细胞活力检测
评估8-MF对多种癌细胞系的细胞毒性,并确定其对CRC细胞的抑制作用。
使用CCK-8法检测6种癌细胞系(A549、CA922、HepG2、MCF7、MG63、RKO)在8-MF处理后的活力,随后在不同浓度(0-200 μM)下检测LoVo和RKO的活力,以5-Fu为阳性对照。
8-Methoxyflindersine-Induced Apoptosis and Cell Cycle Disorder Involving MAPK Signaling Activation in Human Colorectal Cancer Cells.
包含体外细胞活力、凋亡、周期分析及western blot验证,并使用STRING和分子对接进行机制预测,但缺少体内实验。
结直肠癌细胞系LoVo 结直肠癌细胞系RKO 其他癌细胞系(A549、CA922、HepG2、MCF7、MG63)用于筛选
8-MF处理浓度:0、50、100、150、200 μM 处理时间:24 h和48 h 细胞系:LoVo和RKO 阳性对照:5-Fu(200 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估8-MF对多种癌细胞系的细胞毒性,并确定其对CRC细胞的抑制作用。
使用CCK-8法检测6种癌细胞系(A549、CA922、HepG2、MCF7、MG63、RKO)在8-MF处理后的活力,随后在不同浓度(0-200 μM)下检测LoVo和RKO的活力,以5-Fu为阳性对照。
验证8-MF是否诱导CRC细胞凋亡。
使用Annexin V-FITC/PI染色和流式细胞术检测凋亡细胞比例,并用DAPI染色观察细胞核形态。
检测8-MF对CRC细胞周期分布的影响。
使用PI染色和流式细胞术分析细胞周期分布,并通过RT-qPCR和western blot检测细胞周期蛋白(CCNA、CCNB、CCND、CCNE)的表达。
探究8-MF是否影响MAPK信号通路。
通过western blot检测p38、ERK1/2及其磷酸化水平的表达变化。
预测8-MF与细胞周期蛋白和MAPK蛋白的相互作用。
使用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,并使用AutoDock 4.2.6进行分子对接预测8-MF与p38和ERK的结合模式。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 8-甲氧基弗林辛 | -- | 35989-00-5 |
| 5-氟尿嘧啶 | Beyotime | ST1060 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Meilunbio | MA0218 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | KeyGEN | KGM31800N-500 |
| DMEM/高糖培养基 | Thermo Fisher | C11995500BT | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1A | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Meilunbio | MA0110 | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡试剂盒 | Thermo Fisher | BMS500FI-300 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期与凋亡分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| 核染色 | DAPI | Thermo Fisher | D1360 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | TaKaRa | T9300A |
| Western blot | ECL Prime蛋白质印迹检测试剂 | GE Healthcare | RPN2236 |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | TaKaRa | 9108 |
| RT-qPCR | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher | K1622 |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Thermo Fisher | A25778 | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig |
| 抗CCNA抗体 | Proteintech | 18202-1-AP | |
| 抗CCNB抗体 | Proteintech | 28603-1-AP | |
| 抗CCND抗体 | Proteintech | 60186-1-Ig | |
| 抗CCNE抗体 | Proteintech | 11554-1-AP | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690S | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511S | |
| 抗ERK1/2 (p44/42)抗体 | Cell Signaling Technology | 4595S | |
| 抗磷酸化ERK1/2 (p44/42)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370S | |
| 微孔板读数 | iMark酶标仪 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 显微镜观察 | 倒置相差显微镜 | Olympus | CKX41 |
| 荧光显微镜 | 倒置荧光显微镜 | ZEISS | Observer A1 |
| 流式细胞术 | Fortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 实时荧光定量PCR | ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 化学发光成像 | Tanon-5200化学发光成像系统 | Tanon | -- |
| 引物合成 | 引物 | GenScript | -- |
| 分子对接 | AutoDock 4.2.6 | Scripps Research | -- |
| 分子建模 | Chem3D 17.1 | PerkinElmer | -- |
| 分子可视化 | PyMOL 2.5.4 | Schrödinger | -- |
| 图像分析 | ImageJ | NIH | 1.52a |
| 蛋白质互作分析 | STRING数据库 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞系、8-MF浓度、处理时间、阳性对照、细胞接种密度、检测波长 阅读提示:Materials and Methods 4.3 Cell Viability Assay |
| 细胞凋亡检测 | 细胞系、8-MF浓度、处理时间、染色试剂盒、孵育时间、流式细胞仪 阅读提示:Materials and Methods 4.5 Annexin V-FITC/PI Apoptosis Assay |
| 细胞周期分析 | 细胞系、8-MF浓度、处理时间、固定条件、RNase和PI孵育时间、流式细胞仪 阅读提示:Materials and Methods 4.6 Cell Cycle Analysis |
| RT-qPCR | 引物序列、内参基因、RNA提取方法、反转录试剂盒、SYBR Green预混液、PCR仪器、数据分析方法 阅读提示:Materials and Methods 4.7 Real-Time PCR 和 Table 2 |
| Western blot | 抗体信息、蛋白提取方法、封闭条件、一抗和二抗孵育条件、显影试剂、成像系统 阅读提示:Materials and Methods 4.8 Western Blotting |
| 分子对接 | 蛋白质结构文件、软件版本、对接参数、结合能阈值 阅读提示:Materials and Methods 4.9 Protein–Protein Interaction and Molecular Docking |