验证DAC诱导NY-ESO-1表达
检测DAC处理对AML细胞系和原代AML样本中NY-ESO-1表达的影响。
用不同浓度(100-1000 nM)的DAC处理U937、HL60、Kasumi-1、THP-1细胞系72小时,以及原代AML母细胞,通过RT-PCR和Western blot检测NY-ESO-1 mRNA和蛋白水平,并通过亚硫酸盐测序分析启动子甲基化状态。
Decitabine enhances targeting of AML cells by NY-ESO-1-specific TCR-T cells and promotes the maintenance of effector function and the memory phenotype.
包含体外细胞系和原代AML样本实验、体内异种移植模型验证,以及功能验证和机制验证(如MHC依赖性、表型分析)。
U937-A2+细胞系 HL60-A2+细胞系 Kasumi-1-A2+细胞系 AML异种移植NCG小鼠模型
DAC浓度及处理时间(200 nM, 72小时) TCR-T细胞类型(高亲和力1G4 TCR vs 野生型) 效靶比(1:10等)及共培养时间(20小时) MHC I类抗体阻断(W6/32) 小鼠模型中DAC给药剂量(1.0 mg/kg)及T细胞注射量(1.0×10^7)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测DAC处理对AML细胞系和原代AML样本中NY-ESO-1表达的影响。
用不同浓度(100-1000 nM)的DAC处理U937、HL60、Kasumi-1、THP-1细胞系72小时,以及原代AML母细胞,通过RT-PCR和Western blot检测NY-ESO-1 mRNA和蛋白水平,并通过亚硫酸盐测序分析启动子甲基化状态。
评估NY-ESO-1特异性TCR-T细胞对DAC处理的AML细胞系的识别和杀伤能力。
将高亲和力(ha)或野生型(wt)TCR-T细胞与DAC处理或未处理的U937-A2+、HL60-A2+、Kasumi-1-A2+、THP-1-A2+细胞共培养,通过ELISpot检测IFN-γ分泌,ELISA检测TNF-α,LDH释放实验检测细胞毒性。
确认TCR-T细胞的抗白血病活性是否依赖于MHC I类分子。
将DAC处理的靶细胞与抗MHC I类抗体(W6/32)或同型对照(IgG2a)孵育后,与TCR-T细胞共培养,检测TNF-α分泌。
验证TCR-T细胞对DAC治疗的患者来源的原代AML母细胞的识别和杀伤。
将NY-ESO-1特异性供体来源的TCR-T细胞与来自4例患者的原代AML母细胞共培养,通过IFN-γ ELISpot检测反应。
确定转导期间CDAC处理是否能增强TCR-T细胞的抗白血病功效和记忆表型。
在TCR转导期间用低剂量DAC(10-50 nM)处理T细胞,生成dTCR-T细胞,然后评估其增殖、活力、细胞因子分泌、细胞毒性以及记忆表型(CD45RO+CD62L+和CD45RO+CCR7+)。
评估DAC联合TCR-T或dTCR-T细胞在AML异种移植小鼠模型中的抗肿瘤效果。
将U937-A2-luciferase+细胞皮下接种至NCG小鼠,分为8组,分别给予PBS、NT-T、TCR-T、dTCR-T、DAC单独或联合治疗,监测肿瘤生长、生物发光成像和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 最低必需培养基 | Gibco Life Technologies | -- | |
| DMEM-F12培养基 | Procell | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 药物处理 | 5-氮杂-2'-脱氧胞苷(地西他滨) | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | TransScript All-in-One第一链cDNA合成SuperMix试剂盒 | Transgen | -- |
| PerfectStart SYBR Green qPCR SuperMix试剂盒 | Transgen | -- | |
| 7500型实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| Immobilon转印硝酸纤维素膜 | Millipore | -- | |
| 抗人NY-ESO-1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗DNMT3a抗体 | Abcam | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 化学发光HRP底物试剂盒 | Millipore | -- | |
| ChemiDoc XRS+系统 | Bio-Rad | -- | |
| DNA甲基化分析 | Wizard基因组DNA纯化试剂盒 | Promega | A1120 |
| EZ DNA甲基化试剂盒 | Zymo Research | D5001 | |
| pGM-T载体 | TianGen | VT202-01 | |
| ABI PRISM 3730 DNA分析仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | CytoExpert软件 | Beckman Coulter | -- |
| FlowJo软件 | FlowJo LLC | -- | |
| TCR-T细胞制备 | pCDH慢病毒载体 | -- | -- |
| 50 kDa离心过滤器 | Merck kGaA | -- | |
| T细胞激活 | 人T细胞活化CD3磁珠/CD28单克隆抗体微珠 | Life Technologies | 11161D |
| T细胞培养 | X-VIVO 15培养基 | Lonza | -- |
| 白细胞介素-2 | PeproTech Inc. | -- | |
| 流式细胞术 | 抗人CD8抗体(克隆RPA-T8) | BioLegend | -- |
| 抗人CD3抗体(克隆HIT3a) | BioLegend | -- | |
| 抗人TCR vβ13.1抗体(克隆H131) | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠TCR β链抗体(克隆H57-597) | BioLegend | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | BioGems | -- |
| Multiskan FC酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ELISpot | IFN-γ ELISpot试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| AEC底物试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| BIOsys ELISpot读板仪 | -- | -- | |
| LDH实验 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | -- |
| 动物实验 | NCG小鼠 | GemPharmatech Co., Ltd. | -- |
| IVIS Lumina III小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0软件 | GraphPad Software, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DAC处理 | DAC浓度、处理时间(72小时、10天)、细胞系类型 阅读提示:Materials and methods - Decitabine treatment;图1图注 |
| TCR-T细胞制备 | TCR类型(高亲和力1G4 TCR vs 野生型)、MOI=5、转导时间、DAC预处理剂量和时长 阅读提示:Methods - Generation of TCR-T cells;图4图注 |
| 体外杀伤实验 | 效靶比、共培养时间、靶细胞DAC处理与否、抗体阻断条件 阅读提示:Materials and methods - ELISpot、ELISA、LDH assay;图2图注 |
| 动物模型 | 小鼠品系、细胞接种量、DAC剂量和途径、T细胞注射量和时间、分组和样本量 阅读提示:Methods - Mouse xenograft models;图6图注 |