验证MafG在肝纤维化中表达上调
检测MafG在人肝纤维化样本和小鼠肝纤维化模型中的表达水平。
通过免疫组化、Western blot和免疫荧光检测人正常和纤维化肝组织、CCL4和BDL小鼠模型肝组织以及细胞系中MafG的表达,并与α-SMA共定位。
MafG/MYH9-LCN2 axis promotes liver fibrosis through inhibiting ferroptosis of hepatic stellate cells.
包含体外细胞系和原代细胞实验、体内BDL和CCL4小鼠模型、患者样本分析,以及机制验证(ChIP、EMSA、荧光素酶报告基因、Co-IP、质谱)和功能验证(铁死亡指标检测)。
人肝星状细胞系LX-2 大鼠肝星状细胞系HSC-T6 小鼠BDL和CCL4诱导的肝纤维化模型 人肝纤维化/肝硬化活检样本
MafG敲低和过表达对HSC铁死亡的影响 MafG与MYH9的相互作用 MafG对LCN2启动子的转录调控 LCN2在MafG调控铁死亡中的作用 AAV6-shMafG和IKE在BDL小鼠模型中的体内效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测MafG在人肝纤维化样本和小鼠肝纤维化模型中的表达水平。
通过免疫组化、Western blot和免疫荧光检测人正常和纤维化肝组织、CCL4和BDL小鼠模型肝组织以及细胞系中MafG的表达,并与α-SMA共定位。
探索MafG是否参与HSC的铁死亡调控。
使用erastin处理HSC,观察MafG表达变化;敲低或过表达MafG后检测铁死亡指标(铁、MDA、GSH、脂质ROS、细胞活力、线粒体形态)。
确定MafG调控HSC铁死亡的下游靶基因。
利用ChIP-seq数据GSE92076和PCR筛选MafG靶基因,验证MafG对LCN2的转录调控,并通过ChIP、EMSA、荧光素酶报告基因实验确认MafG直接结合LCN2启动子。
研究LCN2是否介导MafG对HSC铁死亡的调控。
在MafG敲低的LX-2细胞中回补LCN2,检测铁死亡指标和纤维化标志物。
寻找MafG转录激活LCN2所需的协同因子。
通过质谱鉴定MafG相互作用蛋白,分析其与LCN2表达相关性,并通过Co-IP、免疫荧光验证MafG与MYH9的相互作用,并通过ChIP检测MYH9敲低对MafG结合LCN2启动子的影响。
评估靶向MafG在体内对铁死亡和肝纤维化的影响。
使用AAV6-shMafG在小鼠肝星状细胞中敲低MafG,结合IKE治疗,检测肝纤维化标志物、铁死亡指标和肝功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | AAV6-shControl | Hanbio biotechnology | -- |
| AAV6-shMafG | Hanbio biotechnology | -- | |
| 橄榄油 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | Erastin | Selleck Chemicals | S7242 |
| IKE | Selleck Chemicals | S8877 | |
| Ferrostatin-1 | Selleck Chemicals | S7243 | |
| Z-VAD-FMK | Selleck Chemicals | S7023 | |
| ML385 | Selleck Chemicals | S8790 | |
| 星形孢菌素 | Selleck Chemicals | S1421 | |
| 雷帕霉素 | Selleck Chemicals | S1039 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965092 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10100147C | |
| 抗生素 | Gibco | 15070063 | |
| 链霉蛋白酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | 101000027 |
| RNA提取和PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | -- | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | -- | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| 化学发光检测系统 | Syngene | -- | |
| 生化检测 | MDA检测试剂盒 | Abcam | ab118970 |
| 铁检测试剂盒 | Abcam | ab83366 | |
| GSH检测试剂盒 | Bestbio | BB-4711 | |
| AST检测试剂盒 | Abcam | ab263882 | |
| ALT检测试剂盒 | Abcam | ab282882 | |
| 脂质ROS检测 | 脂质ROS检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| 质谱与Co-IP | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 核蛋白提取 | NE-PER核浆蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78835 |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| pGL3-Basic载体 | Promega | -- | |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26159 |
| 细胞活力 | CCK8细胞计数试剂盒 | Vazyme | -- |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 荧光二抗 | Abcam | -- | |
| DAPI | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和铁死亡诱导 | 细胞系(LX-2、HSC-T6)、erastin浓度(0-10 μM)、处理时间(24小时)、抑制剂浓度(ferrostatin-1 5 μM、Z-VAD-FMK 10 μM) 阅读提示:Methods and materials: Antibodies and reagents, Cell viability, 图2和图3图注 |
| 基因敲低和过表达 | 转染试剂(jetPRIME)、shRNA/siRNA/质粒序列和来源 阅读提示:Methods and materials: RNAi and transfection;补充表3 |
| 转录调控验证 | LCN2启动子及突变构建、ChIP引物、EMSA探针、荧光素酶报告基因系统 阅读提示:Methods and materials: Luciferase reporter assay, ChIP assay, EMSA |
| 蛋白质相互作用 | 免疫共沉淀和质谱的抗体、细胞裂解条件 阅读提示:Methods and materials: Mass spectrometry and co-IP, Nuclear extraction |
| 动物模型 | 小鼠品系和性别(8-12周龄雄性C57BL/6)、CCL4剂量(1 μl/g体重)和频率、BDL手术方案、AAV6注射剂量(1×10^12 vg/mL,100 μl)、IKE剂量(40 mg/kg)和时间 阅读提示:Methods and materials: Animal models;图7图注 |
| 铁死亡指标检测 | MDA、铁、GSH、脂质ROS检测试剂盒和操作步骤 阅读提示:Methods and materials: Biochemical assay |