建立CDK6敲除细胞系
完全去除CDK6表达,以评估其对宫颈癌细胞生长和代谢的影响。
使用CRISPR/Cas9技术在人宫颈癌细胞系(HeLa、CaSki、SiHa)中敲除CDK6基因,并通过嘌呤霉素筛选和Western blot验证。
CDK6 increases glycolysis and suppresses autophagy by mTORC1-HK2 pathway activation in cervical cancer cells.
包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型以及临床样本免疫组化分析等多个证据层级,并进行功能验证和机制验证。
HeLa宫颈腺癌细胞系 CaSki宫颈癌细胞系(CDK6高表达) SiHa宫颈癌细胞系(CDK6低表达) BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
CDK6敲除效率(Western blot验证) 细胞增殖(CCK8)和克隆形成能力 细胞凋亡率(Annexin V-FITC/PI双染) 糖酵解水平(葡萄糖摄取、乳酸产生、ECAR) mTORC1通路蛋白表达(mTOR、p-S6K、HIF-1α)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
完全去除CDK6表达,以评估其对宫颈癌细胞生长和代谢的影响。
使用CRISPR/Cas9技术在人宫颈癌细胞系(HeLa、CaSki、SiHa)中敲除CDK6基因,并通过嘌呤霉素筛选和Western blot验证。
检测CDK6敲除对宫颈癌细胞增殖、凋亡和自噬的影响。
使用CCK8、克隆形成、流式细胞术检测细胞活力、凋亡和细胞周期,Western blot检测凋亡和自噬相关蛋白。
评估CDK6敲除对糖酵解和生物大分子合成的影响。
测量葡萄糖摄取、乳酸产生和细胞外酸化率(ECAR),并通过Western blot检测糖酵解酶表达,通过拉曼光谱检测单细胞中蛋白质、核苷酸、脂质水平。
验证CDK6敲除诱导的自噬是否具有完整的自噬流。
使用透射电镜观察自噬体,Western blot检测自噬相关蛋白LC3-II和p62,使用mRFP-GFP-LC3慢病毒转染观察自噬流。
评估CDK6敲除对体内肿瘤生长的影响。
将HeLa WT和KO细胞皮下接种于裸鼠,观察肿瘤体积和重量,TUNEL染色检测凋亡,Western blot检测肿瘤组织中相关蛋白表达。
评估CDK6和RUNX1在宫颈癌组织中的表达及其与病理特征的关系。
对14例宫颈癌石蜡包埋组织样本(10例SCC,4例AC)进行CDK6和RUNX1免疫组化染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 基因敲除 | lentiCRISPR v2载体 | Addgene | 52961 |
| 细胞活力检测 | CCK8细胞增殖检测试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | CK04 |
| 细胞周期和凋亡分析 | PI/RNase染色缓冲液 | BD Pharmingen | 550825 |
| 细胞凋亡分析 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | 556547 |
| Western blotting | CDK6抗体 | Cell Signaling Technology | 3136 |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| HK2抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 | |
| LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 12741 | |
| p62/SQSTM1抗体 | Cell Signaling Technology | 5114 | |
| 药物处理 | 巴弗洛霉素A1 | Selleck Chemicals | S1413 |
| 帕博西尼(PD-0332991)盐酸盐 | Selleck Chemicals | S1116 | |
| 免疫荧光 | p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2524 |
| 代谢分析 | 葡萄糖试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A154-2-1 |
| 乳酸测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A019-2-1 | |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103020-100 | |
| 透射电镜 | Eponate 12TM包埋试剂盒 | Ted Pella Inc. | 18010 |
| 拉曼光谱 | WITec共聚焦拉曼成像系统 | WITec | -- |
| UHTS 300光谱仪 | WITec | -- | |
| CCD探测器 | Andor | DU401 | |
| 体内实验 | TUNEL染色试剂盒 | Sigma-Aldrich | 11684817910 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(HeLa、SiHa、CaSki)及培养条件(培养基、血清浓度、CO2浓度、温度) 阅读提示:Methods 2.1 Cell culture, plasmids, and reagents |
| CDK6敲除 | sgRNA序列、转染方法、嘌呤霉素筛选浓度和时间 阅读提示:Methods 2.2 CRISPR/Cas9-mediated knockout of CDK6 gene |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度、培养时间、CCK8试剂盒使用说明 阅读提示:Methods 2.3 Cell viability assay |
| 流式细胞术 | 细胞密度、染色步骤、仪器设置 阅读提示:Methods 2.5 and 2.6 |
| 代谢分析 | 葡萄糖摄取和乳酸产生测量方法、Seahorse分析仪操作步骤及试剂浓度 阅读提示:Methods 2.9 Cellular metabolic analysis |
| 体内实验 | 细胞接种数量、小鼠品系、性别、年龄、观察周期 阅读提示:Methods 2.13 In vivo tumor xenograft experiment |
| 临床样本IHC | 样本来源、组织类型、抗体稀释度、阳性判定标准 阅读提示:Methods 2.15 Clinical tumor specimen collection and immunohistochemical (IHC) staining |