抗体诱导细胞间融合的初步观察
验证RBM抗体能否在缺乏ACE2的情况下诱导表达刺突蛋白的细胞之间发生融合。
将共表达刺突蛋白和Cre的HEK293T细胞与表达Stop-Luc的细胞共培养,加入不同中和抗体(CB6, FD20, REGN10933, REGN10987)后检测荧光素酶活性。在A549细胞中通过免疫荧光观察合胞体形成。
Antibody-mediated spike activation promotes cell-cell transmission of SARS-CoV-2.
包含体外细胞融合模型、抗体诱导蛋白水解、机制验证(S1/S2切割)及活病毒感染实验,多层次功能验证。
HEK293T细胞(ACE2低表达,用于细胞-细胞融合实验) A549细胞(人肺癌上皮细胞,用于合胞体形成实验) Vero E6细胞(用于活SARS-CoV-2感染实验) SARS-CoV-2刺突蛋白变异株(Alpha、Beta、Delta、Omicron BA.1和BA.4)
抗体种类及浓度(如CB6、REGN10933等,12.5 nM) S1/S2切割位点完整性(WT vs R685A及ΔRRAR突变体) S1脱落和S2'切割检测(Western blot) 细胞融合模型(Cre-loxP荧光素酶报告基因系统) 活病毒感染实验MOI 2和抗体处理时间(48小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证RBM抗体能否在缺乏ACE2的情况下诱导表达刺突蛋白的细胞之间发生融合。
将共表达刺突蛋白和Cre的HEK293T细胞与表达Stop-Luc的细胞共培养,加入不同中和抗体(CB6, FD20, REGN10933, REGN10987)后检测荧光素酶活性。在A549细胞中通过免疫荧光观察合胞体形成。
探究抗体诱导的细胞融合是否依赖于刺突蛋白的蛋白水解过程。
通过免疫印迹检测抗体处理后细胞上清中脱落S1亚基和细胞裂解物中S2'切割产物。使用不同抗体浓度(0.1-12.5 nM)进行剂量响应分析。用蛋白酶K处理验证S2'产物的抗性。
确定S1/S2位点的切割是否对抗体诱导的细胞融合和S1脱落是必需的。
比较表达WT刺突蛋白和R685A突变体(缺乏furin切割位点)的细胞在CB6抗体处理下的融合和S1脱落情况。使用furin抑制剂RVKR和siRNA敲降furin,以及furin过表达,验证furin介导的切割在过程中的作用。
评估在细胞-细胞融合和假病毒颗粒中和中,S1/S2切割对抗体中和效率的影响。
比较CB6对WT和R685A刺突蛋白假病毒颗粒感染和细胞融合的中和能力。检测在不同条件下(有无furin抑制剂)的融合抑制率。
探讨外源性蛋白酶是否能恢复R685A突变体的抗体诱导细胞融合并促进抗体逃逸。
在表达R685A或ΔRRAR刺突蛋白的细胞中加入外源性TPCK-胰蛋白酶,观察是否恢复CB6诱导的S1脱落和细胞融合,以及对CB6中和敏感性的影响。
在活SARS-CoV-2感染背景下验证CB6抗体对刺突蛋白激活和细胞间传播的促进作用。
用2 MOI活病毒(Wuhan-Hu-1)感染Vero E6细胞,随后加入不同浓度的CB6抗体,观察细胞病变效应、病毒滴度和刺突蛋白切割。在存在或不存在抗ACE2阻断抗体的情况下检测细胞病变和病毒蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Life Technologies | -- | |
| MEM培养基 | Procell | -- | |
| 抗体纯化 | Expi293细胞 | Thermo Fisher | A14527 |
| 蛋白A琼脂糖珠 | -- | -- | |
| 脱盐柱 | Biorad | -- | |
| 试剂和质粒 | TPCK处理的胰蛋白酶 | Thermo Fisher | PI20233 |
| Dec-RVKR-cmk(弗林蛋白酶抑制剂) | MedChemExpress | HY-107760 | |
| 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | HY-100558 | |
| ACE2多克隆抗体 | Proteintech | 21115-1-AP | |
| 兔抗SARS-CoV-2 S2抗体 | Sino Biological | 40590-T62 | |
| 小鼠抗SARS-CoV-2 N抗体 | Sino Biological | 40143-MM05 | |
| 小鼠抗S1抗体 | Sino Biological | 40591-MM42 | |
| Omicron特异性抗S1抗体 | Sino Biological | 40592-MM117 | |
| 兔抗PARP抗体 | CST | 9532S | |
| 抗EEA1抗体 | CST | 3288S | |
| 兔抗LAMP1抗体 | CST | 9091S | |
| 兔抗人弗林蛋白酶多克隆抗体 | Proteintech | 18413-1-AP | |
| 小鼠抗人ACE2阻断单克隆抗体 | Sino Biological | 10108-MM37 | |
| 免疫印迹 | 小鼠抗β-微管蛋白抗体 | Abclonal | AC030 |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| HRP标记的山羊抗人Fc二抗 | Sigma | A0171 | |
| 免疫染色 | 山羊抗人IgG (H+L)-555 | Invitrogen | A48277 |
| 山羊抗兔IgG (H+L)-488 | Invitrogen | A11034 | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L)-488 | Invitrogen | A11029 | |
| 质粒构建 | pVAX1载体 | -- | -- |
| KOD PLUS DNA聚合酶 | TOYOBO | -- | |
| Dpn I限制酶 | -- | -- | |
| XL10-Gold超级感受态大肠杆菌 | Agilent | -- | |
| Nanodrop分光光度计 | Thermo | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | -- |
| 细胞融合检测 | Steady-Glo荧光素酶底物 | Promega | E2520 |
| Synergy H1酶标仪 | Biotek | -- | |
| CellTiter-Lumi Steady细胞活力检测试剂 | Beyotime | -- | |
| 显微镜观察 | IX73倒置显微镜 | Olympus | -- |
| 免疫沉淀 | Protein A/G磁珠 | Bimake | B23202 |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Millipore | -- |
| PicoLight化学发光底物 | Epizyme Scientific | -- | |
| 5200化学发光成像系统 | Tanon | -- | |
| 细胞处理 | 蛋白酶K | Invitrogen | AM2548 |
| RNA干扰 | siRNA(靶向弗林蛋白酶) | GenePharma | -- |
| 免疫染色 | Vectashield抗荧光淬灭封片剂 | Vectorlabs | -- |
| DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚) | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | SpinSR10共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| CRISPR-Cas9 | LentiCRISPR v2载体 | Addgene | #52961 |
| 嘌呤霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞-细胞融合实验 | 细胞类型(HEK293T或A549),抗体种类和浓度(如CB6 12.5 nM),共培养时间(16小时),荧光素酶或mCherry报告系统的构建 阅读提示:Methods: Cell culture, Transient transfection and cell-cell fusion assays |
| 抗体诱导的蛋白水解实验 | 抗体处理浓度和时间(16小时),S1脱落和S2'切割的检测方法(Western blot),蛋白酶K处理条件(10 μg/mL,30 min) 阅读提示:Results section 'Antibody-induced cell-cell fusion requires spike proteolysis at the S1/S2 junction' and Methods: Immunoblotting |
| S1/S2切割位点突变实验 | 刺突蛋白突变体(WT, R685A, ΔRRAR)构建和表达,furin抑制剂(25 μM RVKR)或siRNA处理的条件,furin过表达载体 阅读提示:Methods: Reagents and plasmids, Transient transfection, RNA interference |
| 中和抗体差异实验 | 假病毒颗粒中和实验(CB6浓度、预孵育时间1小时、感染时间6小时、总48小时),细胞融合中和实验(预孵育1小时、共培养6小时),RLU检测 阅读提示:Methods: Antibody neutralization assays |
| 活病毒感染实验 | Vero E6细胞类型(WT或TMPRSS2过表达),MOI为2,感染时间4小时,CB6浓度(12.5或25 nM),抗ACE2抗体(1 μg/mL),观察时间(48小时),TCID50测定方法 阅读提示:Methods: Cell infection with authentic SARS-CoV-2 virus |