CAFs-EVs的提取和鉴定
验证从CAFs中成功分离出细胞外囊泡。
培养CAFs 2-3天,通过差速离心提取EVs;使用透射电子显微镜观察形态,BCA蛋白定量检测浓度,Western blot检测EVs标志物TSG101、CD63、CD9。
Cancer-associated fibroblast-released extracellular vesicles carrying miR-199a-5p induces the progression of gastric cancer through regulation of FKBP5-mediated AKT1/mTORC1 signaling pathway.
包含体外细胞实验、共培养、双荧光素酶报告、Western blot、Co-IP、体内异种移植瘤模型及免疫组化等多个独立证据层级,并有功能验证和机制验证。
AGS细胞 胃癌细胞系HGC-27、NCI-N87、SNU-5 CAFs来源的细胞外囊泡 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
细胞类型:AGS细胞,购自上海科学院细胞库(TCHu232) CAFs-EVs分离:差速离心法,浓度通过BCA蛋白测定 药物处理:MK-2206(10 μM,AKT1磷酸化抑制剂),temsirolimus(15 μM,mTORC1抑制剂) 体内模型:BALB/c裸鼠,皮下注射AGS细胞,尾静脉注射CAFs-EVs(25 μg)或其处理,每5天测量肿瘤大小,30天后取材 统计分析:使用SPSS 21.0,组间比较采用t检验或ANOVA,p<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证从CAFs中成功分离出细胞外囊泡。
培养CAFs 2-3天,通过差速离心提取EVs;使用透射电子显微镜观察形态,BCA蛋白定量检测浓度,Western blot检测EVs标志物TSG101、CD63、CD9。
检测CAFs-EVs能否将miR-199a-5p转移至胃癌细胞。
将CAFs-EVs与胃癌细胞系共培养,RT-qPCR检测miR-199a-5p表达;使用Cy3标记miR-199a-5p mimic和CD63标记EVs共定位。
验证miR-199a-5p对胃癌细胞恶性表型的影响。
用miR-199a-5p mimic或inhibitor处理AGS细胞,或与CAFs-EVs共培养,检测细胞增殖(EdU)、迁移和侵袭(Transwell)、血管生成(微管形成实验)。
验证miR-199a-5p是否通过靶向FKBP5调节AKT1磷酸化及mTORC1激活。
生物信息学预测结合位点;双荧光素酶报告基因验证靶向关系;Western blot检测FKBP5、AKT1、p-AKT1、mTOR、p-mTOR的表达;Co-IP验证FKBP5与AKT1的结合。
验证CAFs-EVs携带miR-199a-5p在体内促进胃癌生长的作用。
将AGS细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,每周一次共三次,然后尾静脉注射不同处理的CAFs-EVs(未处理、含inhibitor NC、含miR-199a-5p inhibitor),或同时注射经oe-NC或oe-FKBP5转染的AGS细胞和未处理CAFs-EVs。监测肿瘤大小,30天后取材,检测肿瘤重量、体积、Ki-67、MVD、miR-199a-5p表达及FKBP5、p-AKT1、p-mTOR水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| EVs提取 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胰蛋白酶 | Invitrogen | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| 药物处理 | MK-2206 | MCE | HY-108232 |
| 坦西莫司 | MCE | HY-50910 | |
| RNA提取与RT-qPCR | PureLink RNA小提试剂盒 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | Mir-X miRNA第一链合成试剂盒 | Clontech | -- |
| TB Green预混Ex Taq II | Takara | -- | |
| LightCycler 480荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| Bio-Rad S1000热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | TSG101抗体 | Abcam | ab125011 |
| CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| CD63抗体 | Abcam | ab217345 | |
| AKT1抗体 | CST | 4685 | |
| 磷酸化AKT1 (Ser473)抗体 | CST | 4060 | |
| FKBP5抗体 | Abcam | ab126715 | |
| mTOR抗体 | CST | 2983 | |
| 磷酸化mTOR (Ser2448)抗体 | CST | 5536 | |
| 磷酸化mTOR (Ser2481)抗体 | CST | 2974 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab128915 | |
| HRP标记的二抗 | CST | 7074 | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G琼脂糖磁珠 | Santa Cruz | sc-2003 |
| RIPA裂解液 | Beyotime | P0013D | |
| FKBP5抗体(用于Co-IP) | CST | 12210 | |
| IgG抗体 | Abcam | ab197767 | |
| EdU染色 | Apollo 567荧光染料 | -- | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 微管形成实验 | 基质胶基质 | BD Biosciences | -- |
| 人脐静脉内皮细胞 | ATCC | CRL-4053 | |
| EGM-2培养基 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 核糖核酸酶A | Takara | -- |
| 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
| 免疫组化 | Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 |
| FKBP5抗体 | Abcam | ab126715 | |
| 免疫组化(MVD) | CD34抗体 | Abcam | ab81289 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAFs-EVs提取 | CAFs来源、培养时间、差速离心参数、BCA定量方法 阅读提示:Materials and methods: Extraction of CAFs-EVs |
| 细胞培养与转染 | 细胞系、培养基、转染试剂、质粒序列、药物浓度及处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 体外功能实验 | EdU、Transwell、微管形成实验的具体操作、细胞数量、孵育时间 阅读提示:Materials and methods: EdU staining, Transwell assay, Microvessel formation experiment |
| 机制验证 | miR-199a-5p与FKBP5的靶向关系、FKBP5与AKT1的结合、蛋白抗体及稀释比例 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, Luciferase assay; Results 和 Figure legends |
| 体内动物模型 | 动物品系、周龄、体重、细胞注射数量、EVs剂量、给药途径、时间点、肿瘤测量方法 阅读提示:Materials and methods: Establishment of gastric cancer xenograft tumor model; Figure legends |
| 统计分析 | 统计软件、检验方法、重复次数、显著性水平 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |