建立哮喘模型并检测circUQCRC2表达
验证circUQCRC2在哮喘状态下的表达变化及环状特性。
建立OVA诱导的小鼠哮喘模型和PDGF-BB刺激的SMC模型,通过RT-qPCR检测circUQCRC2表达,并利用RNase R实验和亚细胞定位分析其环状特性和细胞分布。
circUQCRC2 promotes asthma progression in children by activating the VEGFA/NF-κB pathway by targeting miR-381-3p.
包含体内OVA诱导小鼠哮喘模型和体外PDGF-BB刺激的SMC模型,并进行功能验证(增殖、迁移、炎症、氧化应激)和机制验证(双荧光素酶、RIP、Western blot),证据层级独立且完整。
OVA诱导的BALB/c小鼠哮喘模型 PDGF-BB刺激的小鼠平滑肌细胞(SMC)模型
小鼠模型:2周龄雌性BALB/c小鼠,在第0天和第14天皮下注射20μg OVA(含2mg氢氧化铝佐剂),第22-28天雾化吸入1% OVA,每日30分钟;sh-circUQCRC2(3mg/mL,50μL)气管内注射 细胞模型:小鼠SMCs(CP-M158)用25ng/mL PDGF-BB处理24小时 转染试剂:Lipofectamine 2000 检测指标:IL-6、TNF-α、MDA、NO、SOD、α-SMA、E-cadherin、VEGFA、p-NF-κB p65 统计方法:数据以mean±SD表示,采用Student's t检验和单因素方差分析,p<0.05为差异有统计学意义
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证circUQCRC2在哮喘状态下的表达变化及环状特性。
建立OVA诱导的小鼠哮喘模型和PDGF-BB刺激的SMC模型,通过RT-qPCR检测circUQCRC2表达,并利用RNase R实验和亚细胞定位分析其环状特性和细胞分布。
评估敲低circUQCRC2对OVA诱导哮喘小鼠病理状态的影响。
在哮喘小鼠气管内注射sh-circUQCRC2,通过ELISA检测氧化应激指标(MDA、NO、SOD)和炎症因子(IL-6、TNF-α),检测BALF中炎症细胞计数,HE染色和Masson染色观察肺部病理和胶原沉积。
评估敲低circUQCRC2对PDGF-BB诱导的SMC增殖、迁移、炎症和氧化应激的影响。
将si-circUQCRC2转染至SMCs,通过CCK-8、Transwell、Western blot和ELISA分别检测细胞增殖、迁移、α-SMA/E-cadherin表达及炎症和氧化应激指标。
验证circUQCRC2是否作为miR-381-3p的分子海绵。
通过starBase预测结合位点,双荧光素酶报告基因和RIP实验验证circUQCRC2与miR-381-3p的直接结合。
验证miR-381-3p是否直接靶向VEGFA。
通过RT-qPCR和Western blot检测VEGFA表达,双荧光素酶报告基因和RIP实验验证miR-381-3p与VEGFA的靶向关系。
验证circUQCRC2通过miR-381-3p/VEGFA轴激活NF-κB通路。
通过Western blot检测小鼠肺组织和SMCs中VEGFA表达和NF-κB磷酸化水平,并验证miR-381-3p inhibitor和VEGFA过表达对NF-κB通路的影响。
验证miR-381-3p inhibitor和VEGFA过表达是否逆转circUQCRC2敲低的效果。
在SMCs中共转染si-circUQCRC2与miR-381-3p inhibitor或VEGFA过表达质粒,检测细胞增殖、迁移、α-SMA/E-cadherin表达及炎症和氧化应激指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 卵清蛋白 | Sigma | -- |
| 氢氧化铝佐剂 | -- | -- | |
| shRNA慢病毒载体 | GenePharma | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 血小板衍生生长因子-BB | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| HiScript II第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- | |
| miRNA反转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green检测 | Cowin Biotech | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab212059 | |
| VEGFA抗体 | Abcam | ab46154 | |
| 磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3039 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abcam | ab205719 | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | ab124055 | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab222503 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Abcam | ab208348 | |
| SOD检测试剂盒 | Nanjing Jiengcheng Bioengineering Institute | A001-3-2 | |
| NO检测试剂盒 | Nanjing Jiengcheng Bioengineering Institute | A012-1-2 | |
| MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiengcheng Bioengineering Institute | A003-1-2 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞迁移检测 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | pmirGLO荧光素酶载体 | GenePharma | -- |
| 荧光素酶报告基因检测系统试剂盒 | Promega | -- | |
| RNA免疫沉淀 | Magna RIP RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| Ago2抗体 | Abcam | ab186733 | |
| IgG抗体 | Abcam | ab6789 | |
| 亚细胞定位 | PARIS蛋白和RNA分离系统试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA稳定性分析 | 核糖核酸酶R | Epicenter Technologies | -- |
| HE染色 | HE染液 | Sigma-Aldrich | -- |
| Masson染色 | Weigert染液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 丽春红酸溶液 | -- | -- | |
| 苯胺蓝 | -- | -- | |
| 细胞计数 | 血细胞计数器 | Drew Scientific | Hemavet |
| 显微镜观察 | 光学显微镜 | Leica | -- |
| Masson染色图像采集 | 尼康显微镜 | Nikon | -- |
| 分光光度计 | Spectra Max 250分光光度计 | Molecular Devices | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠品系、年龄、性别;OVA剂量、佐剂类型和剂量;致敏和激发时间及方式;sh-circUQCRC2给药剂量和途径 阅读提示:Materials and Methods 2.1 Animal model |
| 细胞培养与处理 | SMC细胞系来源;培养基类型;PDGF-BB处理浓度和时间;培养条件(CO2浓度、温度) 阅读提示:Materials and Methods 2.5 Cell culture and transfection |
| 转染条件 | 转染试剂;转染时细胞密度;siRNA、mimic、inhibitor、质粒浓度和转染时间 阅读提示:Materials and Methods 2.5 Cell culture and transfection |
| circUQCRC2敲低效率验证 | si-circUQCRC2序列和转染后敲低效率;sh-circUQCRC2在体内的敲低效率 阅读提示:Materials and Methods 2.5 and Results 3.2 |
| 机制验证实验 | 双荧光素酶报告基因实验中的载体构建、突变位点、共转染比例;RIP实验中的抗体、细胞裂解量 阅读提示:Materials and Methods 2.12 and 2.13 |
| Western blot | 一抗稀释比例、孵育条件;二抗稀释比例;内参蛋白选择 阅读提示:Materials and Methods 2.10 |