Induced Human Keratinocyte Proliferation and Malignant Transformation by Targeting Denticleless E3 Ubiquitin Protein Ligase Homolog.
包含体外细胞模型、体内异种移植模型、GEO数据库分析及功能验证(miR-96-5p mimics、DTL siRNA)和机制验证(双荧光素酶报告基因)。
人HaCaT角质形成细胞 亚砷酸盐诱导转化的T-HaCaT细胞 BALB/c裸鼠异种移植模型 HEK293T细胞(用于双荧光素酶报告基因实验)
0.1 μmol/L亚砷酸钠处理HaCaT细胞48小时(CCK8实验确定) HaCaT细胞长期暴露0.1 μmol/L亚砷酸钠约40周(约80代)构建T-HaCaT细胞 实验分组:对照组、亚砷酸盐处理组、miR-96-5p mimics/agomir处理组、DTL siRNA处理组 体外实验重复次数:至少三次(统计方法中说明) 体内实验动物数量:第一批12只,第二批18只,随机分组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定亚砷酸盐处理后HaCaT细胞的最佳浓度和时间,并验证其对细胞增殖的影响。
使用CCK8试剂盒检测梯度浓度亚砷酸钠处理48小时后的细胞活力;通过流式细胞术分析细胞周期;通过EdU掺入实验检测DNA合成。
构建亚砷酸盐诱导的HaCaT细胞恶性转化模型(T-HaCaT细胞)。
HaCaT细胞在含0.1 μmol/L亚砷酸钠的培养基中连续培养约40周(约80代),通过细胞周期、生长曲线、集落形成和裸鼠成瘤实验验证恶性表型。
验证miR-96-5p与DTL的直接结合及调控关系。
利用TargetScan预测miR-96-5p在DTL 3'UTR的结合位点;构建野生型和突变型荧光素酶报告载体,共转染miR-96-5p mimics或NC后检测荧光素酶活性。
验证miR-96-5p过表达或DTL敲低对亚砷酸盐诱导的细胞增殖和恶性转化的影响。
在HaCaT细胞中转染miR-96-5p mimics或DTL siRNA,随后进行亚砷酸盐处理,通过CCK8、EdU、集落形成和Western blot等检测细胞活力、增殖和DTL表达。
验证miR-96-5p过表达对T-HaCaT细胞移植瘤生长的影响。
将T-HaCaT细胞皮下接种至裸鼠,待肿瘤体积达100 mm³后分组,通过尾静脉注射miR-96-5p agomir、scramble或nuclease-free water,定期测量肿瘤体积,最后通过Western blot检测肿瘤组织中DTL表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Beyotime | -- | |
| 细胞转染 | miR-96-5p模拟物 | Shanghai Jima Co. | -- |
| DTL小干扰RNA | Shanghai Jima Co. | -- | |
| 乱序对照 | Shanghai Jima Co. | -- | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞增殖检测 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | RiboBio | -- |
| Hoechst 33342染料 | -- | -- | |
| 细胞周期检测 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 核糖核酸酶A | Sigma | -- | |
| 免疫荧光 | DTL抗体 | Abcam | ab184548 |
| DAPI染料 | Beyotime | -- | |
| 细胞增殖检测 | MTT试剂 | Biofroxx | -- |
| 二甲基亚砜 | Biofroxx | -- | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 软琼脂集落形成实验 | 琼脂糖 | Lonza | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶报告基因实验 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| β-actin抗体 | CST | 7074 | |
| β-tubulin抗体 | CST | 2128 | |
| 仪器 | Cytation 3细胞成像多功能检测仪 | BioTek | -- |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| BD Accuri C6 Plus流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| 凝胶成像系统 | Tanon | -- | |
| 摇床(MaxQ 4000) | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | HaCaT细胞来源(Procell Life Science & Technology Co., Ltd.);培养基(DMEM,10% FBS);亚砷酸钠浓度(0.1 μmol/L);处理时间(48小时) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2 Cell Culture and Treatment |
| 恶性转化模型构建 | 亚砷酸钠浓度(0.1 μmol/L);暴露时长(约40周,约80代);细胞密度(6×10^5 cells/25 cm²瓶) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2 Cell Culture and Treatment 和 Results 3.2 |
| 细胞转染 | miR-96-5p mimics、DTL siRNA及对照序列;转染剂量(30 pmol);转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX);转染后处理(0.1 μmol/L亚砷酸钠48小时) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.3 Cell Transfection |
| 体外功能检测 | CCK8检测细胞活力;EdU掺入实验检测增殖;集落形成实验(细胞数200/孔,培养14天);软琼脂实验(1×10^3 cells/孔,培养2周) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4-2.10 |
| 体内异种移植模型 | 动物品系(BALB/c裸鼠,雄性,4-6周龄);细胞接种量(5×10^6 T-HaCaT细胞);分组(对照、scramble、agomir);给药途径(尾静脉注射,每三天一次);肿瘤体积计算方法(L×W²/2) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.13 In Vivo Tumor Model |