BMSCs分离培养与鉴定
验证所培养的BMSCs具有间充质干细胞特性。
培养人BMSCs,通过流式细胞术检测表面标志物(CD29、CD90、CD45),并通过ALP染色、茜素红染色和油红O染色评估成骨和成脂分化能力。
LncRNA XIST from the bone marrow mesenchymal stem cell derived exosome promotes osteosarcoma growth and metastasis through miR-655/ACLY signal.
包含体外细胞功能实验(CCK-8、EdU、Transwell)、机制验证(RNA pulldown、双荧光素酶报告基因)和原位动物模型,并通过回复实验和下游蛋白检测确认机制通路。
人骨肉瘤细胞系MG63和143B 原位骨肉瘤小鼠模型(143B/LUC细胞胫骨骨髓腔注射) 人骨髓间充质干细胞(BMSCs)
BMSCs来源外泌体的分离与鉴定(透射电镜、Western blot标记物) XIST siRNA敲低效率及外泌体中XIST水平 miR-655 agomir/antagomir处理及回复实验 原位骨肉瘤模型分组(Ctrl, ExosiNC, ExosiXIST, ExosiXIST+Anti-NC, ExosiXIST+Anti-miR-655) ACLY抑制剂SB204990处理及β-catenin核转位检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证所培养的BMSCs具有间充质干细胞特性。
培养人BMSCs,通过流式细胞术检测表面标志物(CD29、CD90、CD45),并通过ALP染色、茜素红染色和油红O染色评估成骨和成脂分化能力。
获得并验证BMSCs来源的外泌体,并确认骨肉瘤细胞能否摄取这些外泌体。
通过超速离心法从BMSCs培养上清中分离外泌体,用透射电镜观察形态和大小,Western blot检测外泌体标志物CD9、CD63、CD81及阴性对照Calnexin。用PKH26标记外泌体并与MG63和143B细胞共培养,激光共聚焦显微镜观察摄取情况。
验证BMSCs外泌体XIST对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并确定其依赖性。
用siRNA敲低BMSCs中XIST,收集外泌体处理骨肉瘤细胞,检测细胞内XIST水平,并通过CCK-8、EdU、Transwell实验评估细胞活力、DNA复制、迁移和侵袭能力。
验证XIST与miR-655的直接结合及其相互调控。
通过RNA pulldown、双荧光素酶报告基因实验验证XIST与miR-655的结合,并通过qRT-PCR检测外泌体处理及XIST敲低对miR-655水平的影响。
验证BMSCs外泌体XIST促进骨肉瘤细胞恶性表型是否依赖于miR-655的下调。
在XIST敲低的基础上,用miR-655 antagomir抑制miR-655,检测细胞功能变化是否恢复。
在动物水平验证BMSCs外泌体XIST与miR-655结合促进骨肉瘤生长和肺转移。
将143B/LUC细胞注射入BALB/c裸鼠胫骨骨髓腔建立原位模型,分组后给予外泌体和anti-miR-655处理,通过活体成像监测肿瘤生长和转移,并进行Ki67免疫组化和H&E染色。
确认miR-655直接靶向ACLY,并验证外泌体XIST/miR-655轴调控ACLY表达。
通过Starbase3.0预测miR-655靶基因,双荧光素酶报告基因验证miR-655与ACLY 3'UTR结合,Western blot检测不同处理组ACLY蛋白水平。
验证BMSCs外泌体XIST/miR-655/ACLY轴对脂质沉积和β-catenin信号活性的影响。
通过油红O染色、甘油三酯和总胆固醇检测评估脂质水平,通过Western blot检测β-catenin在总蛋白、胞质和核蛋白中的水平,并在细胞和动物水平验证。
验证ACLY是外泌体XIST/miR-655轴促进骨肉瘤恶性表型的关键下游分子。
在miR-655抑制的基础上,敲低ACLY或使用ACLY抑制剂SB204990,检测细胞增殖、迁移和侵袭能力的改变。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Procell | PM150310 |
| MEM培养基 | Procell | PM150410 | |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-500 | |
| 外泌体分离 | 去外泌体胎牛血清 | SBI | EXO-FBS-50A-1 |
| 流式分析 | CD29抗体 | Invitrogen | 11-0299-42 |
| CD45抗体 | Invitrogen | 11-0459-42 | |
| CD90抗体 | Invitrogen | 11-0909-42 | |
| 成骨分化 | 碱性磷酸酶试剂盒 | Changchun Huili | C003-b |
| 成骨诱导培养基 | Procell | PD-007 | |
| 茜素红 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 成脂分化 | 成脂分化培养基 | Procell | PD-019 |
| 油红O染色 | 油红O | Servicebio | G1015 |
| 外泌体标记 | PKH26红色荧光细胞连接迷你试剂盒 | Sigma | MINI26 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 外泌体RNA提取试剂盒 | Norgen BioTek | NGB-58000 | |
| qRT-PCR | SYBR Green qPCR Supermix | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0027 |
| NE-PER核浆蛋白提取试剂 | Thermo Scientific | 78833 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012S | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| Lamin B1抗体 | Abcam | ab16048 | |
| β-catenin抗体 | Abcam | ab32572 | |
| CD9抗体 | Abcam | ab263019 | |
| CD63抗体 | Abcam | ab134045 | |
| CD81抗体 | Abcam | ab79559 | |
| Calnexin抗体 | CST | 2679 | |
| ACLY抗体 | Abcam | ab40793 | |
| HRP标记二抗 | Wuhan Boster | BA1051/BA1054 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | MCE | HY-K0301 |
| RNA pulldown | RNA Pull-Down试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 大规模RNA生产系统 | Promega | -- | |
| 生物素RNA标记混合物 | Roche | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因分析系统 | Promega | E1910 |
| 脂质检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Biovision | -- |
| 胆固醇检测试剂盒 | Biovision | -- | |
| 动物实验 | D-荧光素 | -- | -- |
| 免疫组化 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BMSCs培养与鉴定 | BMSCs的代数(P3-P5),培养条件(DMEM/F12+10%FBS),表面标志物表达(CD29、CD90阳性,CD45阴性) 阅读提示:详见Materials and methods中'Cell culture'和'Characterization of BMSCs'部分 |
| 外泌体分离与鉴定 | 超速离心步骤(300g,2000g,10000g,120000g,140000g),外泌体标志物(CD9, CD63, CD81),阴性对照Calnexin 阅读提示:见'Isolation and characterization of exosomes'部分 |
| 细胞功能实验 | 细胞系MG63和143B,外泌体处理浓度与时间,CCK-8检测时间,EdU浓度与孵育时间,Transwell小室基质胶包被 阅读提示:见'CCK-8'、'EdU'、'Cell migration and invasion'部分及图2图例 |
| XIST敲低与回复实验 | siRNA序列(siXIST#1/#2/#3),转染试剂Lipofectamine 3000,外泌体中XIST敲低效果验证,miR-655 antagomir浓度 阅读提示:见'Cell transfection'部分及Additional file 1: Fig. S2 |
| 靶向关系验证 | RNA pulldown中使用的生物素标记XIST转录本,双荧光素酶报告基因载体构建(XIST/ACLY 3'UTR野生型及突变型) 阅读提示:见'RNA pulldown'和'Dual luciferase reporter assay'部分 |
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别,细胞注射数量与部位(胫骨骨髓腔),分组及给药方案(外泌体1mg/kg,每3天一次共6次;anti-miR-655 80mg/kg连续3天) 阅读提示:见'Animal model construction and treatment'部分 |
| 脂质和β-catenin检测 | 油红O染色步骤,TG/TC检测试剂盒,β-catenin总/核蛋白提取及Western blot内参选择 阅读提示:见'Oil Red O staining'、'Triglyceride and total cholesterol'和'Western blot'部分 |