检测IGF2BP2和NRP1在BCa组织和细胞中的表达
评估IGF2BP2和NRP1在BCa组织和细胞中的表达水平及其相关性。
使用RT-qPCR和Western blot检测55对BCa肿瘤组织和癌旁正常组织中IGF2BP2和NRP1的mRNA和蛋白水平;检测BCa细胞系(T24, 5637)和正常细胞SV-HUC-1中的蛋白水平;使用UALCAN数据库分析表达及相关性。
m6A reader IGF2BP2 promotes M2 macrophage polarization and malignant biological behavior of bladder cancer by stabilizing NRP1 mRNA expression.
包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型、巨噬细胞共培养极化模型以及MeRIP/RIP机制验证,多个独立证据层级且含功能与机制验证。
膀胱癌细胞系T24和5637 人尿路上皮永生化细胞SV-HUC-1 单核细胞白血病细胞THP-1诱导的M0巨噬细胞 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
IGF2BP2和NRP1的表达水平(mRNA和蛋白)在BCa组织和细胞中的变化 IGF2BP2敲低对BCa细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响(sh-IGF2BP2-1) IGF2BP2敲低对异种移植瘤生长的影响(5637细胞注射BALB/c裸鼠,n=5/组) THP-1-M0巨噬细胞与BCa细胞条件培养基共培养后M2标志物(CD206、Arginase-1、IL-10、TGF-β)和CD163+比例的变化 MeRIP/RIP实验验证m6A修饰和IGF2BP2与NRP1 mRNA的结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估IGF2BP2和NRP1在BCa组织和细胞中的表达水平及其相关性。
使用RT-qPCR和Western blot检测55对BCa肿瘤组织和癌旁正常组织中IGF2BP2和NRP1的mRNA和蛋白水平;检测BCa细胞系(T24, 5637)和正常细胞SV-HUC-1中的蛋白水平;使用UALCAN数据库分析表达及相关性。
验证IGF2BP2对BCa细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。
在T24和5637细胞中敲低或过表达IGF2BP2,分别进行集落形成实验、EdU实验、CCK8实验、流式细胞术和transwell实验检测细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭。
在体内验证IGF2BP2对BCa肿瘤生长的影响。
将稳定敲低IGF2BP2(sh-IGF2BP2)或对照(sh-NC)的5637细胞皮下注射至BALB/c裸鼠,定期测量肿瘤体积,30天后处死取材称重,并进行IHC染色检测IGF2BP2、Ki-67和E-cadherin表达。
探究IGF2BP2对THP-1-M0巨噬细胞极化和迁移的影响。
将THP-1-M0巨噬细胞与转染sh-NC/sh-IGF2BP2的T24和5637细胞的条件培养基(CM)共培养24小时,检测M2标志物(CD206、Arginase-1、IL-10、TGF-β)的mRNA水平和CD163+细胞比例及迁移能力。
验证IGF2BP2是否作为m6A阅读器结合NRP1 mRNA并增强其稳定性。
通过SRAMP预测NRP1 mRNA的m6A位点;通过MeRIP实验检测m6A富集;通过RIP实验检测IGF2BP2与NRP1 mRNA的结合是否依赖m6A;通过放线菌素D实验检测NRP1 mRNA稳定性。
验证NRP1是否介导IGF2BP2对BCa细胞和M2巨噬细胞极化的作用。
在T24和5637细胞中共转染sh-IGF2BP2和OE-NRP1,检测细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭;收集CM培养THP-1-M0巨噬细胞,检测M2标志物和CD163+比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| Ham's F-12 K培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | -- | |
| 诱导巨噬细胞极化 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Solarbio | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green荧光染料 | Takara | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | 抗IGF2BP2抗体 | Proteintech | 11601-1-AP |
| 抗NRP1抗体 | Proteintech | 60067-1-Ig | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| 山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| EdU实验 | EdU细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| CCK8实验 | CCK8试剂 | Beyotime | -- |
| 流式细胞术 | FITC标记的抗CD11b抗体 | Abcam | ab269333 |
| PE标记的抗CD163抗体 | Abcam | ab95613 | |
| Transwell实验 | 基质胶 | Corning Inc. | -- |
| 动物实验 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 免疫组化 | SP免疫组化检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 抗Ki-67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP | |
| 抗E-钙粘蛋白抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| MeRIP实验 | 抗m6A抗体 | -- | -- |
| RIP实验 | 抗IGF2BP2抗体 | -- | -- |
| 蛋白A/G磁珠 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 55对BCa肿瘤组织和配对癌旁正常组织,病理确诊,未接受术前手术和放化疗 阅读提示:Materials and methods, Samples |
| 细胞培养与转染 | 细胞系(T24、5637、SV-HUC-1、THP-1)及培养条件;转染试剂(Lipofectamine 3000);sh-IGF2BP2-1的使用 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 体外功能实验 | 细胞接种密度、处理时间、试剂浓度(如EdU 10 μM,CCK8 10 μL,Annexin V/PI 5 μL) 阅读提示:Materials and methods, Colony formation assay, EdU assay, CCK8 assay, Flow cytometry, Transwell assay |
| 体内异种移植瘤模型 | 5637细胞(2×10^6)注射入BALB/c裸鼠(n=5/组),肿瘤测量频率(每5天),实验周期(30天) 阅读提示:Materials and methods, Mice xenograft models |
| 巨噬细胞极化实验 | THP-1细胞经PMA(100 ng/mL)诱导24小时为M0;CM收集条件(2×10^7细胞/板,48小时);共培养时间(24小时);M2标志物检测(RT-qPCR和流式) 阅读提示:Materials and methods, Co-culture system, Flow cytometry |
| 机制验证实验 | MeRIP实验中抗体(anti-m6A/anti-IgG);RIP实验中抗体(anti-IGF2BP2)和METTL3敲低;mRNA稳定性实验中Actinomycin D浓度(5 μg/mL)和处理时间(0, 4, 8小时) 阅读提示:Materials and methods, MeRIP assay, RIP assay, mRNA stability assay |