体内和体外Irg-1表达分析
验证Irg-1在SCI组织和LPS刺激的小胶质细胞中的表达变化。
利用GEO数据库数据、qRT-PCR和western blot检测SCI小鼠脊髓组织不同时间点以及LPS刺激的小胶质细胞中Irg-1的mRNA和蛋白水平。
Immune-responsive gene 1/itaconate activates nuclear factor erythroid 2-related factor 2 in microglia to protect against spinal cord injury in mice.
该研究包含体外细胞实验(小胶质细胞、PC12细胞)、体内动物模型(小鼠SCI模型)及机制验证(Nrf2敲低),证据层级多样,功能验证和机制验证明确。
小鼠脊髓损伤模型 BV2小胶质细胞系 PC12神经元细胞系 LPS刺激的小胶质细胞
小鼠脊髓损伤模型的建立方式(重度打击法) Irg-1敲低或过表达慢病毒的注射剂量和途径 4-OI的给药剂量(50 mg/kg)和频率(每2天一次) BV2细胞中LPS刺激的浓度和时间 Si-Nrf2转染效率验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Irg-1在SCI组织和LPS刺激的小胶质细胞中的表达变化。
利用GEO数据库数据、qRT-PCR和western blot检测SCI小鼠脊髓组织不同时间点以及LPS刺激的小胶质细胞中Irg-1的mRNA和蛋白水平。
验证Irg-1的敲低或过表达对LPS诱导的小胶质细胞炎症的影响。
使用慢病毒敲低或过表达Irg-1,用LPS刺激后,通过western blot、qRT-PCR和ELISA检测炎症蛋白和炎症因子水平。
验证Irg-1的过表达是否激活Nrf2通路,以及Nrf2是否介导其抗炎作用。
通过western blot和免疫荧光检测Nrf2的核转位以及HO-1和NQO1的表达;使用siRNA敲低Nrf2后检测炎症指标。
评估Irg-1过表达对SCI小鼠炎症和运动功能恢复的影响。
通过慢病毒鞘内注射过表达Irg-1,进行行为学测试(BMS评分、斜面测试、足迹分析)和组织学染色(HE、Nissl)及免疫荧光检测。
验证衣康酸是否能抑制LPS诱导的小胶质细胞炎症。
使用CCK-8检测4-OI细胞毒性;用不同浓度4-OI处理LPS刺激的小胶质细胞,检测炎症因子及蛋白表达。
验证衣康酸是否促进M2极化并抑制M1极化。
通过免疫荧光、qRT-PCR和western blot检测M1标记物(Iba-1, iNOS, COX2, IL-6)和M2标记物(Arg-1)的表达。
验证衣康酸是否能通过抑制小胶质细胞炎症来保护神经元免受凋亡。
使用条件培养基(CM)和transwell共培养系统,将PC12细胞与处理过的小胶质细胞共培养,检测PC12细胞的凋亡相关蛋白表达和TUNEL染色。
验证衣康酸是否激活Nrf2通路,并依赖Nrf2发挥抗炎作用。
用4-OI处理后检测Nrf2核转位和HO-1、NQO1表达;用siRNA敲低Nrf2后检测炎症指标。
评估4-OI治疗对SCI小鼠炎症、组织损伤和功能恢复的影响。
对SCI小鼠腹腔注射4-OI,进行行为学测试、组织学染色、western blot和免疫荧光检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | #L3129 |
| 4-辛基衣康酸 | MCE | #HY-112675 | |
| 药物溶解 | 二甲基亚砜 | Solarbio | #D8371 |
| Western blot | 抗iNOS抗体 | ProteinTech | 18985-1-AP |
| 抗Bax抗体 | ProteinTech | 50599-2-Ig | |
| 抗Nrf2抗体 | ProteinTech | 16396-1-AP | |
| 抗Lamin B抗体 | ProteinTech | 66095-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | ProteinTech | 60004-1-Ig | |
| 抗IL-6抗体 | ProteinTech | 66146-1-Ig | |
| 抗NQO1抗体 | ProteinTech | 67240-1-Ig | |
| 抗Arg-1抗体 | ProteinTech | 66129-1-Ig | |
| 抗CD68抗体 | ProteinTech | 28058-1-AP | |
| 抗HO-1抗体 | CST | #43966 | |
| 抗COX2抗体 | CST | #12282 | |
| 抗Irg-1抗体 | CST | #17805 | |
| 抗Iba-1抗体 | CST | #17198 | |
| 抗Cleaved Caspase3抗体 | CST | #9661 | |
| Western blot/免疫荧光 | 抗NeuN抗体 | Abcam | ab104224 |
| 抗Bcl2抗体 | Abcam | ab196495 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记二抗 | Abcam | -- |
| Alexa Fluor 594标记二抗 | Abcam | -- | |
| DAPI | Yeasen Biochemical | -- | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Transwell系统 | Corning | 0.4-μm well | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 核蛋白提取 | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0027 |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| ChemiDocXRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Epizyme Biomedical Technology | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| SYBR Master Mix | -- | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 免疫荧光 | 山羊血清 | -- | -- |
| 组织学染色 | 尼氏染色试剂盒 | Solarbio | G1430 |
| TUNEL染色 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Yeasen Biochemical | -- |
| 显微镜观察 | 尼康ECLIPSE Ti显微镜 | Nikon | -- |
| 图像分析 | Image J软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠SCI模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉剂量;打击重量、高度;T9-T10定位 阅读提示:Materials and methods 中的 Mouse spinal cord injury model |
| 慢病毒注射 | 病毒滴度、注射体积、注射时间、注射位点 阅读提示:Materials and methods 中的 Lentiviral intrathecal injection |
| 4-OI给药 | 给药剂量(50 mg/kg)、频率(每2天一次)、给药途径(腹腔注射)、溶剂(DMSO) 阅读提示:Materials and methods 中的 Drug administration |
| BV2细胞培养与刺激 | 细胞来源、培养基成分、培养条件;LPS浓度和时间梯度 阅读提示:Materials and methods 中的 Cell culture and drug administration 和 Figure 1 legend |
| Nrf2敲低 | siRNA序列、转染浓度、转染效率验证 阅读提示:Materials and methods 中的 Lentivirus and siRNA transfection 和 Supplementary Table 3 |
| 行为学评估 | BMS评分、斜面测试、足迹分析的操作细节和数据分析方法 阅读提示:Materials and methods 中的 Behavior assessment |