患者及小鼠来源CAFs的分离和鉴定
获取并验证从RCC肿瘤组织和肿瘤旁组织分离的CAFs和NFs的细胞特性。
从患者肿瘤组织和肿瘤旁组织以及Renca细胞荷瘤BALB/c小鼠的肿瘤组织中分离原代CAFs和NFs,并通过免疫荧光染色、实时PCR和Western blot鉴定CAF标志物表达。
CXCL3/TGF-β-mediated crosstalk between CAFs and tumor cells augments RCC progression and sunitinib resistance.
包含体外细胞实验、小鼠皮下及尾静脉转移模型、患者组织样本分析、蛋白质组学及TCGA数据库分析,并进行了功能验证(siRNA、过表达、抑制剂)和机制验证(ERK1/2、Smad2/3通路)。
人肾癌细胞系786-O和ACHN 小鼠肾癌细胞系Renca 小鼠胚胎成纤维细胞NIH-3T3和MEF BALB/c小鼠皮下移植瘤和尾静脉肺转移模型
患者来源CAFs和NFs的分离及条件培养基制备;CAFs-CM和NFs-CM均以1:1比例与新鲜培养基混合。 舒尼替尼处理浓度及时间;体外细胞实验处理24小时,体内给药剂量为40 mg/kg每日口服。 CXCL3重组蛋白处理浓度:10 ng/mL为最佳浓度,用于功能实验。 siRNA敲低CXCL3(siCXCL3-283)和TGF-β的序列及转染试剂(Lipofectamine 3000)。 CXCR2抑制剂SB225002的浓度及给药方式;体外实验和体内腹腔注射10 mg/kg每日。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并验证从RCC肿瘤组织和肿瘤旁组织分离的CAFs和NFs的细胞特性。
从患者肿瘤组织和肿瘤旁组织以及Renca细胞荷瘤BALB/c小鼠的肿瘤组织中分离原代CAFs和NFs,并通过免疫荧光染色、实时PCR和Western blot鉴定CAF标志物表达。
验证CAFs是否通过旁分泌因子促进肾癌细胞增殖、迁移、侵袭和舒尼替尼耐药。
将786-O、ACHN和Renca细胞用CAFs-CM(条件培养基与新鲜培养基1:1混合)处理,检测细胞活力、迁移、侵袭、伤口愈合及舒尼替尼敏感性。
在动物模型中验证CAFs对Renca细胞肿瘤生长、肺转移和舒尼替尼疗效的影响。
将Renca细胞单独或与CAFs(1:1)皮下共注射建立皮下瘤模型,或尾静脉注射建立肺转移模型;使用舒尼替尼或SB225002处理,测量肿瘤体积、重量和肺转移结节。
筛选并确认CAFs分泌的促进肿瘤进展的可溶性蛋白。
采用无标记蛋白质组学比较CAFs和NFs(NIH-3T3)无血清条件培养基的分泌蛋白,差异蛋白中CXCL3显著升高;ELISA和qPCR验证CXCL3水平。
确认外源性CXCL3是否直接促进肾癌细胞增殖、迁移和耐药。
用不同浓度CXCL3(0.5-50 ng/mL)刺激Renca细胞,选择10 ng/mL进行后续实验;检测细胞活力、迁移、侵袭和对舒尼替尼的敏感性。
通过敲低CAFs中CXCL3或过表达NIH-3T3中CXCL3,验证其作为CAFs效应分子的必要性。
用siRNA敲低CAFs中的Cxcl3(siCXCL3-283最有效),或用过表达质粒转染NIH-3T3,收集条件培养基处理Renca细胞,评估增殖、迁移和耐药变化。
验证CXCL3通过CXCR2激活ERK1/2通路并促进EMT和干细胞特性。
检测CAFs-CM或CXCL3处理后Renca细胞中CXCR2表达及ERK1/2磷酸化水平;使用CXCR2抑制剂SB225002阻断;检测EMT标志物(N-cadherin、E-cadherin)和干细胞标志物(CD133等)的表达。
确定肿瘤细胞是否通过TGF-β促进NFs向CAFs转化并上调CXCL3表达。
用Renca条件培养基(Renca-CM)或TGF-β处理NIH-3T3和MEF,检测CAF标志基因和Cxcl3表达;用siRNA敲低Renca中的TGF-β,检测对成纤维细胞Cxcl3表达的影响;检测Smad2/3磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT | |
| Renca细胞培养基 | Procell | CM-0568 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | 15140122 | |
| 转染 | CTS™ Opti-MEM™ I培养基 | Gibco | A4124802 |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | Gibco | 12604021 |
| 细胞冻存液 | Gibco | 12648-010 | |
| CAFs分离 | 胶原酶A | Roche | 10103578001 |
| 细胞增殖和毒性 | 增强型CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0043 |
| ELISA | CXCL3酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0147c |
| 药物处理 | 舒尼替尼苹果酸盐 | Cayman | 13159 |
| SB225002 | Topscience | T1955 | |
| 细胞处理 | 重组人GRO-γ(CXCL3) | Cloud-Clone | RPB604Hu01 |
| 重组人TGF-β1 | Peprotech | 100-21 | |
| 转染 | Lipofectamine™ 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| Western blot | PageRuler预染蛋白分子量标准 | Thermo Fisher | 26616 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂 | Vazyme | R401-01 |
| Western blot | 兔抗α-SMA多克隆抗体 | Proteintech | 55355-1-AP |
| 兔抗FSP1多克隆抗体 | Proteintech | 16105-1-AP | |
| 兔抗FAP多克隆抗体 | Solarbio life science | K004451P | |
| 兔抗波形蛋白多克隆抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 兔抗CXCL3多克隆抗体(GRO gamma抗体) | Affinity | DF8554 | |
| 兔抗CXCR2多克隆抗体 | Proteintech | 20634-1-AP | |
| 兔抗磷酸化ERK1/2 (Thr202/Tyr204)多克隆抗体 | Proteintech | 28733-1-AP | |
| 兔抗ERK1/2多克隆抗体 | Proteintech | 16443-1-AP | |
| 兔抗CD133多克隆抗体 | Proteintech | 18470-1-AP | |
| 兔抗N-钙粘蛋白多克隆抗体 | Boster | BM3921 | |
| 兔抗泛钙粘蛋白单克隆抗体 | Boster | BM4166 | |
| 兔抗磷酸化SMAD2 (S250)抗体 | Boster | BM4693 | |
| 磷酸化Smad3(Ser423/425)(C25A9)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9520T | |
| 小鼠抗SMAD2单克隆抗体 | Proteintech | 67343-1-lg | |
| 小鼠抗SMAD3单克隆抗体 | Proteintech | 66516-1-lg | |
| 小鼠抗GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗小鼠IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| 流式细胞术 | FITC标记抗小鼠CD182(CXCR2)抗体 | Biolegend | 149310 |
| 细胞系 | 786-O细胞系 | Procell | CL-0010 |
| ACHN细胞系 | Procell | CL-0021 | |
| Renca细胞系 | Procell | CL-0568 | |
| NIH-3T3细胞系 | Zhongqiaoxinzhou Biotech | ZQ0096 | |
| 动物实验 | 野生型BALB/c小鼠 | Lingchang | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞培养基和添加物(如FBS、青霉素-链霉素、NEAA等);细胞系(786-O、ACHN、Renca、NIH-3T3)的来源和培养条件;CAFs和NFs的分离和培养条件(胶原酶A消化时间、培养天数、传代次数)。 阅读提示:STAR★Methods:Experimental model and study participant details;Cell culture;Isolation of Cancer-associated fibroblasts |
| 体外功能实验 | CAFs-CM和NFs-CM的制备(1:1混合);处理时间(24小时、36小时);舒尼替尼浓度梯度;CXCL3刺激浓度(10 ng/mL);SB225002浓度;细胞接种密度(如迁移实验7.5×10^4细胞)。 阅读提示:STAR★Methods:Method details(Cell proliferation and cytotoxicity assay;Invasion and migration assays;Wound healing;Colony formation) |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c)、年龄、性别、饲养条件;皮下肿瘤模型细胞数量(1×10^6);共注射比例(1:1);给药方案(舒尼替尼40 mg/kg口服,SB225002 10 mg/kg腹腔注射,PBS对照组);肿瘤体积测量频率(每3天)。 阅读提示:STAR★Methods:Animal experiments |
| 分子机制验证 | siRNA序列和转染试剂(Lipofectamine 3000);CXCL3过表达质粒;Western blot抗体信息(1:1000稀释);qPCR引物和试剂;smad2/3磷酸化检测条件。 阅读提示:STAR★Methods:Method details(Plasmid or small interfering RNA transfection;Real-time PCR analysis;Western blot analysis) |
| 蛋白质组学分析 | 无血清条件培养基收集时间(24小时);样本处理和分析方法;差异蛋白筛选标准。 阅读提示:STAR★Methods:Label-free proteomics sequencing |