诱导M2型巨噬细胞极化并检测ITA释放
验证鼻咽癌细胞是否影响巨噬细胞极化和ITA产生
将THP-1来源的M0型巨噬细胞与HK-1或NEC细胞共培养48小时,或单独用IL-4/IL-13刺激;通过流式检测CD206表达,Western blot检测CD206和Arg-1,ELISA检测IL-6、IL-10和VEGF,GC-MS检测ITA浓度
Tumor-associated macrophage-derived itaconic acid contributes to nasopharyngeal carcinoma progression by promoting immune escape via TET2.
包含体外细胞共培养、siRNA敲低、T细胞杀伤实验、动物模型(人源化小鼠和裸鼠)、免疫荧光和免疫组化等多层级验证。
THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 HK-1和HNE2鼻咽癌细胞系 CD34+造血干细胞人源化小鼠(huHSC-NCG) BALB/c裸鼠
M2型巨噬细胞极化通过IL-4和IL-13诱导,浓度均为20 ng/mL ITA处理浓度:125 µM(体外)和50 mg/kg(体内) si-IRG1和si-TET2敲低效率验证 CD8+ T细胞杀伤实验使用OT-I小鼠来源的T细胞和SIINFEKL肽 动物实验分组:ITA、抗PD-L1抗体及其联合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证鼻咽癌细胞是否影响巨噬细胞极化和ITA产生
将THP-1来源的M0型巨噬细胞与HK-1或NEC细胞共培养48小时,或单独用IL-4/IL-13刺激;通过流式检测CD206表达,Western blot检测CD206和Arg-1,ELISA检测IL-6、IL-10和VEGF,GC-MS检测ITA浓度
确定TAM中IRG1介导的ITA产生是否影响NPC细胞增殖、迁移和侵袭
用si-IRG1敲低THP-1细胞中IRG1,与HK-1或HNE2细胞共培养,进行CCK-8、克隆形成、划痕和Transwell侵袭实验;加入外源性ITA观察表型逆转
探究IRG1/ITA对TAM功能(M2极化和吞噬)的调控
将敲低IRG1的TAM与HK-1或HNE2细胞共培养,流式检测CD206+比例,ELISA检测细胞因子,用MitoTracker Deep Red标记的NPC细胞检测吞噬功能
验证TAM中IRG1介导的ITA是否抑制CD8+ T细胞对NPC细胞的杀伤
从OT-I小鼠脾脏分离CD8+ T细胞,与表达SIINFEKL的NPC细胞共培养,用不同条件培养基处理;检测细胞凋亡、荧光素酶活性和IFN-γ释放
在动物模型中确认ITA是否通过免疫逃逸促进NPC生长
将HK-1细胞植入人源化小鼠或裸鼠,给予ITA和/或抗PD-L1抗体,测量肿瘤体积;通过免疫荧光检测M2型TAM浸润,免疫组化检测CD8表达
探索ITA是否通过抑制TET2实现免疫抑制功能
用不同浓度ITA处理M0型巨噬细胞检测5hmC水平;敲低TET2后检测M2极化、细胞因子、吞噬和T细胞杀伤功能
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo | -- |
| RPMI-1640培养基 | Sigma | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Pricella | -- | |
| β-巯基乙醇 | Sigma | -- | |
| 巨噬细胞极化 | 佛波酯 | Sigma | -- |
| 白细胞介素-4 | Sigma | -- | |
| 白细胞介素-13 | Sigma | -- | |
| 细胞转染 | HiPerFect转染试剂 | Qiagen | -- |
| Opti-MEM无血清培养基 | -- | -- | |
| 细胞共培养 | Transwell系统 | Corning | 3450 |
| 药物处理 | 衣康酸 | Abmole | -- |
| 流式分析 | CD206 APC抗体 | Biolegend | 141714 |
| Annexin V-FITC和碘化丙啶 | Beyotime | C1062L | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| BCA试剂盒 | -- | 23227 | |
| CD206抗体 | Fine Biotech | FNab09812 | |
| Arg-1抗体 | Boster | PA1783 | |
| IRG1抗体 | Cell Signaling Technology | 17805S | |
| β-肌动蛋白抗体 | Fine Biotech | FNab00869 | |
| TET2抗体 | Biorbyt | orb537560 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Tanon | -- | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EH2IL6 |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Sino Biological | KIT10947A | |
| VEGF ELISA试剂盒 | Sino Biological | SEK10008 | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | MyBioSource.com | MBS262163 | |
| 代谢物检测 | 安捷伦7890A气相色谱仪 | Agilent Technologies | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Ambion | 15596-026 |
| Primescript™逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| TB Green® Premix Ex Taq™ II | Takara | RR820A | |
| 克隆形成实验 | 结晶紫 | Solarbio | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| T细胞功能实验 | EasySep™小鼠CD8+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19853 |
| CD3抗体 | Bioxcell | BE0001-1 | |
| CD28抗体 | Bioxcell | BE0015-1 | |
| 白细胞介素-2 | R&D Systems | 402-ML-020 | |
| SIINFEKL肽 | MCE | HY-P1489 | |
| T细胞杀伤实验 | pHIV-luc-zsgreen质粒 | Addgene | 39196 |
| psPAX2质粒 | Addgene | 12260 | |
| pMD2.G质粒 | Addgene | 12259 | |
| D-荧光素 | Sigma | -- | |
| 动物实验 | 抗PD-L1抗体 | Bioxcell | BE0146 |
| 同型对照 | Bioxcell | BE0089 | |
| 免疫荧光 | F4/80抗体 | Fine Biotech | FNab02922 |
| CD163抗体 | EpiGentek | A72933 | |
| DAPI染色液 | Beyotime | -- | |
| 免疫组化 | CD8抗体 | LSBio | LS-C414175 |
| 斑点印迹 | 基因组DNA纯化试剂盒 | Thermo | K0512 |
| 5hmC抗体 | Active Motif | 39769 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与极化 | 细胞系来源和培养条件;PMA浓度和诱导时间;IL-4和IL-13浓度和刺激时间 阅读提示:Methods and materials: Cell culture, Mφ polarization |
| 共培养体系 | Transwell孔径;NPC细胞和巨噬细胞的数量;共培养时间 阅读提示:Methods and materials: Cell co-culture; Figure legends 1-3 |
| 基因敲低 | siRNA序列和转染试剂;转染时间和效率验证方法 阅读提示:Methods and materials: Cell transfection; Figure legends 2A-B, 7B-C |
| 功能实验 | CCK-8检测时间点;克隆形成培养时间;划痕实验观察时间;侵袭实验细胞数和时间 阅读提示:Methods and materials: Colony formation assay, Wound healing assay, Transwell invasion assay; Figure legends 2C-F |
| T细胞功能实验 | CD8+ T细胞分离和扩增条件;SIINFEKL表达;效应细胞与靶细胞比例;共培养时间;凋亡和杀伤检测方法 阅读提示:Methods and materials: T-cell functional assay; Figure legends 4 |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别;细胞接种数量;ITA剂量和给药方式;抗PD-L1剂量和频率;肿瘤生长测量时间 阅读提示:Methods and materials: Animal experiments; Figure legends 5-6 |
| 免疫检测 | IF和IHC抗体的稀释比例、孵育时间;图像采集和分析设备 阅读提示:Methods and materials: Immunofluorescence, Immunohistochemistry; Figure legends 5D-E |