表达模式分析
分析BMPR1a在乳腺不同发育阶段的表达及相关性
通过免疫荧光、Western blot、qRT-PCR检测BMPR1a在野生型小鼠乳腺和FACS分选的细胞亚群中的表达;用HC11细胞验证激素和Sp1对BMPR1a的调控。
Hormone-Responsive BMP Signaling Expands Myoepithelial Cell Lineages and Prevents Alveolar Precocity in Mammary Gland.
包含体外细胞实验(HC11)、体内条件性敲除小鼠模型、移植实验、RNA-seq及机制验证(ChIP、报告基因)等至少两个独立证据层级。
HC11小鼠乳腺上皮细胞
BMPR1a条件性敲除小鼠(K14-rtTA;teto-Cre;Bmpr1afl/fl)及Dox诱导时间 小鼠妊娠天数(如P14.5)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析BMPR1a在乳腺不同发育阶段的表达及相关性
通过免疫荧光、Western blot、qRT-PCR检测BMPR1a在野生型小鼠乳腺和FACS分选的细胞亚群中的表达;用HC11细胞验证激素和Sp1对BMPR1a的调控。
研究BMPR1a缺失对小鼠乳腺发育和妊娠期肺泡形成的影响
通过Dox诱导BMPR1a条件性敲除(cKO),观察导管伸长、肺泡密度、肺泡腔大小、以及泌乳蛋白表达(β-Casein, WAP等)。
评估BMPR1a缺失对乳腺干细胞数量和再殖能力的影响
FACS分析肌上皮和腔上皮细胞比例;体外移植实验检测乳腺干细胞(Lin-CD24+CD29high)的再殖能力。
验证BMPR1a是否通过pSmad1/5-Smad4调控p63和Slug表达
用HC11细胞进行BMP4/BMP2处理、siRNA敲低、双荧光素酶报告基因和ChIP实验,验证Smad结合p63/Slug启动子并调节其转录。
鉴定BMPR1a下游效应因子(P-cadherin, Spp1)及其在肺泡早熟中的作用
通过Western blot、qRT-PCR检测P-cadherin表达,并分析Spp1的表达及可能的旁分泌机制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰岛素 | Sigma | -- | |
| 表皮生长因子 | Gibco | -- | |
| 细胞处理 | 骨形态发生蛋白4 | Abcam | -- |
| 骨形态发生蛋白2 | PeproTech | -- | |
| β-雌二醇 | Sigma | -- | |
| 孕酮 | Sigma | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine干细胞转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 流式细胞术 | 胶原酶 | Gibco | -- |
| 透明质酸酶 | Sigma | -- | |
| 氯化铵溶液 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | -- | |
| 中性蛋白酶 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | -- | |
| 40 μm过滤器 | BD | -- | |
| CD45-APC抗体 | eBioscience | 17-0451-82 | |
| CD31-APC抗体 | eBioscience | 17-0311-82 | |
| TER119-APC抗体 | eBioscience | 17-5921-82 | |
| CD24-PE-Cy7抗体 | eBioscience | 25-0242-82 | |
| CD29-FITC抗体 | eBioscience | 11-0291-82 | |
| CD61-PE抗体 | BD | 561910 | |
| 可固定活性染料eFluor 450 | eBioscience | 65-0863-14 | |
| 动物实验 | 多西环素 | Sigma | D9891 |
| 组织学与免疫染色 | 伊红 | Sigma | -- |
| SP试剂盒 | ZSGB-Bio | -- | |
| 封闭液 | Beyotime | -- | |
| DAPI染色液 | Beyotime | -- | |
| TUNEL试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 免疫染色 | BMPR1a抗体 | Proteintech | 12702-1-AP |
| Sp1抗体 | Proteintech | 21962-1-AP | |
| K14抗体 | Abcam | ab7800 | |
| K8抗体 | Abcam | ab59400 | |
| pSmad1/5抗体 | CST | 9516 | |
| WAP抗体 | Santa Cruz | sc-374648 | |
| β-酪蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-166530 | |
| Plin2抗体 | Abcam | ab108323 | |
| Stat5抗体 | Abcam | ab68465 | |
| pStat5抗体 | CST | 9359 | |
| Prlr抗体 | Abcam | ab170935 | |
| Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| Cyclin D1抗体 | CST | 55506 | |
| Cleaved caspase3抗体 | CST | 9664 | |
| p63抗体 | Abcam | ab124762 | |
| Slug抗体 | CST | 9585 | |
| Smad4抗体 | CST | 46535 | |
| P-钙黏蛋白抗体 | R&D | AF761 | |
| GFP抗体 | Abcam | ab290 | |
| BMP4抗体 | R&D | MAB5020 | |
| 整合素β3抗体 | CST | 13166 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| HRP标记二抗 | Beyotime | -- | |
| RNA提取与qRT-PCR | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | -- |
| MMLV cDNA合成试剂盒 | Promega | -- | |
| SYBR Green检测系统 | Roche | -- | |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶检测系统 | Promega | -- |
| ChIP | EZ-Magna ChIP G试剂盒 | Millipore | 17-409 |
| Smad1抗体 | Thermo Scientific | 701168 | |
| Smad4抗体 | Abcam | ab40759 | |
| 正常兔IgG | CST | 3900 | |
| RNA-seq | Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- |
| NEBNext UltraTM RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- | |
| 移植实验 | 基质胶 | BD | -- |
| 仪器 | FACS Verse流式细胞仪 | BD | -- |
| FACS Aria流式细胞分选仪 | BD | -- | |
| 徕卡显微镜 | Leica | -- | |
| 解剖显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | HC11细胞培养条件:37°C、5% CO2,RPMI-1640培养基含10% FBS、1%青霉素/链霉素、5 μg/mL胰岛素、10 ng/mL EGF;激素处理:E2(10 nM)和/或Pg(100 nM)处理24小时;BMP4/BMP2处理浓度为50 ng/mL。 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture and Treatment |
| 动物模型 | Bmpr1aflox小鼠来源、K14-rtTA、teto-Cre、Rosa26-mTmG转基因小鼠品系及JAX号;Dox诱导条件:2 mg/mL Dox和10 mg/mL蔗糖加入饮水,持续处理至取样;分析时间点:P14.5等。 阅读提示:Materials and Methods: Mice |
| 流式分析与分选 | 单细胞悬液制备:胶原酶(300 U/mL)和透明质酸酶(100 U/mL)消化2小时,0.25%胰蛋白酶2分钟,5 mg/mL Dispase和0.1 mg/mL DNase I消化5分钟;抗体组合:CD45、CD31、TER119、CD24、CD29、CD61;分选细胞群:Lin-CD24+CD29high(肌上皮)和Lin-CD24+CD29low(腔上皮)。 阅读提示:Materials and Methods: Flow Cytometry and Sorting Assays |
| 移植实验 | 分选基底细胞(Lin-CD24+CD29high)并稀释至2,000细胞/10 μL,与Matrigel 1:1混合后注入清除了脂肪垫的NOD-SCID小鼠乳腺;移植后立即给予Dox,8周后分析。 阅读提示:Materials and Methods: Transplantation Assay |
| 分子机制实验 | 双荧光素酶报告基因实验:Bmpr1a、p63、Slug启动子克隆及突变;ChIP实验:使用Smad1、Smad4抗体,免疫沉淀后qPCR定量结合。 阅读提示:Materials and Methods: Dual Luciferase Activity Assays, Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Assays |