筛选铁死亡抑制剂
从天然化合物库中鉴定能抑制RSL-3诱导的铁死亡的化合物。
使用含96种化合物的天然产物库,在PC-12细胞中用0.5 μM RSL-3诱导铁死亡,以细胞活力为指标筛选。
A novel ferroptosis inhibitor, Thonningianin A, improves Alzheimer's disease by activating GPX4.
包含细胞实验(PC-12、SH-SY5Y、HeLa)、线虫模型(CL4176、BR5270等)、功能验证(细胞活力、铁死亡指标)及机制验证(GPX4、AMPK/Nrf2通路)等至少两个独立证据层级。
PC-12细胞(RSL-3诱导铁死亡模型) SH-SY5Y细胞 APP Swe/ind或Tau P301L过表达PC-12细胞 秀丽隐杆线虫AD模型(CL4176、BR5270)
RSL-3浓度0.5 μM诱导铁死亡 ThA浓度2-16 μM呈剂量依赖性保护作用 GPX4敲低(sh-GPX4)逆转ThA的保护作用 ML385(4 μM)抑制Nrf2后阻断ThA的效果 CC(5 μM)抑制AMPK后部分逆转ThA的效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从天然化合物库中鉴定能抑制RSL-3诱导的铁死亡的化合物。
使用含96种化合物的天然产物库,在PC-12细胞中用0.5 μM RSL-3诱导铁死亡,以细胞活力为指标筛选。
评估ThA对多种诱导剂(RSL-3、erastin、hemin、AFC、FeSO4)引起的铁死亡的影响。
使用MTT或CCK-8测定细胞活力,检测线粒体形态(Mito-Tracker)、MMP(JC-1)、ROS(DCFDA)、脂质过氧化物(C11 BODIPY、MDA、4-HNE)等。
探究ThA是否通过螯合铁离子抑制铁死亡。
使用TIBC测定铁结合能力,UV-vis和ITC测定与Fe2+的结合常数,PGSK染色检测细胞内铁水平,Western blot检测铁蛋白FTH/FTL表达。
验证ThA是否直接结合GPX4并增强其活性。
用Western blot检测GPX4蛋白表达,GPX4活性测定,UHPLC-DAD-Q/TOF-MS/MS分析结合,BLI测定亲和力,分子对接预测结合位点。
探究ThA是否通过激活Nrf2/Keap1通路抑制铁死亡。
Western blot检测Nrf2、HO-1、NQO1、GCLC表达,免疫沉淀检测Keap1-Nrf2相互作用,免疫荧光检测Nrf2核转位,使用ML385抑制Nrf2及Nrf2敲除HeLa细胞验证。
验证AMPK是否介导ThA对Nrf2和GPX4的激活。
Western blot检测p-AMPK、核Nrf2、GPX4,RT-PCR检测Nrf2和GPX4 mRNA,使用CC抑制AMPK,检测细胞活力和ROS/脂质过氧化物。
在AD细胞模型中评估ThA的抗铁死亡作用。
使用Aβ1-42处理或APP Swe/ind、Tau P301L过表达的PC-12细胞,检测细胞活力、死亡、铁积累、ROS和脂质过氧化物。
在体内AD模型中验证ThA的作用。
使用CL4176(Aβ)和BR5270(Tau)线虫,检测麻痹、食物感知行为、ROS(DHE)、脂质过氧化物(C11 BODIPY)、铁积累(Calcein-AM),MDA含量,以及RNAi敲低aak-2和skn-1的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Biosharp | -- | |
| 药物处理 | RSL-3 | Selleckchem | -- |
| Erastin | MedChemexpress | -- | |
| 氯化血红素 | TargetMol | -- | |
| 柠檬酸铁铵 | Selleckchem | -- | |
| 七水合硫酸亚铁 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 阳性对照 | 利普司他丁-1 | TargetMol | -- |
| Ferrostatin-1 | TargetMol | -- | |
| 去铁胺 | TargetMol | -- | |
| 抑制剂 | ML385 | TargetMol | -- |
| 化合物C | TargetMol | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | Sigma | -- |
| CCK-8试剂盒 | GlpBio | -- | |
| 细胞毒性检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0016 |
| 细胞死亡检测 | Hoechst 33342 | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Cayman | -- |
| ROS检测 | DCFDA | ThermoFisher Scientific | C6827 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1试剂盒 | Beyotime | C2006 |
| 铁结合检测 | 总铁结合力检测试剂盒 | Jiancheng Institute of Biotechnology | A040-1-1 |
| 铁离子检测 | PGSK荧光指示剂 | Cayman | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Topscience | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Epizyme | -- | |
| ECL底物 | 4A Biotech | -- | |
| 蛋白表达检测 | GPX4抗体 | ABclonal | A11243 |
| Nrf2抗体 | MBL | M200-3 | |
| Keap1抗体 | Cell Signaling Technology | 8047S | |
| p-AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2535L | |
| AMPK抗体 | Proteintech | 66536-1-Ig | |
| HO-1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| NQO-1抗体 | Proteintech | 11451-1-AP | |
| 4-HNE抗体 | Abcam | Ab46545 | |
| β-actin抗体 | Santacruz | K2818 | |
| 细胞转染 | Exfect 3000转染试剂 | Vazyme | -- |
| GPX4活性检测 | GPX4抑制剂筛选试剂盒 | Cayman | 701880 |
| 谷胱甘肽过氧化物酶4检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-PCR | Prime Script RT试剂盒 | Trans Serum | -- |
| ATP检测 | ATP含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0300 |
| 线虫培养 | 大肠杆菌OP50 | -- | -- |
| 线虫ROS检测 | 二氢乙啶 | -- | -- |
| 线虫铁检测 | 钙黄绿素-AM | Glpbio | GC34061 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | PC-12和SH-SY5Y细胞系来源(ATCC)、培养基DMEM+10%FBS+50U/mL青霉素+50μg/mL链霉素 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| 铁死亡诱导 | RSL-3浓度0.5 μM、erastin 20 μM、hemin 100 μM、AFC 5 mM、FeSO4 4 mM 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assay; Results: Figure 1-2 |
| 药物处理 | ThA浓度2-16 μM、Lip-1 0.2 μM、DFO 20 μM、ML385 4 μM、CC 5 μM 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability; Results: Figure 1-6 |
| GPX4敲低 | shRNA靶向GPX4(pLKO.1-U6-GPX4(human)-shRNA3-CMV-EGFP-hPGK-Puro; #P23908)、转染试剂Exfect 3000 阅读提示:Materials and Methods: Cell transfection, Chemicals |
| Nrf2敲除 | HeLa WT和Nrf2-/-细胞系来源(Abclonal #RM01812) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| 线虫模型 | CL4176(Aβ)、BR5270(Tau)株、生长温度20℃、NGM培养基、OP50喂食 阅读提示:Materials and Methods: Maintenance of C. elegans |
| 线虫处理 | ThA 20 μM、Lip-1 200 μM、RNAi喂食aak-2和skn-1 阅读提示:Materials and Methods: C. elegans paralysis, RNAi bacterial feeding |