AMPK的激活通过PCAF介导的H3K9高乙酰化抑制宫颈癌生长

Activation of AMPK inhibits cervical cancer growth by hyperacetylation of H3K9 through PCAF.

作者信息Botao Pan, Can Liu, Jiyan Su, Chenglai Xia
PMID38831454
发布时间2024-06-03
DOI10.1186/s12964-024-01687-7

实验完整度

体外细胞系实验、体内异种移植模型、乙酰化蛋白质组学、ChIP-seq、Western blot、siRNA敲除等多个独立证据层级,涵盖功能验证与机制验证。

主要模型

HeLa细胞系(HPV18阳性) SiHa细胞系(HPV16阳性) SiHa细胞异种移植裸鼠模型

重点核对

二甲双胍浓度:0-20 mM(体外) 动物分组:Control(Saline)、Cisplatin(2 mg/kg)、Metformin(5 mg/kg)、Metformin(50 mg/kg) 二甲双胍处理时间:48小时(体外检测) si-PCAF转染后加药处理48小时 H3K9ac ChIP-seq使用SiHa细胞,二甲双胍浓度10 mM

摘要

背景:组蛋白乙酰化失调是一种重要的表观遗传改变,与包括癌症在内的重大疾病密切相关,可促进肿瘤发生,使肿瘤抑制基因失活并激活致癌途径。AMP活化蛋白激酶(AMPK)是一种细胞能量感受器,调节许多生物过程。尽管已有许多研究确定了AMPK调控癌症生长的机制,但其潜在的表观遗传机制仍不清楚。方法:通过评估细胞活力、肿瘤异种移植模型、泛乙酰化分析以及AMPK-PCAF-H3K9ac信号通路的作用,评价二甲双胍(一种AMPK激活剂)对宫颈癌的影响。使用无标记定量乙酰化蛋白质组学和染色质免疫沉淀测序(ChIP)技术,进一步研究了AMPK激活诱导的H3K9乙酰化。结果:在本研究中,我们发现二甲双胍作为AMPK激动剂,可激活AMPK,从而在体外和体内抑制宫颈癌的增殖。机制上,AMPK激活在表观遗传水平诱导H3K9乙酰化,导致宫颈癌染色质重塑。这也增强了H3K9ac与多个肿瘤抑制基因启动子区域的结合,从而促进其转录激活。此外,缺乏PCAF使得AMPK激活无法诱导H3K9乙酰化。结论:总之,我们的研究结果表明,AMPK通过PCAF依赖的H3K9乙酰化介导宫颈癌生长的抑制。这一发现不仅促进了二甲双胍的临床应用,也强调了PCAF在AMPK激活诱导的H3K9高乙酰化中的重要作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
AMPK激活是否通过表观遗传机制抑制宫颈癌生长,以及其具体分子机制是什么?
核心机制
AMPK激活通过PCAF依赖性H3K9乙酰化,导致染色质重塑,增强肿瘤抑制基因启动子区域H3K9ac的结合,从而转录激活这些基因,抑制宫颈癌生长。
主要证据
CCK-8实验和异种移植模型显示二甲双胍抑制宫颈癌细胞增殖和肿瘤生长;Western blot和乙酰化蛋白质组学显示AMPK激活诱导H3K9高乙酰化;si-PCAF实验表明PCAF缺失消除了二甲双胍诱导的H3K9高乙酰化;ChIP-seq显示H3K9ac在肿瘤抑制基因启动子区域富集。
研究意义
研究阐明了AMPK-PCAF-H3K9ac轴在宫颈癌发展中的作用,支持二甲双胍抑制肿瘤发生和癌症进展的临床应用。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

评估二甲双胍对宫颈癌细胞增殖的影响

确定二甲双胍是否抑制宫颈癌细胞增殖

使用CCK-8法检测不同浓度二甲双胍(0-20 mM)处理SiHa和HeLa细胞72小时后的细胞活力,并检测PCNA蛋白表达。

2

验证AMPK激活对AMPK/mTOR通路的影响

验证二甲双胍是否通过激活AMPK抑制mTOR通路

Western blot检测二甲双胍处理后AMPK、mTOR及其磷酸化水平,并用AMPK抑制剂dorsomorphin和mTOR激活剂MHY1485进行干预。

3

分析AMPK激活对全蛋白和组蛋白乙酰化的影响

探究AMPK激活是否改变蛋白质赖氨酸乙酰化模式

使用泛抗乙酰化抗体通过Western blot检测二甲双胍处理的SiHa和HeLa细胞全蛋白和组蛋白提取物中赖氨酸乙酰化水平。

4

通过定量乙酰化蛋白质组学鉴定差异乙酰化位点

全面鉴定AMPK激活后蛋白质赖氨酸乙酰化的变化

对二甲双胍处理和无处理的SiHa细胞进行TMT标记、乙酰化肽段富集和LC-MS/MS分析,鉴定差异乙酰化位点。

5

验证AMPK激活诱导H3K9高乙酰化

验证AMPK激活是否特异性地诱导H3K9乙酰化

Western blot检测二甲双胍处理后SiHa和HeLa细胞中H3K9ac水平,并使用dorsomorphin和MHY1485干预AMPK/mTOR通路。

6

确定PCAF在AMPK激活诱导的H3K9高乙酰化中的必要性

确定PCAF是否为AMPK激活诱导H3K9乙酰化所必需

使用siRNA敲低PCAF(si-PCAF)后,检测二甲双胍处理后H3K9ac水平,并验证PCAF表达变化。

7

在体内验证AMPK-PCAF-H3K9ac轴

验证体外结果是否与体内异种移植模型一致

收集异种移植肿瘤组织,Western blot检测AMPK、ACC、mTOR、p70S6K及其磷酸化水平,以及PCAF和H3K9ac表达。

8

全基因组分析H3K9ac靶基因

鉴定AMPK激活后H3K9ac在全基因组的分布和靶基因

使用H3K9ac抗体对二甲双胍处理的SiHa细胞进行ChIP-seq,分析H3K9ac富集区域和靶基因。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
青霉素-链霉素Sigma--
胎牛血清Gibco--
MHY1485MedChemExpress--
二甲基亚砜Sigma-Aldrich--
si-PCAFSangon Biotech--
si-NCSangon Biotech--
Lipofectamine 3000Invitrogen--
CCK-8试剂----
酶标仪BioTek--
RIPA裂解液Beyotime--
组蛋白提取试剂盒EpiGentekOP-0006
BCA法Beyotime--
PVDF膜Millipore--
化学发光成像仪Sagacreation--
增强化学发光液Thermo--
抗AMPKα抗体CST5832
抗ACC抗体CST3676
抗p70S6K抗体CST34475
抗mTOR抗体CST2983
抗磷酸化AMPKα (Thr172)抗体CST2535
抗磷酸化ACC (Ser79)抗体CST3661
抗磷酸化p70S6K (Thr389)抗体CST9234
抗磷酸化mTOR (Ser2448)抗体CST5536
抗PCAF抗体CST3378
抗SIRT2抗体CST12650
抗PCNA抗体CST13110
抗β-actin抗体CST4970
抗β-Tubulin抗体CST2146
抗GAPDH抗体CST5174
抗H3抗体PTM BiolabsPTM-6613
抗乙酰赖氨酸抗体PTM BiolabsPTM-105RM
抗乙酰化H3K9抗体PTM BiolabsPTM-112RM
抗乙酰化H3K56抗体PTM BiolabsPTM-162
抗乙酰化H3K122抗体PTM BiolabsPTM-184
抗乙酰化H2BK12抗体PTM BiolabsPTM-108
抗乙酰化H2BK20抗体PTM BiolabsPTM-155
抗乙酰化H2BK23抗体PTM BiolabsPTM-174
总RNA提取试剂盒FOREGENERE-03014
PrimeScript RT预混液TaKaRa--
SYBR GreenTaKaRa--
二硫苏糖醇----
三乙基碳酸氢铵----
胰蛋白酶----
Phenomenex Strata X C18固相萃取柱Phenomenex--
抗乙酰赖氨酸抗体偶联琼脂糖珠PTM BioPTM-104
C18 ZipTipsMillipore--
EASY-nLC 1000超高效液相色谱系统Thermo--
Q ExactiveTM Plus质谱仪Thermo--
H3K9ac抗体Abcamab32129
NovaSeq 6000 S4试剂盒(300循环)Illumina--
顺铂----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系来源:HeLa (Procell, CL-0101),SiHa (Procell, CL-0210),培养条件:DMEM+10% FBS+1% PS,5% CO2,37°C
阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection
药物处理
二甲双胍浓度(0-20 mM),dorsomorphin浓度(10 µM),MHY1485浓度(10 µM),处理时间48小时
阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection
siRNA敲低
si-PCAF序列(si-PCAF#1和si-PCAF#2),转染试剂Lipofectamine 3000,转染48小时后再药物处理48小时
阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection
细胞增殖检测
细胞接种密度:2500/孔(96孔板),二甲双胍处理72小时,CCK-8法
阅读提示:见Materials and methods, Cell proliferation assays
动物模型
裸鼠品系(BALB/c,雌性,4周龄),注射细胞数(5×10^6),分组及剂量(Control:生理盐水, Cisplatin 2mg/kg, Metformin 5mg/kg, 50mg/kg),给药方式(灌胃)
阅读提示:见Materials and methods, Tumor xenografts
Western blot
裂解液(RIPA),组蛋白提取试剂盒(EpiGentek, OP-0006),抗体及稀释比例(原文未明确说明稀释比例)
阅读提示:见Materials and methods, Western blot analysis
乙酰化蛋白质组学
TMT标记、乙酰化肽段富集(PTM-104抗体)、LC-MS/MS条件(EASY-nLC 1000, Q Exactive Plus)
阅读提示:见Materials and methods, Protein extraction and digestion, TMT labeling, and acetyl peptide enrichment; LC-MS/MS analysis
ChIP-seq
抗体(H3K9ac, ab32129),细胞处理(10 mM metformin),测序平台(Illumina NovaSeq 6000)
阅读提示:见Materials and methods, Chromatin immunoprecipitation-sequencing