筛选体外细胞模型
确定最适合研究XTSJ对lncRNA-ATB干预的胃癌细胞系。
分析5种胃癌细胞系中lncRNA-ATB及EMT相关基因和蛋白表达,并检测细胞活力对XTSJ的反应。
Xiaotan Sanjie Decoction Inhibits Gastric Cancer Cell Proliferation, Migration, and Invasion through lncRNA-ATB and miR-200A.
包含体外细胞功能实验、分子机制验证及体内移植瘤模型,多层级证据支持结论。
HGC-27胃癌细胞系 HGC-27皮下移植瘤裸鼠模型
细胞系选择:HGC-27被选为体外模型,基于lncRNA-ATB高表达和IC50最低(0.1354 mg/ml) XTSJ给药浓度:0、0.05、0.1、0.15、0.2、0.3 mg/ml(体外) 体内给药剂量:XTSJ低剂量1 g/kg、高剂量2 g/kg(灌胃),5-FU 30 mg/kg(腹腔注射) qRT-PCR内参:GAPDH(mRNA)和U6(miRNA),Western blot内参:β-actin 统计学差异阈值:P < 0.05, P < 0.01, P < 0.001
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定最适合研究XTSJ对lncRNA-ATB干预的胃癌细胞系。
分析5种胃癌细胞系中lncRNA-ATB及EMT相关基因和蛋白表达,并检测细胞活力对XTSJ的反应。
验证XTSJ是否抑制HGC-27细胞增殖并促进凋亡。
使用CCK8、EdU和流式细胞术检测不同浓度XTSJ处理后的细胞活力和凋亡率。
验证XTSJ是否抑制HGC-27细胞的迁移和侵袭能力。
使用Transwell和划痕实验检测不同浓度XTSJ处理后的细胞迁移和侵袭能力。
探究XTSJ对lncRNA-ATB及EMT和Bcl-2信号通路相关分子表达的影响。
使用qRT-PCR和Western blot检测XTSJ处理后HGC-27细胞中相关基因和蛋白的表达。
验证XTSJ在体内对胃癌移植瘤的抑制效果及对EMT信号通路的影响。
建立HGC-27细胞皮下移植瘤裸鼠模型,给予XTSJ或5-FU治疗,评估肿瘤生长及分子标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | ExCell bio | -- | |
| 药物处理 | 消痰散结方 | -- | -- |
| 5-氟尿嘧啶 | Lilly France | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8溶液 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | EdU | -- | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-异硫氰酸荧光素 | Procell | -- |
| 碘化丙啶 | Procell | -- | |
| 蛋白质提取 | 细胞裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Sangon Biotech | -- |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Bio-Rad | -- |
| E-cadherin抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| Vimentin抗体 | Proteintech | 60330-1-lg | |
| N-cadherin抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| ZEB-1抗体 | Proteintech | 21544-1-AP | |
| Bcl-2抗体 | Proteintech | 26593-1-AP | |
| Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| Caspase 3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| Caspase 9抗体 | Proteintech | 10380-1-AP | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-lg | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗小鼠IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗兔IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| 逆转录 | 逆转录第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | LightCycler 480实时荧光定量PCR系统 | Roche | -- |
| 细胞增殖检测 | Hoechst33342染料 | -- | -- |
| 细胞成像 | 奥林巴斯TH4-200荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 细胞凋亡检测 | BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞活力检测 | SpectraMax i3酶标仪 | Molecular Devices | -- |
| 细胞成像 | 徕卡DMi1倒置显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 胃癌细胞系来源、培养基和血清品牌 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture |
| 药物制备 | XTSJ来源、5-FU来源 阅读提示:Methods 2.2 Preparation of Drugs |
| 细胞增殖和凋亡检测 | 细胞接种密度、XTSJ浓度、处理时间、检测方法 阅读提示:Methods 2.3, 2.4, 2.5 |
| 迁移和侵袭检测 | 细胞接种密度、XTSJ浓度、Matrigel使用、处理时间 阅读提示:Methods 2.6, 2.7 |
| 分子表达检测 | 引物序列、抗体货号、内参基因 阅读提示:Methods 2.8, 2.9, Table 1 |
| 体内实验 | 动物品系、细胞接种量、给药剂量和途径、实验时长 阅读提示:Methods 2.10 In Vivo Experiment |