构建重组病毒
构建携带GM-CSF的辛德比斯病毒载体,并验证其稳定表达外源基因的能力。
使用先前构建的pSINV、pSINV-EGFP和pSINV-GM-CSF质粒,其nsP1基因包含G285S突变。将EGFP(GenBank: OQ870305)和GM-CSF(GenBank: NM_009969)基因插入ApaI和NotI位点,经DNA测序验证。
Oncolytic Activity of Sindbis Virus with the Help of GM-CSF in Hepatocellular Carcinoma.
包含体外细胞感染与杀伤实验、体内皮下移植瘤模型治疗、单细胞RNA测序分析肿瘤微环境,并进行了功能验证和机制探讨。
Hep3B肝癌细胞系 Hep3B-Luc皮下异种移植瘤裸鼠模型 Huh-7、HepG2肝癌细胞系 BHK-21细胞系
病毒构建:nsP1蛋白G285S突变,插入GM-CSF基因(GenBank: NM_009969) 体外感染:MOI=1,感染后24小时观察荧光,48小时检测细胞活力 体内治疗:5×10^6 PFU病毒瘤内注射,三次,隔日一次,15天后IVIS成像 单细胞RNA测序:每组3只小鼠肿瘤组织混合,BD Rhapsody平台,Illumina NovaSeq 6000测序
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建携带GM-CSF的辛德比斯病毒载体,并验证其稳定表达外源基因的能力。
使用先前构建的pSINV、pSINV-EGFP和pSINV-GM-CSF质粒,其nsP1基因包含G285S突变。将EGFP(GenBank: OQ870305)和GM-CSF(GenBank: NM_009969)基因插入ApaI和NotI位点,经DNA测序验证。
评估SINV对肝细胞癌细胞的选择性感染和杀伤能力。
用SINV-EGFP感染BHK-21、Hep3B、Huh-7、HepG2、LX-2和C2C12细胞,观察荧光和细胞病变效应;用MTT法检测48小时后的细胞活力。
验证SINV-GM-CSF在肿瘤细胞中有效复制和表达GM-CSF蛋白。
用SINV-WT和SINV-GM-CSF感染BHK-21和Hep3B细胞,绘制一步生长曲线;通过免疫荧光和Western blot检测GM-CSF表达。
评估SINV-GM-CSF在皮下异种移植瘤模型中的肿瘤抑制效果。
将Hep3B-Luc细胞皮下接种到Nu/Nu裸鼠,分为PBS、SINV-WT、SINV-GM-CSF组,瘤内注射治疗,15天后IVIS成像和H&E染色。
分析治疗后肿瘤组织中免疫细胞组成及巨噬细胞亚型的变化。
对治疗组和对照组的肿瘤组织进行单细胞RNA测序,分析免疫细胞比例和巨噬细胞M1/M2分型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher | 11965092 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher | 10099158 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher | 15140122 | |
| MEM培养基 | Thermo Fisher | 11095080 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668030 |
| 细胞活力检测 | MTT检测试剂盒 | Beyotime | C0009S |
| Western blot | GM-CSF多克隆抗体 | Abcam | ab300495 |
| LDLR抗体 | Proteintech | 66414-1-Ig | |
| LAMR1多克隆抗体 | Proteintech | 67324-1-Ig | |
| GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 动物实验 | D-荧光素钾盐 | Yeasen | 40902ES02 |
| 支原体检测 | MycAwayTM Plus-Color一步法支原体检测试剂盒 | Yeasen | 40612ES25 |
| 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody单细胞分析系统 | BD Biosciences | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外感染与细胞活力 | 细胞系(Hep3B、Huh-7、HepG2)以及MOI=1,感染后48小时检测细胞活力 阅读提示:见Materials and Methods 4.3节,Figure 1图注 |
| 病毒复制和GM-CSF表达 | MOI=0.1和1,感染后观察时间点,一步生长曲线方法 阅读提示:见Materials and Methods 4.2节,Figure 2图注 |
| 体内治疗 | Hep3B-Luc细胞接种数量、小鼠品系(Nu/Nu)、注射剂量(5×10^6 PFU)、给药方式和次数 阅读提示:见Materials and Methods 4.5节,Figure 3图注 |
| 单细胞RNA测序 | 每组小鼠数量(n=3),肿瘤组织混合方法,测序平台和分析参数 阅读提示:见Materials and Methods 4.7节,Figure 4图注 |