检测miR-522-3p在TAMG组织和血清中的表达
明确miR-522-3p在TAMG中是否异常表达。
通过qRT-PCR检测TAMG患者胸腺瘤组织及相邻正常组织、TAMG血清、非胸腺瘤MG血清及正常血清中miR-522-3p的表达水平。
MiR-522-3p inhibits proliferation and activation by regulating the expression of SLC31A1 in T cells.
包含体外细胞实验、双荧光素酶报告基因验证miR-522-3p靶向SLC31A1,以及功能回复实验。但缺乏动物模型、患者样本机制验证和独立重复,未达到多层级验证。
Jurkat T淋巴细胞系 人CD4+ T细胞 TAMG患者血清及胸腺瘤组织
miR-522-3p在TAMG患者血清和组织中表达下调 miR-522-3p直接靶向SLC31A1的3'UTR miR-522-3p mimic抑制Jurkat细胞活力、增殖、周期和活化 过表达SLC31A1逆转miR-522-3p mimic的抑制效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确miR-522-3p在TAMG中是否异常表达。
通过qRT-PCR检测TAMG患者胸腺瘤组织及相邻正常组织、TAMG血清、非胸腺瘤MG血清及正常血清中miR-522-3p的表达水平。
验证T细胞活化是否影响miR-522-3p表达。
用抗CD3和抗CD28单克隆抗体激活Jurkat细胞和人CD4+ T细胞,通过qRT-PCR检测不同时间点miR-522-3p的表达。
探究miR-522-3p对T细胞增殖、周期和活化的作用。
将miR-522-3p mimic、mimic control、inhibitor和inhibitor control转染Jurkat细胞,48小时后分别用CCK-8、EdU、流式细胞术、qRT-PCR检测细胞活力、增殖、周期分布及CD25、CD69、IL-2、IL-10水平。
寻找miR-522-3p的下游靶基因。
利用miRDB、miRWalk、miRTarBase和TargetScan预测miR-522-3p靶基因,并通过qRT-PCR和双荧光素酶报告实验验证。
验证miR-522-3p是否调控SLC31A1的表达。
转染miR-522-3p mimic和inhibitor后,通过qRT-PCR和Western blot检测Jurkat细胞中SLC31A1的mRNA和蛋白水平。
验证miR-522-3p通过SLC31A1发挥功能。
将SLC31A1过表达质粒或空载体与miR-522-3p mimic或mimic control共转染Jurkat细胞,检测细胞活力、增殖、周期和IL-2、IL-10水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | ATCC | 30-2001 |
| 胎牛血清 | ATCC | 30-2020 | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | PB180120 | |
| Dynabeads™ CD4分选试剂盒 | Thermo Fisher | 11145D | |
| 细胞活化 | 抗CD3抗体 | BD Pharmingen | 555340 |
| 抗CD28抗体 | BD Pharmingen | 560684 | |
| 细胞转染 | miR-522-3p模拟物 | RIBOBIO | miR10002868-1-5 |
| miR-522-3p抑制剂 | RIBOBIO | miR20002868-1-5 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂盒 | Thermo Fisher | 11668027 | |
| 双荧光素酶报告实验 | pmirGLO报告质粒 | Promega | E1330 |
| 荧光素酶检测试剂 | Solarbio | D0010 | |
| 双荧光素酶报告系统 | Promega | E1910 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| 细胞增殖检测 | Cell-Light EdU Apollo567体外检测试剂盒 | RIBOBIO | C10310-1 |
| 多聚赖氨酸溶液 | Sigma-Aldrich | P4832 | |
| 甘氨酸 | Beyotime | ST085M | |
| TritonX-100 | Beyotime | ST797 | |
| Hoechst 33342染料 | -- | -- | |
| 细胞周期检测 | DNA含量定量分析试剂盒 | Solarbio | CA1510 |
| 70%乙醇 | aladdin | E298791 | |
| 流式分析 | 抗CD25抗体 | Cell Signling Technology | 47442 |
| 抗CD69抗体 | Abcam | ab135930 | |
| 正常山羊血清 | Beyotime | C0265 | |
| qRT-PCR | TriQuick总RNA提取试剂 | Solarbio | R1100 |
| RNA逆转录试剂盒 | Tiangen | FP314 | |
| qRT-PCR试剂盒 | Solarbio | SR1110 | |
| Western blot | 蛋白提取裂解液 | Beyotime | P0013E |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0010S | |
| SDS-PAGE凝胶快速制备试剂盒 | Beyotime | P0012AC | |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP33 | |
| TBST缓冲液 | Solarbio | T1081 | |
| 封闭液 | Beyotime | P0023B | |
| ECL Plus工作液 | Solarbio | PE0010 | |
| SLC31A1抗体 | Abcam | ab129067 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 细胞培养 | HERAcell 240i细胞培养箱 | Thermo Fisher | -- |
| 细胞活力检测 | EnVision酶标仪 | PerkinElmer | -- |
| 细胞增殖检测 | N-STORM荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 流式分析 | Gallios流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| qRT-PCR | NanoDrop 2000c微量分光光度计 | Thermo Fisher | -- |
| 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | Bio-Best凝胶成像系统 | SIM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | TAMG患者、无胸腺瘤MG患者、正常志愿者的纳入标准和排除标准;组织及血清样本的保存条件。 阅读提示:Materials and methods 中 Patient tissue and serum specimens 部分 |
| 细胞培养与活化 | 人CD4+ T细胞分离方法(Dynabeads™ CD4 kit);Jurkat细胞系来源(ATCC TIB-152);抗CD3和抗CD28的浓度和处理时间。 阅读提示:Materials and methods 中 Cells isolation, culture and activation 部分 |
| 细胞转染 | miR-522-3p mimic、inhibitor及其对照的序列和浓度;SLC31A1过表达质粒的构建载体(pcDNA3.1);转染试剂Lipofectamine 2000的用量和转染时间。 阅读提示:Materials and methods 中 Cells transfection 部分 |
| 双荧光素酶报告实验 | SLC31A1-3'UTR WT和MUT序列;共转染的质粒和miRNA的比例;荧光素酶检测时间点。 阅读提示:Materials and methods 中 Dual-luciferase reporter assay 部分 |
| 功能检测 | CCK-8检测的细胞密度、培养时间和吸光度读取;EdU检测的细胞密度、EdU浓度和处理时间;细胞周期检测的细胞浓度、固定和染色时间;流式检测CD25和CD69的抗体浓度和孵育时间。 阅读提示:Materials and methods 中 Cell counting kit-8 (CCK-8)、5-Ethynyl-2′-deoxyuridine (EdU) and hoechst staining assays、DNA content quantitation assay、Immunostaining and flow cytometric analysis 部分 |
| qRT-PCR和Western blot | RNA提取和逆转录试剂盒;qRT-PCR引物序列(表1);Western blot抗体信息(表2);蛋白上样量(20μL);内参基因(GAPDH和U6)等。 阅读提示:Materials and methods 中 Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) 和 Western blot 部分 |
| 统计分析 | 数据表示(均值±标准差);组间比较方法(独立样本t检验、配对样本t检验、单因素方差分析);显著性水平(P<0.05)。 阅读提示:Materials and methods 中 Statistical analysis 部分 |