评估二甲双胍对宫颈癌细胞增殖的影响
确定二甲双胍是否抑制宫颈癌细胞增殖
使用CCK-8法检测不同浓度二甲双胍(0-20 mM)处理SiHa和HeLa细胞72小时后的细胞活力,并检测PCNA蛋白表达。
Activation of AMPK inhibits cervical cancer growth by hyperacetylation of H3K9 through PCAF.
体外细胞系实验、体内异种移植模型、乙酰化蛋白质组学、ChIP-seq、Western blot、siRNA敲除等多个独立证据层级,涵盖功能验证与机制验证。
HeLa细胞系(HPV18阳性) SiHa细胞系(HPV16阳性) SiHa细胞异种移植裸鼠模型
二甲双胍浓度:0-20 mM(体外) 动物分组:Control(Saline)、Cisplatin(2 mg/kg)、Metformin(5 mg/kg)、Metformin(50 mg/kg) 二甲双胍处理时间:48小时(体外检测) si-PCAF转染后加药处理48小时 H3K9ac ChIP-seq使用SiHa细胞,二甲双胍浓度10 mM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定二甲双胍是否抑制宫颈癌细胞增殖
使用CCK-8法检测不同浓度二甲双胍(0-20 mM)处理SiHa和HeLa细胞72小时后的细胞活力,并检测PCNA蛋白表达。
验证二甲双胍是否通过激活AMPK抑制mTOR通路
Western blot检测二甲双胍处理后AMPK、mTOR及其磷酸化水平,并用AMPK抑制剂dorsomorphin和mTOR激活剂MHY1485进行干预。
探究AMPK激活是否改变蛋白质赖氨酸乙酰化模式
使用泛抗乙酰化抗体通过Western blot检测二甲双胍处理的SiHa和HeLa细胞全蛋白和组蛋白提取物中赖氨酸乙酰化水平。
全面鉴定AMPK激活后蛋白质赖氨酸乙酰化的变化
对二甲双胍处理和无处理的SiHa细胞进行TMT标记、乙酰化肽段富集和LC-MS/MS分析,鉴定差异乙酰化位点。
验证AMPK激活是否特异性地诱导H3K9乙酰化
Western blot检测二甲双胍处理后SiHa和HeLa细胞中H3K9ac水平,并使用dorsomorphin和MHY1485干预AMPK/mTOR通路。
确定PCAF是否为AMPK激活诱导H3K9乙酰化所必需
使用siRNA敲低PCAF(si-PCAF)后,检测二甲双胍处理后H3K9ac水平,并验证PCAF表达变化。
验证体外结果是否与体内异种移植模型一致
收集异种移植肿瘤组织,Western blot检测AMPK、ACC、mTOR、p70S6K及其磷酸化水平,以及PCAF和H3K9ac表达。
鉴定AMPK激活后H3K9ac在全基因组的分布和靶基因
使用H3K9ac抗体对二甲双胍处理的SiHa细胞进行ChIP-seq,分析H3K9ac富集区域和靶基因。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | MHY1485 | MedChemExpress | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | si-PCAF | Sangon Biotech | -- |
| si-NC | Sangon Biotech | -- | |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | -- | -- |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 组蛋白提取 | 组蛋白提取试剂盒 | EpiGentek | OP-0006 |
| 蛋白定量 | BCA法 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 化学发光成像仪 | Sagacreation | -- | |
| 增强化学发光液 | Thermo | -- | |
| 抗AMPKα抗体 | CST | 5832 | |
| 抗ACC抗体 | CST | 3676 | |
| 抗p70S6K抗体 | CST | 34475 | |
| 抗mTOR抗体 | CST | 2983 | |
| 抗磷酸化AMPKα (Thr172)抗体 | CST | 2535 | |
| 抗磷酸化ACC (Ser79)抗体 | CST | 3661 | |
| 抗磷酸化p70S6K (Thr389)抗体 | CST | 9234 | |
| 抗磷酸化mTOR (Ser2448)抗体 | CST | 5536 | |
| 抗PCAF抗体 | CST | 3378 | |
| 抗SIRT2抗体 | CST | 12650 | |
| 抗PCNA抗体 | CST | 13110 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 4970 | |
| 抗β-Tubulin抗体 | CST | 2146 | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| 抗H3抗体 | PTM Biolabs | PTM-6613 | |
| 抗乙酰赖氨酸抗体 | PTM Biolabs | PTM-105RM | |
| 抗乙酰化H3K9抗体 | PTM Biolabs | PTM-112RM | |
| 抗乙酰化H3K56抗体 | PTM Biolabs | PTM-162 | |
| 抗乙酰化H3K122抗体 | PTM Biolabs | PTM-184 | |
| 抗乙酰化H2BK12抗体 | PTM Biolabs | PTM-108 | |
| 抗乙酰化H2BK20抗体 | PTM Biolabs | PTM-155 | |
| 抗乙酰化H2BK23抗体 | PTM Biolabs | PTM-174 | |
| RT-qPCR | 总RNA提取试剂盒 | FOREGENE | RE-03014 |
| PrimeScript RT预混液 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green | TaKaRa | -- | |
| 蛋白质组学 | 二硫苏糖醇 | -- | -- |
| 三乙基碳酸氢铵 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| Phenomenex Strata X C18固相萃取柱 | Phenomenex | -- | |
| 乙酰化肽段富集 | 抗乙酰赖氨酸抗体偶联琼脂糖珠 | PTM Bio | PTM-104 |
| 质谱分析 | C18 ZipTips | Millipore | -- |
| EASY-nLC 1000超高效液相色谱系统 | Thermo | -- | |
| Q ExactiveTM Plus质谱仪 | Thermo | -- | |
| ChIP-seq | H3K9ac抗体 | Abcam | ab32129 |
| NovaSeq 6000 S4试剂盒(300循环) | Illumina | -- | |
| 动物实验 | 顺铂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:HeLa (Procell, CL-0101),SiHa (Procell, CL-0210),培养条件:DMEM+10% FBS+1% PS,5% CO2,37°C 阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection |
| 药物处理 | 二甲双胍浓度(0-20 mM),dorsomorphin浓度(10 µM),MHY1485浓度(10 µM),处理时间48小时 阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection |
| siRNA敲低 | si-PCAF序列(si-PCAF#1和si-PCAF#2),转染试剂Lipofectamine 3000,转染48小时后再药物处理48小时 阅读提示:见Materials and methods, Cell culture, treatment, and transfection |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度:2500/孔(96孔板),二甲双胍处理72小时,CCK-8法 阅读提示:见Materials and methods, Cell proliferation assays |
| 动物模型 | 裸鼠品系(BALB/c,雌性,4周龄),注射细胞数(5×10^6),分组及剂量(Control:生理盐水, Cisplatin 2mg/kg, Metformin 5mg/kg, 50mg/kg),给药方式(灌胃) 阅读提示:见Materials and methods, Tumor xenografts |
| Western blot | 裂解液(RIPA),组蛋白提取试剂盒(EpiGentek, OP-0006),抗体及稀释比例(原文未明确说明稀释比例) 阅读提示:见Materials and methods, Western blot analysis |
| 乙酰化蛋白质组学 | TMT标记、乙酰化肽段富集(PTM-104抗体)、LC-MS/MS条件(EASY-nLC 1000, Q Exactive Plus) 阅读提示:见Materials and methods, Protein extraction and digestion, TMT labeling, and acetyl peptide enrichment; LC-MS/MS analysis |
| ChIP-seq | 抗体(H3K9ac, ab32129),细胞处理(10 mM metformin),测序平台(Illumina NovaSeq 6000) 阅读提示:见Materials and methods, Chromatin immunoprecipitation-sequencing |