患者入组和分组
比较VDI与非VDI CSU患者的临床特征和微生物组。
招募36例VDI和36例匹配的非VDI CSU患者,收集临床资料,采集空腹血液和粪便样本。
Associations of Gut and Circulating Microbiota with Circulating Vitamin D3, Type I Interferon, and Systemic Inflammation in Chronic Spontaneous Urticaria Patients.
包含临床样本分组(VDI与非VDI)、16S rRNA测序、ELISA和细胞荧光素酶实验,有明确验证,但缺乏功能或机制验证,属相关性研究。
CSU患者(VDI与非VDI) HEK293细胞(表达IFNAR1/2)
血清25(OH)VD3水平(<30 ng/mL定义为VDI) IFNI反应强度(HEK293细胞ISRE荧光素酶活性) 粪便和血清16S rRNA测序(V3-V4区) 左西替利嗪耐药定义(5 mg/天,2周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较VDI与非VDI CSU患者的临床特征和微生物组。
招募36例VDI和36例匹配的非VDI CSU患者,收集临床资料,采集空腹血液和粪便样本。
评估两组患者的疾病活动度、全身炎症水平和IFNI反应。
使用ELISA检测血清25(OH)VD3、总IgE、IL6、CRP、claudin 3和粪便钙卫蛋白;使用HEK293细胞荧光素酶测定IFNI反应强度。
比较两组粪便菌群多样性和组成差异。
提取粪便DNA,进行16S rRNA V3-V4区域测序,并进行α多样性、β多样性和LEfSe分析。
分析VDI患者循环菌群组成及其与临床特征的关系。
从血清中提取DNA,扩增16S rRNA V3-V4片段并进行测序,进行生物信息学分析。
探讨微生物丰度与临床指标(VD3、IFNI、炎症参数等)之间的关联。
使用部分Pearson相关分析,控制年龄、性别和BMI,计算相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA | 人25(OH)VD3 ELISA试剂盒 | Meimian | 50347H1 |
| 总IgE ELISA试剂盒 | Meimian | 5613 | |
| IL6 ELISA试剂盒 | 3SBio | E000482 | |
| CRP ELISA试剂盒 | 3ABio | E007462 | |
| 紧密连接蛋白3 ELISA试剂盒 | Abbexa | abx250611 | |
| 粪便检测 | 粪便钙卫蛋白ELISA试剂盒 | Meimian | 13732 |
| 血清DNA提取 | QIAamp DNA血液迷你试剂盒 | Qiagen | 51104 |
| PCR产物纯化 | DNA产物纯化试剂盒 | Tiangen | DP203 |
| 荧光素酶检测 | 荧光素酶检测系统试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞系 | HEK293细胞 | Procell | CL-0001 |
| 测序 | MiSeq测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组 | VDI定义:血清25(OH)VD3 <30 ng/mL;纳入标准:年龄≥18岁,按EAACI/GA²LEN/EDF/WAO标准诊断;排除标准:其他过敏或自身免疫病、系统性及消化道手术史、免疫抑制剂使用等。 阅读提示:Methods: Study Population |
| 左西替利嗪耐药性确定 | 给药方案:左西替利嗪5 mg/天口服2周,无改善定义为耐药。 阅读提示:Methods: Study Population |
| 血清指标检测 | 使用相应ELISA试剂盒检测25(OH)VD3、总IgE、IL6、CRP、claudin 3;试剂盒品牌和货号见Methods。 阅读提示:Methods: Blood Collection and Related Assessment |
| IFNI反应强度测定 | HEK293细胞稳定表达IFNAR1/2;转染p-ISRE-FLuc (100 ng/well) 和p-RLuc (20 ng/well) 24小时,加血清 (100 μL/well) 24小时,测荧光素酶活性,计算Fluc/Rluc比值。 阅读提示:Methods: Blood Collection and Related Assessment |
| 粪便和血清16S rRNA测序 | 使用通用引物扩增V3-V4区域;粪便或血清DNA提取方法;测序平台为Illumina MiSeq;VDI组循环微生物组样本数为30,non-VDI为4。 阅读提示:Methods: Blood Collection and Related Assessment; Fecal Sample Collection and Related Determination |
| 统计分析 | 组间比较使用卡方检验或t检验;相关性分析使用偏Pearson相关控制年龄、性别、BMI;P<0.05为显著。 阅读提示:Methods: Bioinformatic Analysis |