建立POCD大鼠模型及分组处理
模拟老年大鼠术后认知功能障碍,并设置对照及PYPAF1敲低组。
20月龄雄性SD大鼠随机分为Control、异氟醚、异氟醚+shRNA-PYPAF1、异氟醚+shRNA-NC组,进行慢病毒注射和异氟醚暴露。
Effects of PYRIN-containing Apaf1-like protein 1 on isoflurane-induced postoperative cognitive dysfunction in aged rats.
包含体内动物模型(老年大鼠POCD模型)、分子表达检测(RT-qPCR、western blot)、免疫荧光、凋亡检测(TUNEL)及行为学测试,并进行了功能验证(shRNA敲低)和机制验证(炎症小体通路、小胶质细胞活化)。
20月龄雄性Sprague Dawley(SD)大鼠POCD模型 海马组织
异氟醚暴露:2%异氟烷,4小时,气体流速2 l/min 慢病毒注射:5 µl(108 TU/ml)右脑室注射,3天后异氟醚暴露 分组:Control、异氟醚、异氟醚+shRNA-PYPAF1、异氟醚+shRNA-NC 行为学:Morris水迷宫,异氟醚暴露后7天开始,共5天训练,第6天检测 分子检测时间点:第3天和第7天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟老年大鼠术后认知功能障碍,并设置对照及PYPAF1敲低组。
20月龄雄性SD大鼠随机分为Control、异氟醚、异氟醚+shRNA-PYPAF1、异氟醚+shRNA-NC组,进行慢病毒注射和异氟醚暴露。
确认shRNA-PYPAF1能否有效降低海马中PYPAF1的表达。
在慢病毒感染后第3天,通过RT-qPCR和western blot检测海马中PYPAF1的mRNA和蛋白水平,比较shRNA-PYPAF1与shRNA-NC组。
检测异氟醚暴露对空间学习记忆的影响以及PYPAF1敲低是否改善认知功能。
异氟醚暴露后第7天进行Morris水迷宫测试,记录逃避时间、穿台次数和目标象限停留时间。
探究异氟醚暴露是否激活PYPAF1炎症小体,以及PYPAF1敲低的影响。
分别在异氟醚暴露后第3天和第7天,使用RT-qPCR和western blot检测海马中PYPAF1和ASC的表达水平;免疫荧光检测PYPAF1和Iba-1共定位。
评估异氟醚诱导的神经炎症反应及PYPAF1敲低的影响。
使用RT-qPCR和ELISA检测IL-1β和IL-18的mRNA和蛋白水平;使用试剂盒检测caspase-1活性。
评估异氟醚暴露诱导的神经元凋亡及PYPAF1敲低的影响。
使用TUNEL-NeuN双重染色检测海马神经元凋亡;western blot检测凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2和cleaved caspase-3的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲低 | Tet-pLKO-puro载体 | Addgene | 21915 |
| 慢病毒包装 | psPAX2包装质粒 | Addgene | 12260 |
| pMD2.G包膜质粒 | Addgene | 12259 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific | L3000-008 | |
| 质粒构建 | FastDigest AgeI内切酶 | Thermo Fisher Scientific | FD1464 |
| FastDigest EcoRI内切酶 | Thermo Fisher Scientific | FD0274 | |
| T4 DNA连接酶 | Takara Biotechnology | 2011A | |
| 大肠杆菌DH5α感受态细胞 | Takara Biotechnology | 9057 | |
| 质粒提取 | 质粒大提试剂盒 | BioTeke Corporation | DP2802 |
| RT-qPCR | RNA提取纯化试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| 2X Power Taq PCR预混液 | BioTeke Corporation | -- | |
| SYBR-Green荧光染料 | Beijing Solarbio Science & Technology | -- | |
| Exicycler 96实时荧光定量PCR仪 | Bioneer Corporation | -- | |
| 蛋白质提取和定量 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | EMD Millipore; Merck KGaA | -- |
| ECL化学发光试剂 | Beijing Solarbio Science & Technology | -- | |
| PYPAF1抗体 | ABclonal Biotech | A5652 | |
| ASC抗体 | ABclonal Biotech | A1170 | |
| Bcl-2抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology | 12789-1-AP | |
| Bax抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology | 50599-2-lg | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9654 | |
| GAPDH抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology | 60004-1-Ig | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Beijing Solarbio Science & Technology | SE134 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Beijing Solarbio Science & Technology | SE131 | |
| 免疫荧光 | 山羊血清 | Beijing Solarbio Science & Technology | SL038 |
| PYPAF1抗体 | Novus Biologicals | NBP2-12446SS | |
| Iba-1抗体 | Abcam | ab15690 | |
| FITC标记的山羊抗小鼠IgG | Beyotime Institute of Biotechnology | A0568 | |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG | Beyotime Institute of Biotechnology | A0516 | |
| DAPI染色液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 抗荧光淬灭剂 | Beijing Solarbio Science & Technology | -- | |
| TUNEL-NeuN染色 | Triton X-100 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| TUNEL反应液 | Roche Diagnostics | -- | |
| NeuN抗体 | Abcam | ab104224 | |
| Cy3标记的山羊抗小鼠IgG | Beyotime Institute of Biotechnology | A0521 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | MultiSciences (Lianke) Biotech | 70-EK301B/3-96 |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Wuhan USCN Business | SEA064Ra | |
| Caspase-1活性检测 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| caspase-1活性检测试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology | BC3810 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| POCD模型建立 | 动物品系、年龄、性别、体重;异氟醚浓度、暴露时间、气体流速;对照组处理。 阅读提示:Materials and methods: Rat POCD model |
| 慢病毒注射 | 病毒滴度、注射体积、注射部位、注射与异氟醚暴露的时间间隔。 阅读提示:Materials and methods: Rat POCD model |
| 行为学测试 | 水迷宫规格(池直径、平台直径、平台位置);训练次数、天数;测试指标(逃避时间、穿台次数、目标象限停留时间)。 阅读提示:Materials and methods: Morris water maze |
| 分子表达检测 | 检测时间点(第3天、第7天);样本来源;检测方法(RT-qPCR、western blot);引物序列、抗体稀释比。 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR, Western blot analysis; Results 对应图注 |
| 免疫荧光和凋亡检测 | 切片厚度、抗原修复条件、抗体稀释比、TUNEL反应液配比、孵育时间。 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence assay, TUNEL-NeuN staining |
| 炎症因子和caspase-1检测 | ELISA试剂盒、检测时间点、组织处理;caspase-1活性测定波长。 阅读提示:Materials and methods: ELISA, Caspase-1 activity detection |