基于基质免疫评分与WGCNA及ceRNA网络分析探索与乳腺癌放疗敏感性相关的关键基因

背景：乳腺癌是一种全球范围内的高度恶性肿瘤，但目前尚无足够的分子生物标志物来预测患者预后和指导放疗。肿瘤微环境（TME）是影响肿瘤生物学功能的重要因素，在放疗期间其组成的变化与肿瘤进展和预后同样相关。方法：本文利用从癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库获得的数据进行生物信息学分析，以筛选可能影响放疗敏感性的与TME相关的分子生物标志物。通过结合免疫评分和基质评分并进行加权共表达网络分析（WGCNA），我们确定了关键模块和枢纽基因，以构建竞争性内源RNA（ceRNA）网络。然后，利用基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析鉴定了关键通路和基因。此外，我们通过细胞实验探讨了THBS2对乳腺癌恶性表型的影响。结果：蓝色模块中PI3K-AKT通路中的基因显著富集。在蓝色模块的枢纽基因中，COL1A1、COL1A2、COL6A3、THBS2和PDGFRB与放疗敏感性呈负相关。细胞实验证实，敲低THBS2可抑制乳腺癌细胞的增殖和侵袭。结论：这些发现可能为乳腺癌患者放疗敏感性的机制提供新的见解，为发现新的治疗靶点带来希望。